Khóa luận tốt nghiệp sàng lọc in silico các hợp chất trong tự nhiên theo tác dụng ức chế enzym her2 định hướng điều trị ung thư vú

Khóa luận tốt nghiệp nghiên cứu tốt nghiệp sàng lọc in silico các hợp chất trong tự nhiên theo tác dụng ức chế enzym her2 định, vận dụng lý thuyết vào thực tế, đề xuất giải pháp

Chuyên ngành

Dược học

Người đăng

Ẩn danh

Thể loại

Khóa luận tốt nghiệp

2021

56
5
0

Phí lưu trữ

30 Point

Mục lục chi tiết

LỜI CẢM ƠN

DANH MỤC KÍ HIỆU VIẾT TẮT

ĐẶT VẤN ĐỀ

1. CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN

1.1. Tổng quan về bệnh ung thư vú

1.2. Nguyên nhân – Các yếu tố nguy cơ

1.3. Các liệu pháp hiện tại cho ung thư vú

1.4. Tổng quan về đích HER2

1.5. Tổng quan về nghiên cứu In silico

1.5.1. Mô hình in silico trong nghiên cứu phát triển thuốc mới

2. CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

2.1. Thiết bị, phần mềm

2.2. Nội dung nghiên cứu

2.3. Phương pháp nghiên cứu

2.3.1. Chuẩn bị ligand

2.3.2. Chuẩn bị protein

2.3.3. Xác nhận giao thức docking

2.3.4. Nghiên cứu các đặc điểm giống thuốc

2.3.5. Nghiên cứu các đặc tính dược động học và độc tính

3. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.1. Sàng lọc chất ức chế enzym HER2 trong tự nhiên

3.2. Kết quả phân tích các thông số Lipinski

3.3. Đánh giá các đặc tính ADMET

3.4. Về kết quả

3.5. Về phương pháp

3.6. Những hạn chế và thách thức trong mô hình nghiên cứu In silico

4. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ

TÀI LIỆU THAM KHẢO

DANH MỤC CÁC BẢNG

DANH MỤC CÁC HÌNH VẼ

Tóm tắt

I. Khóa luận tốt nghiệp

Khóa luận tốt nghiệp của sinh viên Ngô Thị Hằng tại Trường Đại học Y Dược, Đại học Quốc gia Hà Nội, tập trung vào việc sàng lọc in silico các hợp chất tự nhiên có khả năng ức chế enzym HER2, hướng đến điều trị ung thư vú. Nghiên cứu này nằm trong khuôn khổ chương trình đào tạo ngành Dược học, với mục tiêu tìm kiếm các hợp chất tiềm năng từ nguồn dược liệu tự nhiên. Khóa luận tốt nghiệp không chỉ là bước đệm quan trọng trong hành trình học tập mà còn góp phần vào việc phát triển các phương pháp điều trị mới cho bệnh ung thư vú.

1.1. Mục tiêu nghiên cứu

Mục tiêu chính của khóa luận tốt nghiệp là xây dựng một tổ hợp các hợp chất tự nhiên và sử dụng kỹ thuật docking phân tử để sàng lọc các hợp chất có khả năng ức chế enzym HER2. Ngoài ra, nghiên cứu còn phân tích các đặc tính giống thuốc và đánh giá các thông số ADMET (hấp thụ, phân phối, chuyển hóa, bài tiết và độc tính) của các hợp chất tiềm năng. Đây là bước quan trọng trong quá trình phát triển thuốc mới, giúp tiết kiệm thời gian và chi phí nghiên cứu.

II. Sàng lọc in silico

Sàng lọc in silico là phương pháp sử dụng máy tính để dự đoán và đánh giá các hợp chất có tiềm năng dược lý. Trong nghiên cứu này, sàng lọc in silico được áp dụng để tìm kiếm các hợp chất tự nhiên có khả năng ức chế enzym HER2. Phương pháp này bao gồm các bước như chuẩn bị ligand, chuẩn bị protein, và xác nhận giao thức docking. Sàng lọc in silico giúp rút ngắn thời gian và chi phí so với các phương pháp thực nghiệm truyền thống.

2.1. Kỹ thuật Protein docking

Kỹ thuật Protein docking được sử dụng để mô phỏng sự tương tác giữa các hợp chất tự nhiên và enzym HER2. Quá trình này giúp xác định các hợp chất có khả năng liên kết mạnh với enzym HER2, từ đó ức chế hoạt động của nó. Kết quả docking được đánh giá dựa trên mức năng lượng liên kết và sự tương tác với các amino acid trong vùng trung tâm hoạt động của enzym.

III. Hợp chất tự nhiên

Nghiên cứu tập trung vào việc khai thác nguồn hợp chất tự nhiên từ các cây dược liệu, vốn là nguồn tài nguyên dồi dào và phong phú tại Việt Nam. Các hợp chất này được sàng lọc để tìm ra những chất có khả năng ức chế enzym HER2, một mục tiêu quan trọng trong điều trị ung thư vú. Việc sử dụng hợp chất tự nhiên không chỉ mang lại hiệu quả điều trị mà còn giảm thiểu tác dụng phụ so với các phương pháp hóa trị truyền thống.

3.1. Phân tích dược lý

Các hợp chất tự nhiên được phân tích dựa trên các thông số ADMET để đánh giá khả năng hấp thụ, phân phối, chuyển hóa, bài tiết và độc tính. Điều này giúp xác định các hợp chất có tiềm năng trở thành thuốc điều trị ung thư vú. Kết quả phân tích cho thấy một số hợp chất tự nhiên có đặc tính dược lý phù hợp, mở ra hướng nghiên cứu mới trong việc phát triển thuốc từ dược liệu tự nhiên.

IV. Ức chế enzym HER2

Enzym HER2 là một mục tiêu quan trọng trong điều trị ung thư vú, đặc biệt là ở những bệnh nhân có sự biểu hiện quá mức của gen HER2. Nghiên cứu này tập trung vào việc tìm kiếm các hợp chất có khả năng ức chế enzym HER2, từ đó ngăn chặn sự phát triển và di căn của tế bào ung thư. Các hợp chất được sàng lọc thông qua kỹ thuật docking phân tử và đánh giá dựa trên mức độ ức chế enzym HER2.

4.1. Cơ chế tác dụng

Các hợp chất ức chế enzym HER2 hoạt động bằng cách liên kết với vùng trung tâm hoạt động của enzym, ngăn chặn quá trình truyền tín hiệu tế bào. Điều này dẫn đến sự ức chế tăng trưởng và phân chia của tế bào ung thư. Nghiên cứu đã xác định được một số hợp chất tự nhiên có khả năng ức chế mạnh enzym HER2, mở ra tiềm năng phát triển các loại thuốc mới trong điều trị ung thư vú.

V. Điều trị ung thư vú

Nghiên cứu này hướng đến việc phát triển các phương pháp điều trị ung thư vú hiệu quả hơn, đặc biệt là đối với các bệnh nhân có sự biểu hiện quá mức của gen HER2. Việc sử dụng các hợp chất tự nhiên có khả năng ức chế enzym HER2 mang lại hy vọng mới trong việc điều trị ung thư vú, giảm thiểu tác dụng phụ và cải thiện chất lượng cuộc sống cho bệnh nhân.

5.1. Ứng dụng thực tiễn

Kết quả nghiên cứu từ khóa luận tốt nghiệp này có thể được ứng dụng trong việc phát triển các loại thuốc mới điều trị ung thư vú. Các hợp chất tự nhiên được sàng lọc có tiềm năng trở thành các dẫn chất dược phẩm, góp phần vào việc cải thiện hiệu quả điều trị và giảm chi phí cho bệnh nhân. Nghiên cứu cũng mở ra hướng đi mới trong việc khai thác nguồn dược liệu tự nhiên tại Việt Nam.

12/02/2025

Trích đoạn nội dung tài liệu

CHƯƠNG 1 : TỔNG QUAN 1. Tổng quan về bệnh ung thư vú 1. Đại cương Ung thư vú là nguyên nhân thứ hai gây tử vong do ung thư ở phụ nữ. Sự phát triển của ung thư vú là một quá trình gồm nhiều bước liên quan đến nhiều loại tế bào, và việc ngăn ngừa nó vẫn còn nhiều thách thức trên thế giới.

Chẩn đoán sớm ung thư vú là một trong những cách tiếp cận tốt nhất để ngăn ngừa căn bệnh này. Ở một số nước phát triển, tỷ lệ sống tương đối sau 5 năm của bệnh nhân ung thư vú là trên 80% do được phòng ngừa sớm. Trong thập kỷ gần đây, đã có nhiều tiến bộ trong sự hiểu biết về bệnh ung thư vú cũng như trong việc phát triển các phương pháp phòng ngừa. Cơ chế sinh bệnh và cơ chế kháng thuốc của khối u được tiết lộ khi phát hiện ra tế bào gốc ung thư vú, người ta tìm thấy nhiều gen liên quan đến ung thư vú [21].

Ung thư vú là một trong những bệnh ung thư phổ biến nhất ở phụ nữ trên toàn thế giới, chiếm khoảng 570.000 ca tử vong vào năm 2015. Hơn 1,5 triệu phụ nữ (25% tổng số phụ nữ mắc bệnh ung thư) được chẩn đoán mắc bệnh ung thư vú mỗi năm trên toàn thế giới 1 , 2. Ở Mỹ, người ta ước tính rằng 30% tổng số ca ung thư mới (252.710 ca) ở phụ nữ là ung thư vú vào năm 2017 [3]. Ung thư vú là một bệnh ung thư di căn và thường có thể di chuyển đến các cơ quan ở xa như xương, gan, phổi và não.

Chẩn đoán sớm bệnh có thể tiên lượng tốt và tỷ lệ sống sót cao [21]. Theo Bộ Y tế Việt Nam năm 2020, Ung thư vú (UTV) là loại ung thư thường gặp và là nguyên nhân gây tử vong hàng đầu do ung thư ở phụ nữ trên toàn thế giới. Mỗi năm nước ta có khoảng hơn 15.230 phụ nữ mới mắc và hơn 6.100 người tử vong do UTV. Ung thư vú nam chiếm khoảng 1% các trường hợp UTV.

Đa số UTV xuất phát từ các tế bào biểu mô của vú. Bệnh Paget của vú có thể kèm theo UTV. Do vậy, khi có thành phần ung thư trên Paget vú cần được điều trị như UTV thông thường với giai đoạn tương ứng [8]. Các yếu tố tiên lượng quan trọng bao gồm: kích thước u nguyên phát, số lượng hạch di căn, thể mô bệnh học, độ mô học, tình trạng thụ thể nội tiết, 1 tình trạng thụ thể yếu tố phát triển biểu bì người số 2 (human epidermal growth factor receptor-HER2) [8].

Tỷ lệ sống 5 năm của bệnh nhân UTV ngày càng được cải thiện. Thống kê tại Hoa kỳ năm 2001-2002: giai đoạn 0: 100%; giai đoạn I: 88%; giai đoạn II: 74-81%; giai đoạn III: 41-67%; giai đoạn IV: 15%. Đến năm 2012, tỷ lệ này là: giai đoạn 0 và I: 100%; giai đoạn II: 93%; giai đoạn III: 72%; giai đoạn IV: 22% [8]. Theo báo cáo ghi nhận ung thư toàn cầu Globocan 2020, tại Việt Nam, trong số ung thư ở nữ, số người mới mắc ung thư vú đứng hàng thứ nhất, với 21.555 người, chiếm 25.8%, tính theo cả hai giới đứng hàng thứ ba (sau ung thư gan và ung thư phổi) [19].

Tỷ lệ mới mắc chuẩn theo tuổi của ung thư vú ở nữ là 34. Ở cả hai giới, số tử vong do ung thư vú đứng hàng thứ tư (với 9.345 trường hợp) sau ung thư gan, ung thư phổi và ung thư dạ dày. Tỷ lệ tử vong chuẩn theo tuổi do ung thư vú là 13. Tại Việt Nam, cách đây 5 đến 10 năm thì tỷ lệ người bệnh ung thư tới khám, điều trị ở giai đoạn muộn là hơn 70%.

Thời gian qua, công tác truyền thông được đẩy mạnh, đặc biệt là trong Chương trình quốc gia về phòng, chống bệnh không lây nhiễm, nhờ đó, tỷ lệ người mắc bệnh ung thư đến khám và điều trị bệnh ở giai đoạn sớm tăng dần [19]. Nguyên nhân – Các yếu tố nguy cơ Các khối u vú thường bắt đầu từ sự tăng sinh của ống dẫn sữa, sau đó phát triển thành các khối u lành tính hoặc thậm chí là ung thư di căn sau khi liên tục bị kích thích bởi các yếu tố gây ung thư khác nhau. Môi trường vi mô khối u như ảnh hưởng mô đệm hoặc đại thực bào đóng vai trò quan trọng trong việc khởi phát và tiến triển ung thư vú. Tuyến vú của chuột có thể bị tạo ra u khi chỉ chất đệm tiếp xúc với chất gây ung thư, không phải chất nền ngoại bào hoặc biểu mô.

Các đại thực bào có thể tạo ra một vi môi trường gây viêm đột biến, có thể thúc đẩy sự hình thành mạch và cho phép các tế bào ung thư thoát khỏi sự từ chối miễn dịch. Các kiểu methyl hóa DNA khác nhau đã được quan sát thấy giữa môi trường bình thường và môi trường liên quan 2 đến khối u, cho thấy rằng những thay đổi biểu sinh trong vi môi trường khối u có thể thúc đẩy quá trình sinh ung thư. Gần đây, một phân lớp mới của các tế bào ác tính trong các khối u được gọi là tế bào gốc ung thư (CSC) được quan sát thấy và có liên quan đến sự khởi phát, thoát ra và tái phát của khối u. Đây dân nhỏ của các tế bào, trong đó có thể phát triển từ tế bào gốc hoặc tế bào nguyên bản trong các mô bình thường, có khả năng tự tái tạo và có khả năng kháng các liệu pháp truyền thống như hóa trị và xạ trị [21].

Trong các yếu tố nguy cơ mắc bệnh, nổi bật là tiền sử gia đình có người mắc UTV, đặc biệt có từ 2 người mắc trở lên ở lứa tuổi trẻ. Người ta cũng tìm thấy sự liên quan giữa đột biến gen BRCA1 và BRCA2 với UTV, ung thư buồng trứng và một số ung thư khác. Một số yếu tố khác bao gồm: có kinh lần đầu sớm, mãn kinh muộn, phụ nữ độc thân, không sinh con, không cho con bú, sinh con đầu lòng muộn. Béo phì, chế độ ăn giàu chất béo, sử dụng rượu cũng góp phần tăng nguy cơ bị bệnh.

Viêm vú trong khi sinh đẻ và một số bệnh vú lành tính cũng là các yếu tố tăng nguy cơ mắc UTV. Tuổi càng cao, nguy cơ mắc bệnh càng tăng. Tuy nhiên, bệnh cũng có thể xuất hiện ở những người rất trẻ [8]. Các liệu pháp hiện tại cho ung thư vú 1.

Phẫu thuật - Đối với khối u nguyên phát: có các hình thái phẫu thuật như cắt tuyến vú vét hạch nách, cắt tuyến vú tiết kiệm da, cắt tuyến vú bảo tồn quầng núm, phẫu thuật bảo tồn kết hợp với các kỹ thuật tái tạo [8]. - Đối với hạch vùng: có các hình thái phẫu thuật như nạo vét hạch nách hoặc sinh thiết hạch cửa [8]. - Tạo hình và tái tạo tuyến vú cho bệnh nhân UTV: đây là nhu cầu cấp thiết và chính đáng của người bệnh trong những năm gần đây. Có nhiều biện pháp tạo hình, tái tạo tuyến vú như sử dụng chất liệu độn (implant), sử dụng các vạt da cơ có cuống hay vạt da cơ tự do với kỹ thuật vi phẫu.

Việc chỉ định loại phẫu thuật này cần được đưa ra bởi bác sỹ chuyên ngành ung bướu sau khi đã có đánh giá tổng thể toàn diện các vấn đề liên quan đến tiên lượng bệnh ung thư và chất lượng sống của người bệnh [8]. 3 - Phẫu thuật sạch sẽ, phẫu thuật triệu chứng: đối với giai đoạn muộn [8]. Xạ trị chiếu ngoài - Xạ trị tại diện u: áp dụng với các trường hợp có khối u lớn (>5cm) hoặc u ở vị trí ngoại biên, khả năng cắt rộng bị giới hạn [8]. - Xạ trị tại hạch vùng: áp dụng cho các trường hợp có 4 hạch di căn hoặc có hạch di căn kết hợp với yếu tố nguy cơ cao [8].

- Xạ trị trong điều trị bảo tồn: đây là lựa chọn bắt buộc trong điều trị bảo tồn ung thư vú. Xạ trị áp sát Cấy hạt phóng xạ vào khối u hoặc diện u trong các trường hợp không phẫu thuật triệt căn được hoặc bệnh lý kèm theo không thể phẫu thuật hay bệnh nhân nhất định từ chối phẫu thuật [8]. Xạ trị trong mổ (Intraoperative Radiation Therapy: IORT) - IORT là một kỹ thuật đặc biệt có thể cung cấp một liều xạ trị duy nhất, tập trung cao liều bức xạ tại nền khối u sau phẫu thuật hoặc phần còn lại của khối u không thể phẫu thuật được, các khối u tái phát, di căn [8]. - Các chỉ định cho xạ trị trong mổ với ung thư vú thường là các khối u vú mổ tiếp cận, mổ bảo tồn (kích thước u là dưới 3cm và không có hạch trên lâm sàng), hoặc các trường hợp tái phát [8].

- Có thể sử dụng IORT với liều duy nhất hoặc tăng cường xạ trị toàn bộ vú, đặc biệt những trường hợp ung thư vú tái phát [8]. Điều trị hệ thống 4 - Hóa trị: được áp dụng cho phần lớn các bệnh nhân UTV vào một thời gian nào đó. Đây là phương pháp hiệu quả cao, mang lại rất nhiều lợi ích về sống thêm cho người bệnh [8] - Điều trị nội tiết: được áp dụng cho các trường hợp UTV có thụ thể nội tiết dương tính [8]. - Điều trị đích: là phương pháp điều trị sử dụng các thuốc là kháng thể đơn dòng nhắm vào các đích đặc hiệu của tế bào ung thư vú.

- Điều trị miễn dịch: là phương pháp dùng các thuốc tác động vào các đích là các cơ chế miễn dịch xác định, giúp cơ thể loại trừ tế bào ung thư [8]. Tổng quan về đích HER2 Thụ thể yếu tố tăng trưởng biểu bì ở người 2, còn được gọi là c-erbB-2 , là một gen gây ung thư quan trọng trong ung thư vú và nằm trên nhánh dài của nhiễm sắc thể 17 ở người (17q12). Homologene ở chuột là Neu , lần đầu tiên được xác định trong tế bào u nguyên bào thần kinh chuột gây ra 3- methylcholanthrene [22]. Sự biểu hiện của gen HER2 được kích hoạt chủ yếu thông qua quá trình khuếch đại và tái sắp xếp gen.

Protein HER2 là một thụ thể yếu tố tăng trưởng biểu bì (EGFR) thuộc họ tyrosine kinase và tạo thành dị thể với các thành viên họ EGFR liên kết với phối tử khác như Her3 và Her4, do đó để kích hoạt các con đường tín hiệu xuôi dòng [23]. Các thụ thể yếu tố tăng trưởng biểu bì ở người (HER / erbB) tạo thành một họ gồm bốn thụ thể bề mặt tế bào liên quan đến việc truyền tín hiệu điều khiển sự phát triển và biệt hóa tế bào bình thường.

Nội dung được bảo vệ bản quyền — Tải xuống đầy đủ

Bài viết "Khóa luận tốt nghiệp kinh tế nâng cao hiệu quả sử dụng nhân lực của công ty cổ phần than Hà Tu" cung cấp cái nhìn sâu sắc về các chiến lược và giải pháp nhằm tối ưu hóa việc sử dụng nguồn nhân lực trong doanh nghiệp. Đây là tài liệu hữu ích cho các nhà quản lý và sinh viên ngành kinh tế, giúp họ hiểu rõ hơn về cách nâng cao hiệu quả làm việc thông qua quản lý nhân sự hiệu quả. Để mở rộng kiến thức về chủ đề này, bạn có thể tham khảo thêm Khóa luận tốt nghiệp kinh tế nâng cao chất lượng nguồn nhân lực của công ty TNHH KP Electronics Việt Nam, nơi tập trung vào việc cải thiện chất lượng nhân sự. Ngoài ra, Giải pháp hoàn thiện công tác tuyển dụng tại công ty TNHH sản xuất thương mại gỗ Nhật Minh cũng là một tài liệu đáng đọc, giúp bạn hiểu rõ hơn về quy trình tuyển dụng hiệu quả. Để tìm hiểu sâu hơn về các giải pháp quản lý nhân sự, hãy khám phá thêm các bài viết liên quan.