Phát hiện Salmonella enterica subsp. enterica và Salmonella enterica serovar Enteritidis trong nhà yến bằng kỹ thuật Multiplex PCR

• Tác giả: Do Thi Trinh
• Người hướng dẫn: Dr. Dinh Xuan Phat
• Trường học: Nong Lam University
• Chuyên ngành: Biotechnology
• Đề tài: Phát hiện Salmonella enterica subsp. enterica và Salmonella enterica serovar Enteritidis trong nhà yến bằng kỹ thuật Multiplex PCR
• Loại tài liệu: Graduation Thesis
• Năm xuất bản: 2018 - 2022
• Địa điểm: Thu Duc City

Mục lục chi tiết

• ACKNOWLEDGMENTS
• CONFIRMATION COMMITMENT
• ABSTRACT
• TÓM TẮT
• 1. CHƯƠNG 1: INTRODUCTION
• 1.1. Objectives
• 1.2. Salmonella as pathogen
• 2. CHƯƠNG 2: REVIEW
• 2.1. Classification and nomenclature
• 2.2. Virulence genes sipB and fliC of the Salmonella. Clinical signs and macroscopic lesions
• 2.3. Treatment and prevention of the disease
• 2.4. Laboratory diagnostic methods. Polymerase Chain Reaction - PCR
• 2.5. Other diagnostic methods
• 3. CHƯƠNG 3: MATERIALS AND METHODS
• 3.1. Materials, equipment, and instruments
• 3.2. DNA extraction from field samples and recovery of DNA target
• 3.3. Primers used and thermal cycles for the research
• 3.4. Optimization of the mPCR protocol
• 3.4.1. Optimization of the annealing temperature for s-PCR reaction
• 3.4.2. Optimization of the annealing temperature for mPCR reaction
• 3.4.3. Optimization of the primer concentration for mPCR reaction
• 3.5. Evaluation of primer specificity in mPCR reaction
• 3.6. Determination of the detection limit for m-PCR reaction
• 3.7. Determination of the presence of virulence genes sipB and fliC
• 4. CHƯƠNG 4: RESULTS AND DISCUSSION
• 4.1. Optimization of the annealing temperature for mPCR reaction
• 4.2. Optimization of the primer concentration for mPCR reaction
• 4.3. Examination of primer specificity in mPCR reaction
• 4.4. Determination of the detection limit for mPCR reaction
• 4.5. Result of detection of Salmonella
• 4.6. Investigating the presence of virulence genes sipB and fliC
• 4.7. Result of the detection limit for mPCR reaction
• 4.8. Results of detection of Salmonella
• 4.9. Results of investigating the presence of virulence genes sipB and fliC
• CONCLUSION AND RECOMMENDATIONS
• REFERENCE
• APPENDIX
• LIST OF ABBREVIATIONS
• LIST OF TABLES
• LIST OF FIGURES

Tóm tắt

I. Tổng quan về phát hiện Salmonella enterica trong nhà yến

Phát hiện Salmonella enterica trong nhà yến là một vấn đề quan trọng trong ngành chăn nuôi và an toàn thực phẩm. Salmonella là một trong những tác nhân gây bệnh phổ biến nhất, ảnh hưởng đến sức khỏe của cả gia cầm và con người. Việc phát hiện sớm và chính xác Salmonella enterica giúp ngăn ngừa sự lây lan của bệnh tật và bảo vệ sức khỏe cộng đồng.

1.1. Tầm quan trọng của việc phát hiện Salmonella enterica

Việc phát hiện Salmonella enterica giúp giảm thiểu rủi ro cho sức khỏe con người và gia cầm. Nghiên cứu cho thấy rằng Salmonella có thể gây ra các bệnh nhiễm trùng nghiêm trọng, ảnh hưởng đến năng suất chăn nuôi.

1.2. Mục tiêu nghiên cứu về Salmonella trong nhà yến

Mục tiêu của nghiên cứu này là xác định sự hiện diện của Salmonella enterica trong môi trường nhà yến, từ đó đưa ra các biện pháp phòng ngừa hiệu quả.

II. Vấn đề và thách thức trong phát hiện Salmonella enterica

Mặc dù có nhiều phương pháp phát hiện Salmonella enterica, nhưng vẫn tồn tại nhiều thách thức trong việc áp dụng chúng trong thực tế. Các yếu tố như môi trường, điều kiện vệ sinh và kỹ thuật lấy mẫu đều ảnh hưởng đến độ chính xác của kết quả.

2.1. Các yếu tố ảnh hưởng đến việc phát hiện Salmonella

Điều kiện môi trường như độ ẩm và nhiệt độ có thể ảnh hưởng đến sự tồn tại của Salmonella. Việc lấy mẫu không đúng cách cũng có thể dẫn đến kết quả sai lệch.

2.2. Thách thức trong việc áp dụng Multiplex PCR

Kỹ thuật Multiplex PCR mặc dù hiệu quả nhưng yêu cầu thiết bị và kỹ thuật viên có trình độ cao. Điều này có thể là một rào cản lớn đối với nhiều cơ sở chăn nuôi nhỏ.

III. Phương pháp Multiplex PCR trong phát hiện Salmonella enterica

Kỹ thuật Multiplex PCR là một trong những phương pháp hiện đại nhất để phát hiện Salmonella enterica. Phương pháp này cho phép phát hiện nhiều loại vi khuẩn trong một lần xét nghiệm, tiết kiệm thời gian và chi phí.

3.1. Nguyên lý hoạt động của Multiplex PCR

Kỹ thuật Multiplex PCR sử dụng nhiều cặp mồi để khuếch đại các đoạn DNA đặc hiệu của Salmonella. Điều này giúp tăng độ nhạy và độ đặc hiệu của phương pháp.

3.2. Quy trình thực hiện Multiplex PCR

Quy trình thực hiện bao gồm các bước như chuẩn bị mẫu, thêm hóa chất và thực hiện chu trình nhiệt. Mỗi bước đều cần được thực hiện cẩn thận để đảm bảo kết quả chính xác.

IV. Kết quả nghiên cứu về Salmonella enterica trong nhà yến

Nghiên cứu đã chỉ ra rằng tỷ lệ mẫu dương tính với Salmonella enterica trong nhà yến là 6.67%. Kết quả này cho thấy sự hiện diện của Salmonella trong môi trường nuôi yến, cần có biện pháp kiểm soát hiệu quả.

4.1. Tỷ lệ phát hiện Salmonella trong mẫu

Trong 90 mẫu được kiểm tra, có 6 mẫu dương tính với Salmonella enterica. Điều này cho thấy mức độ lây nhiễm trong môi trường nuôi yến là đáng lo ngại.

4.2. Ý nghĩa của kết quả nghiên cứu

Kết quả nghiên cứu cung cấp thông tin quan trọng cho các nhà quản lý trong việc xây dựng các biện pháp phòng ngừa và kiểm soát dịch bệnh hiệu quả.

V. Kết luận và triển vọng tương lai trong phát hiện Salmonella

Việc phát hiện Salmonella enterica trong nhà yến là rất cần thiết để bảo vệ sức khỏe cộng đồng và an toàn thực phẩm. Các nghiên cứu tiếp theo cần tập trung vào việc cải thiện kỹ thuật phát hiện và kiểm soát dịch bệnh.

5.1. Tương lai của nghiên cứu về Salmonella

Nghiên cứu cần tiếp tục phát triển các phương pháp phát hiện nhanh và chính xác hơn để ứng phó kịp thời với sự lây lan của Salmonella.

5.2. Các biện pháp phòng ngừa hiệu quả

Cần có các biện pháp phòng ngừa như cải thiện vệ sinh trong nhà yến và giáo dục người nuôi về an toàn thực phẩm để giảm thiểu rủi ro.