Định danh nấm Chaetomium sp. trong mẫu đất trồng cây ăn quả tại Tây Ninh

• Tác giả: Nguyen Thi Ngoc Tam
• Người hướng dẫn: ThS. Tran Thi Thu Ha
• Trường học: Trường Đại Học Nông Lâm
• Chuyên ngành: Công Nghệ Sinh Học
• Đề tài: Nghiên Cứu Định Danh Nấm Chaetomium sp. Trong Mẫu Đất Trồng Cây Ăn Quả Tại Tây Ninh
• Loại tài liệu: khóa luận tốt nghiệp
• Năm xuất bản: 2023
• Địa điểm: Thủ Đức

• LỜI CẢM ƠN
• XÁC NHẬN VÀ CAM ĐOAN
• TÓM TẮT
• ABSTRACT
• 1. CHƯƠNG 1: ĐẶT VẤN ĐỀ
• 1.1. Đặt vấn đề
• 1.2. Mục tiêu của đề tài
• 1.3. Nội dung thực hiện
• 1.4. Thời gian và địa điểm thực hiện
• 2. CHƯƠNG 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• 2.1. Tổng quan nấm Chaetomium sp.
• 2.2. Đặc điểm hình thái nấm Chaetomium sp.
• 2.3. Hoạt tính cơ bản của nấm
• 2.4. Cơ chế hoạt động của nấm
• 2.4.1. Sản sinh kháng sinh đối kháng
• 2.4.2. Ký sinh (mycoparasism)
• 2.5. Đặc điểm phân loại của nấm Chaetomium sp.
• 2.6. Định danh dựa vào trình tự vùng ITS DNA
• 2.7. Những nghiên cứu về chế phẩm sinh học
• 2.7.1. Những nghiên cứu ngoài nước
• 3. CHƯƠNG 3: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
• 3.1. Thời gian và địa điểm nghiên cứu
• 3.2. Vật liệu nghiên cứu
• 3.3. Phương pháp nghiên cứu
• 3.3.1. Phương pháp phân lập nấm Chaetomium sp.
• 3.3.2. Dinh danh các dòng nấm Chaetomium sp.
• 3.3.3. Định danh các dòng nấm Chaetomium sp. bằng kỹ thuật sinh học phân tử (PCR)
• 4. CHƯƠNG 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• 4.1. Kết quả phân lập và định danh nấm Chaetomium sp.
• 4.1.1. Định danh bằng hình thái
• 4.1.2. Đặc điểm hình thái nhóm TN1 gồm mẫu nấm T01
• 4.1.3. Đặc điểm hình thái nhóm TN2 gồm mẫu nấm T05
• 4.1.4. Đặc điểm hình thái nhóm TN3 gồm các mẫu nấm T06, T07, T15
• 4.1.5. Đặc điểm hình thái nhóm TN4 gồm các mẫu nấm T10, T11, T12, T16
• 4.1.6. Đặc điểm hình thái nhóm TN5 gồm các mẫu nấm T02, T03, T04, T08, T13, T17
• 4.1.7. Đặc điểm hình thái nhóm TN6 gồm các mẫu nấm T09, T14
• 4.2. Định danh nấm Chaetomium sp. bằng kỹ thuật sinh học phân tử
• 4.2.1. Khuếch đại vùng gene ITS -rDNA bằng cặp mồi ITS4/ITS5
• 4.2.2. Phân tích kết quả trình tự
• 5. CHƯƠNG 5: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• DANH SÁCH CÁC HÌNH
• DANH SÁCH CÁC BẢNG
• DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT

I. Tổng quan về nghiên cứu nấm Chaetomium sp

Nấm Chaetomium sp. là một trong những nhóm nấm quan trọng trong hệ sinh thái đất, đặc biệt trong các mẫu đất trồng cây ăn quả. Nghiên cứu này nhằm xác định và định danh các dòng nấm Chaetomium sp. trong mẫu đất tại Tây Ninh, nơi có điều kiện khí hậu và thổ nhưỡng phù hợp cho sự phát triển của nấm. Việc hiểu rõ về nấm này không chỉ giúp nâng cao năng suất cây trồng mà còn bảo vệ môi trường sinh thái.

1.1. Đặc điểm sinh thái của nấm Chaetomium sp.

Nấm Chaetomium sp. thường sống trong đất, phân hữu cơ và các chất hữu cơ khác. Chúng có khả năng phân giải cellulose, giúp cải thiện chất lượng đất và cung cấp dinh dưỡng cho cây trồng.

1.2. Vai trò của nấm trong hệ sinh thái đất

Nấm Chaetomium sp. đóng vai trò quan trọng trong việc duy trì sự cân bằng sinh thái, giúp phân hủy chất hữu cơ và tạo ra môi trường sống cho các vi sinh vật khác.

II. Vấn đề và thách thức trong nghiên cứu nấm Chaetomium sp

Mặc dù nấm Chaetomium sp. có nhiều lợi ích, nhưng việc nghiên cứu và ứng dụng chúng trong nông nghiệp vẫn gặp nhiều thách thức. Các bệnh do nấm gây ra trên cây ăn quả ngày càng gia tăng, ảnh hưởng đến năng suất và chất lượng sản phẩm. Việc xác định chính xác các dòng nấm và khả năng kháng bệnh của chúng là rất cần thiết.

2.1. Các bệnh do nấm gây ra trên cây ăn quả

Nấm gây hại như Phytophthora và Fusarium thường xuất hiện trong đất, gây ra các bệnh nghiêm trọng cho cây ăn quả, làm giảm năng suất và chất lượng.

2.2. Khó khăn trong việc phân lập và định danh nấm

Quá trình phân lập và định danh nấm Chaetomium sp. đòi hỏi kỹ thuật cao và sự chính xác trong việc sử dụng các phương pháp sinh học phân tử.

III. Phương pháp nghiên cứu nấm Chaetomium sp

Nghiên cứu này sử dụng phương pháp thu mẫu đất và phân lập nấm bằng kỹ thuật bay giấy lọc. Các mẫu đất được thu thập từ nhiều khu vực khác nhau tại Tây Ninh để đảm bảo tính đại diện. Sau đó, các dòng nấm được phân lập và định danh dựa trên các đặc điểm hình thái và sinh học phân tử.

3.1. Quy trình thu mẫu và phân lập nấm

Mẫu đất được thu thập từ các vườn cây ăn quả, sau đó sử dụng phương pháp bay giấy lọc để phân lập các dòng nấm Chaetomium sp.

3.2. Kỹ thuật định danh nấm bằng sinh học phân tử

Kỹ thuật PCR được sử dụng để khuếch đại vùng gen ITS, giúp xác định chính xác các dòng nấm Chaetomium sp. trong mẫu đất.

IV. Kết quả nghiên cứu và ứng dụng thực tiễn của nấm Chaetomium sp

Kết quả nghiên cứu cho thấy có 17 dòng nấm Chaetomium sp. được phân lập thành công. Trong đó, 6 dòng nấm đã được định danh với độ tương đồng cao với các loài đã biết. Những dòng nấm này có khả năng kháng lại một số bệnh do nấm gây ra trên cây ăn quả, mở ra hướng đi mới cho việc phát triển chế phẩm sinh học trong nông nghiệp.

4.1. Đặc điểm hình thái và phân loại nấm

Các dòng nấm được phân loại dựa trên đặc điểm hình thái như màu sắc, hình dạng quả thể và cấu trúc bào tử.

4.2. Khả năng kháng bệnh của nấm Chaetomium sp.

Nghiên cứu cho thấy nấm Chaetomium sp. có khả năng tiết ra enzyme và hợp chất kháng sinh, giúp ức chế sự phát triển của các nấm bệnh hại.

V. Kết luận và triển vọng nghiên cứu nấm Chaetomium sp

Nghiên cứu về nấm Chaetomium sp. trong mẫu đất trồng cây ăn quả tại Tây Ninh đã chỉ ra tiềm năng lớn của chúng trong việc phát triển chế phẩm sinh học. Việc ứng dụng nấm này không chỉ giúp cải thiện năng suất cây trồng mà còn bảo vệ môi trường sinh thái. Cần tiếp tục nghiên cứu sâu hơn để khai thác triệt để lợi ích của nấm Chaetomium sp.

5.1. Triển vọng ứng dụng trong nông nghiệp

Nấm Chaetomium sp. có thể được phát triển thành chế phẩm sinh học, giúp tăng cường sức đề kháng cho cây trồng và giảm thiểu sử dụng hóa chất.

5.2. Hướng nghiên cứu trong tương lai

Cần nghiên cứu thêm về các loài nấm khác trong chi Chaetomium và khả năng ứng dụng của chúng trong các lĩnh vực khác nhau.