Nhận diện Neoscytalidium dimidiatum gây bệnh đốm nâu trên thanh long

• Tác giả: Dang Thi Ngoc Thuy
• Người hướng dẫn: Dr. Huynh Van Biet
• Trường học: Nong Lam University
• Chuyên ngành: Biotechnology
• Đề tài: Nhận diện Neoscytalidium dimidiatum gây bệnh đốm nâu trên thanh long qua đặc điểm hình thái và sinh học phân tử
• Loại tài liệu: Undergraduate Thesis
• Năm xuất bản: 2023
• Địa điểm: Thu Duc City

• ACKNOWLEDGEMENT
• CONFIRMATION AND ASSURANCE
• 1. CHAPTER 1: Background
• 1.1. Objective of the study
• 1.2. Contents of the study
• 1.3. Origin and taxonomy
• 1.4. Botanical characteristics
• 1.5. Nutritional value
• 1.6. Production and consumption of dragon fruit in Vietnam
• 1.7. Pests and diseases
• 1.8. Brown spot disease on dragon fruit
• 1.9. Taxonomy
• 1.10. Morphological characteristics
• 2. CHAPTER 2
• 2.1. Origin and taxonomy
• 2.2. Production and consumption of dragon fruit in Vietnam
• 2.3. Brown spot disease on dragon fruit
• 2.4. Hosts of Neoscytalidium dimidiatum
• 2.5. Some studies on identification of Neoscytalidium dimidiatum on dragon fruit by ITS and LSU rDNA regions
• 3. MATERIALS AND METHODS
• 3.1. Time and place
• 3.2. Samples collection and tissue staining
• 3.3. Preparation of culture medium
• 3.4. Pathogen isolation
• 3.5. Identify fungal isolates using morphology
• 3.6. Identify fungal isolates using molecular methods
• 3.7. DNA quantification by electrophoresis
• 3.8. PCR
• 3.9. DNA sequencing and analysis
• 4. RESULTS AND DISCUSSION
• 4.1. Samples collection and tissue staining
• 4.2. Identify morphology of fungal isolates
• 4.3. Identify molecular of fungal isolates
• 5. CONCLUSION AND SUGGESTION
• REFERENCES
• LIST OF ACRONYMS
• LIST OF TABLES
• LIST OF FIGURES

I. Tổng quan về Neoscytalidium dimidiatum và bệnh đốm nâu trên thanh long

Neoscytalidium dimidiatum là một loại nấm gây bệnh đốm nâu trên thanh long, một trong những loại cây trồng quan trọng tại Việt Nam. Bệnh này không chỉ ảnh hưởng đến năng suất mà còn làm giảm giá trị thương mại của sản phẩm. Việc nhận diện chính xác loại nấm này là rất cần thiết để có biện pháp phòng ngừa hiệu quả.

1.1. Đặc điểm hình thái của Neoscytalidium dimidiatum

Nấm Neoscytalidium dimidiatum có hình thái đặc trưng với màu sắc từ trắng xám đến đen. Sự phát triển nhanh chóng của nấm trên môi trường nuôi cấy giúp dễ dàng nhận diện.

1.2. Tác động của bệnh đốm nâu đến thanh long

Bệnh đốm nâu gây ra những vết nâu trên thân và trái thanh long, làm giảm chất lượng và năng suất. Điều này ảnh hưởng nghiêm trọng đến thu nhập của nông dân.

II. Vấn đề và thách thức trong việc nhận diện Neoscytalidium dimidiatum

Việc nhận diện Neoscytalidium dimidiatum gặp nhiều khó khăn do sự tương đồng với các loại nấm khác. Thách thức lớn nhất là thiếu thông tin về các gene khác ngoài ITS, điều này làm hạn chế khả năng phân tích gen và xác định chính xác loại nấm.

2.1. Khó khăn trong việc phân tích hình thái

Phân tích hình thái có thể bị nhầm lẫn với các loại nấm khác, do đó cần có các phương pháp bổ sung để xác định chính xác.

2.2. Thiếu dữ liệu gen cho Neoscytalidium dimidiatum

Hiện tại, dữ liệu gen cho Neoscytalidium dimidiatum chủ yếu tập trung vào vùng ITS, trong khi các vùng gen khác như LSU chưa được nghiên cứu đầy đủ.

III. Phương pháp nhận diện Neoscytalidium dimidiatum qua hình thái và sinh học phân tử

Phương pháp nhận diện bao gồm việc quan sát hình thái nấm và phân tích gen bằng kỹ thuật sinh học phân tử. Sử dụng các mồi PCR như ITS5/ITS4 và LROR/LRS giúp xác định chính xác loại nấm gây bệnh.

3.1. Quan sát hình thái nấm

Quan sát hình thái nấm trên môi trường nuôi cấy giúp nhận diện nhanh chóng và hiệu quả. Các đặc điểm như màu sắc, hình dạng và tốc độ phát triển là những yếu tố quan trọng.

3.2. Phân tích gen bằng kỹ thuật PCR

Kỹ thuật PCR cho phép khuếch đại các vùng gen ITS và LSU, từ đó so sánh với dữ liệu trên GenBank để xác định chính xác Neoscytalidium dimidiatum.

IV. Kết quả nghiên cứu về Neoscytalidium dimidiatum trên thanh long

Nghiên cứu cho thấy 15 mẫu nấm thu thập từ các tỉnh Long An, Tiền Giang và Bình Thuận đều có sự tương đồng cao với Neoscytalidium dimidiatum. Phân tích gen cho thấy sự tương đồng lên đến 99,77% với vùng ITS và 100% với vùng LSU.

4.1. Tương đồng gen giữa các mẫu nấm

Các mẫu nấm đều cho thấy sự tương đồng cao về gen, cho thấy chúng có nguồn gốc gần gũi và có thể là một chủng nấm duy nhất gây bệnh.

4.2. Ứng dụng kết quả nghiên cứu vào thực tiễn

Kết quả nghiên cứu có thể được áp dụng để phát triển các biện pháp phòng ngừa và điều trị bệnh đốm nâu trên thanh long, từ đó nâng cao năng suất và chất lượng sản phẩm.

V. Kết luận và triển vọng nghiên cứu về Neoscytalidium dimidiatum

Việc nhận diện Neoscytalidium dimidiatum là rất quan trọng trong việc quản lý bệnh đốm nâu trên thanh long. Nghiên cứu này mở ra hướng đi mới cho các nghiên cứu tiếp theo về nấm gây bệnh trên cây trồng.

5.1. Tầm quan trọng của việc nhận diện chính xác

Nhận diện chính xác Neoscytalidium dimidiatum giúp nông dân có biện pháp phòng ngừa kịp thời, từ đó bảo vệ mùa màng và tăng thu nhập.

5.2. Hướng nghiên cứu trong tương lai

Cần tiếp tục nghiên cứu các vùng gen khác của Neoscytalidium dimidiatum để có cái nhìn toàn diện hơn về đặc điểm sinh học và khả năng gây bệnh của nấm.