Luận án TS: Nghiên cứu đa hình gen CYP450 ở người Kinh Việt Nam

Luận án TS phân tích đa hình các gen CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 liên quan chuyển hóa thuốc ở người Kinh. Cung cấp dữ liệu tần số alen và kiểu gen.

Chuyên ngành

Công nghệ sinh học

Người đăng

Ẩn danh

Thể loại

Luận án tiến sĩ

2020

169
1
0

Phí lưu trữ

45 Point

Tóm tắt

I. Khám phá đa hình gen CYP450 ở người Kinh Việt Nam

Hệ enzyme Cytochrome P450 (CYP450) là một siêu họ protein đóng vai trò then chốt trong quá trình chuyển hóa các hợp chất nội sinh và ngoại sinh, đặc biệt là thuốc. Ở người, khoảng 12 enzyme CYP450 thuộc các phân họ CYP1, CYP2, và CYP3 chịu trách nhiệm chính cho quá trình chuyển hóa thuốc. Các gen mã hóa cho những enzyme này có tính đa hình rất cao, dẫn đến sự khác biệt đáng kể trong hoạt động của enzyme giữa các cá thể. Sự đa dạng di truyền này, bao gồm các đa hình đơn nucleotide (SNP) và biến thể số bản sao (CNV), là nền tảng của ngành dược lý di truyền (pharmacogenomics). Việc nghiên cứu đa hình gen CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 ở người Kinh Việt Nam có ý nghĩa cực kỳ quan trọng, vì các enzyme này tham gia chuyển hóa từ 60-80% các loại thuốc kê đơn phổ biến. Hiểu rõ về đặc điểm di truyền người Kinh giúp giải thích tại sao một liều thuốc tiêu chuẩn có thể hiệu quả với người này nhưng lại gây độc tính hoặc không có tác dụng với người khác. Nghiên cứu của Vũ Phương Nhung (2020) đã cung cấp một cơ sở dữ liệu toàn diện về tần suất alenkiểu gen (genotype) của các gen này trong quần thể người Việt, mở đường cho các ứng dụng y học chính xác và cá thể hóa điều trị.

1.1. Giới thiệu hệ enzyme Cytochrome P450 CYP450

Các enzyme Cytochrome P450 (CYP450) là một nhóm lớn các protein-heme, đóng vai trò trung tâm trong giai đoạn I của quá trình chuyển hóa thuốc tại gan và nhiều cơ quan khác. Chức năng chính của chúng là biến đổi các hợp chất tan trong lipid thành các chất ưa nước hơn để dễ dàng đào thải ra khỏi cơ thể. Trong số 57 gen CYP450 chức năng ở người, các gen thuộc phân họ CYP1, CYP2, và CYP3 có vai trò dược lý nổi bật nhất. Đặc biệt, các enzyme như CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, và CYP3A5 chịu trách nhiệm chuyển hóa phần lớn các loại thuốc thông dụng, từ thuốc chống đông máu, thuốc chống trầm cảm đến thuốc điều trị ung thư. Hoạt tính của các enzyme này bị ảnh hưởng mạnh mẽ bởi các yếu tố di truyền, tạo ra các kiểu hình (phenotype) chuyển hóa khác nhau, bao gồm người chuyển hóa chậm (poor metabolizer), người chuyển hóa nhanh (extensive metabolizer), và người chuyển hóa siêu nhanh (ultrarapid metabolizer). Sự khác biệt này là nguyên nhân cốt lõi gây ra sự đa dạng trong đáp ứng thuốc giữa các cá thể.

1.2. Tầm quan trọng của Dược lý di truyền Pharmacogenomics

Dược lý di truyền (pharmacogenomics) là lĩnh vực nghiên cứu về ảnh hưởng của các biến thể di truyền đến đáp ứng của một cá nhân đối với thuốc. Mục tiêu của nó là phát triển các phương pháp điều trị an toàn và hiệu quả hơn bằng cách lựa chọn và định liều thuốc phù hợp với cấu trúc di truyền của từng bệnh nhân. Việc áp dụng các nguyên tắc pharmacogenomics giúp dự đoán nguy cơ xảy ra phản ứng có hại của thuốc (ADR), tối ưu hóa hiệu quả điều trị và tránh các liệu pháp không cần thiết. Theo Hiệp hội Ứng dụng Di truyền dược học lâm sàng (CPIC), xét nghiệm gen dược lý trước khi điều trị có thể cung cấp thông tin quý giá để cá nhân hóa phác đồ điều trị, đặc biệt với các thuốc có chỉ số điều trị hẹp. Nghiên cứu về đa hình gen CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 ở người Kinh Việt Nam là một bước đi quan trọng để xây dựng nền tảng cho y học cá thể hóa tại Việt Nam.

II. Thách thức từ đa hình gen CYP ở người Kinh Việt Nam

Sự khác biệt trong đáp ứng thuốc là một thách thức lớn trong thực hành lâm sàng. Một trong những nguyên nhân chính là sự đa dạng di truyền của các gen Cytochrome P450. Ở quần thể người Việt, sự phân bố tần suất alen của các gen như CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 có những nét đặc thù so với các quần thể khác, dẫn đến những nguy cơ riêng biệt. Ví dụ, một kiểu gen (genotype) phổ biến ở người châu Á có thể dẫn đến tình trạng người chuyển hóa chậm (poor metabolizer), làm tăng nồng độ thuốc trong máu và nguy cơ ngộ độc. Ngược lại, một số cá nhân lại là người chuyển hóa siêu nhanh (ultrarapid metabolizer), khiến thuốc bị đào thải quá nhanh và không đạt hiệu quả điều trị. Những thách thức này không chỉ gây ra các phản ứng có hại của thuốc (ADR) mà còn làm tăng chi phí y tế và kéo dài thời gian nằm viện. Theo Ingelman-Sunberg và cộng sự, ADR là nguyên nhân gây ra khoảng 100.000 ca tử vong mỗi năm tại Mỹ. Do đó, việc thiếu một cơ sở dữ liệu chi tiết về đặc điểm di truyền người Kinh là một rào cản lớn trong việc áp dụng y học chính xác và cá thể hóa điều trị.

2.1. Nguy cơ phản ứng có hại của thuốc ADR do khác biệt di truyền

Phản ứng có hại của thuốc (ADR) là một trong những nguyên nhân hàng đầu gây bệnh tật và tử vong liên quan đến y tế. Các nghiên cứu chỉ ra rằng một tỷ lệ đáng kể các trường hợp ADR có thể được ngăn chặn nếu thông tin di truyền của bệnh nhân được xem xét. Các cá nhân mang các alen làm giảm hoặc mất chức năng của enzyme CYP450, được phân loại là người chuyển hóa chậm (poor metabolizer), có nguy cơ tích lũy thuốc trong cơ thể đến nồng độ độc hại khi dùng liều tiêu chuẩn. Ngược lại, người chuyển hóa siêu nhanh (ultrarapid metabolizer), do có nhiều bản sao hoạt động của gen, có thể không đáp ứng với các tiền chất thuốc cần được hoạt hóa bởi enzyme CYP450. Ví dụ, bệnh nhân có kiểu hình chuyển hóa codeine siêu nhanh bởi CYP2D6 có nguy cơ ngộ độc opioid gây suy hô hấp. Việc xác định các biến thể di truyền trong quần thể người Kinh Việt Nam là bước đầu tiên để giảm thiểu các rủi ro này.

2.2. Sự khác biệt trong chuyển hóa thuốc và hiệu quả điều trị

Hiệu quả của một liệu pháp điều trị phụ thuộc rất nhiều vào quá trình chuyển hóa thuốc. Sự đa dạng di truyền trong các gen CYP450 tạo ra một phổ rộng các kiểu hình (phenotype) chuyển hóa. Một bệnh nhân là người chuyển hóa nhanh (extensive metabolizer) có thể đáp ứng tốt với liều thuốc tiêu chuẩn. Tuy nhiên, một bệnh nhân khác là người chuyển hóa chậm (poor metabolizer) đối với cùng một loại thuốc có thể cần giảm liều đáng kể để tránh độc tính. Đặc biệt, các alen như CYP2C19*2CYP2C19*3 phổ biến ở người châu Á làm giảm khả năng hoạt hóa thuốc chống kết tập tiểu cầu clopidogrel, làm tăng nguy cơ biến cố tim mạch. Tương tự, alen CYP2D6*10 cũng phổ biến ở châu Á làm giảm hoạt tính enzyme, ảnh hưởng đến hiệu quả của nhiều thuốc chống trầm cảm và giảm đau. Sự thiếu hiểu biết về các tương tác thuốc-gen này trong quần thể người Việt dẫn đến việc điều trị theo phương pháp 'thử và sai', kém hiệu quả và tốn kém.

III. Phương pháp phân tích đa hình gen CYP2C9 và CYP2C19

Để xác định đa hình gen CYP2C9, 2C19 ở người Kinh Việt Nam, các phương pháp sinh học phân tử hiện đại đã được áp dụng. Nghiên cứu của Vũ Phương Nhung (2020) đã sử dụng phương pháp giải trình tự Sanger để phân tích toàn bộ vùng mã hóa (exon), vùng biên intron-exon và vùng promoter của hai gen này trên 136 cá thể người Kinh khỏe mạnh. Phương pháp này cho phép phát hiện chính xác các đa hình đơn nucleotide (SNP) quan trọng, bao gồm các alen đã biết và các biến thể mới. Cụ thể, nghiên cứu tập trung vào việc xác định tần suất alen của CYP2C9*2CYP2C9*3, hai alen làm giảm đáng kể hoạt tính enzyme và ảnh hưởng đến liều lượng của thuốc chống đông warfarin. Đối với gen CYP2C19, các alen mục tiêu là CYP2C19*2CYP2C19*3 (gây mất chức năng) và CYP2C19*17 (gây tăng chức năng). Ngoài giải trình tự, kỹ thuật MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) cũng được sử dụng để phát hiện các biến thể số bản sao (CNV), cung cấp một bức tranh toàn diện về đặc điểm di truyền người Kinh liên quan đến chuyển hóa thuốc.

3.1. Phân tích tần suất alen CYP2C9 2 và CYP2C9 3

Gen CYP2C9 đóng vai trò quan trọng trong việc chuyển hóa khoảng 15% các loại thuốc, bao gồm warfarin và phenytoin. Các alen CYP2C9*2 (p.Arg144Cys)CYP2C9*3 (p.Ile359Leu) là những biến thể được nghiên cứu nhiều nhất, có khả năng làm giảm hoạt tính enzyme lần lượt là 30-40% và 80-90%. Nghiên cứu trên quần thể người Kinh Việt Nam cho thấy tần suất alen CYP2C9*3 tương đối phổ biến, phù hợp với các quần thể Đông Á khác, trong khi alen CYP2C9*2 rất hiếm gặp. Việc xác định chính xác tần số này rất quan trọng trong cá thể hóa điều trị warfarin, vì bệnh nhân mang các alen này cần liều thấp hơn đáng kể để tránh nguy cơ xuất huyết. Thông tin này giúp các bác sĩ lâm sàng đưa ra quyết định kê đơn dựa trên bằng chứng di truyền, thay vì chỉ dựa vào các chỉ số lâm sàng truyền thống như INR.

3.2. Xác định các alen CYP2C19 2 3 và 17

Gen CYP2C19 có vai trò thiết yếu trong việc hoạt hóa tiền chất clopidogrel. Các alen gây mất chức năng như CYP2C19*2CYP2C19*3 rất phổ biến ở người châu Á, với tỷ lệ người chuyển hóa chậm (poor metabolizer) có thể lên đến 14%, cao hơn nhiều so với người da trắng (2%). Những cá nhân này có nguy cơ cao bị kháng clopidogrel, dẫn đến thất bại trong điều trị. Ngược lại, alen CYP2C19*17, một biến thể trong vùng promoter, làm tăng cường phiên mã gen, tạo ra kiểu hình người chuyển hóa siêu nhanh (ultrarapid metabolizer) và tăng nguy cơ chảy máu. Nghiên cứu đã xác định tần suất alen của cả ba biến thể này trong quần thể người Việt, cung cấp dữ liệu nền tảng cho xét nghiệm gen dược lý trước khi kê đơn clopidogrel và các thuốc ức chế bơm proton.

IV. Cách phân tích đa hình gen CYP2D6 và CYP3A5 ở người Kinh

Phân tích đa hình gen CYP2D6 và CYP3A5 ở người Kinh Việt Nam đòi hỏi một cách tiếp cận phức tạp hơn do tính đa dạng cấu trúc của chúng. CYP2D6 là một trong những gen đa hình nhất trong hệ gen người, không chỉ chứa các SNP mà còn có nhiều biến thể số bản sao (CNV) và biến thể cấu trúc (SV), bao gồm xóa và lặp gen. Để phân tích toàn diện, nghiên cứu đã kết hợp phương pháp giải trình tự Sanger để xác định các SNP quan trọng như trong alen CYP2D6*10 (phổ biến ở người châu Á) và kỹ thuật MLPA để xác định số bản sao của gen. Việc xác định chính xác kiểu gen (genotype) của CYP2D6 rất quan trọng để dự đoán kiểu hình (phenotype) chuyển hóa. Đối với gen CYP3A5, nghiên cứu tập trung vào alen CYP3A5*3, một SNP trong intron 3 tạo ra một vị trí cắt nối bất thường, dẫn đến sản phẩm protein không có chức năng. Alen này rất phổ biến và là yếu tố quyết định chính đến việc một cá nhân có biểu hiện enzyme CYP3A5 hay không, ảnh hưởng đến liều lượng của thuốc ức chế miễn dịch tacrolimus.

4.1. Đặc điểm alen CYP2D6 10 và biến thể số bản sao CNV

CYP2D6 chuyển hóa khoảng 25% các loại thuốc trên thị trường, bao gồm thuốc chống trầm cảm, thuốc giảm đau opioid và tamoxifen. Alen CYP2D6*10 (p.Pro34Ser) là alen giảm chức năng phổ biến nhất ở các quần thể châu Á, với tần suất có thể vượt quá 50%. Sự hiện diện của alen này là nguyên nhân chính tạo ra kiểu hình chuyển hóa trung bình (intermediate metabolizer) ở người châu Á. Ngoài ra, các CNV như xóa toàn bộ gen (tạo ra alen CYP2D6*5, mất hoàn toàn chức năng) hoặc lặp gen (tạo ra kiểu hình người chuyển hóa siêu nhanh (ultrarapid metabolizer)) cũng đóng vai trò quan trọng. Nghiên cứu của Vũ Phương Nhung (2020) đã xác định tần suất của các alen này, cho thấy tỷ lệ đáng kể người Kinh Việt Nam mang các biến thể làm thay đổi hoạt tính enzyme CYP2D6, nhấn mạnh sự cần thiết của xét nghiệm gen dược lý.

4.2. Tần suất alen CYP3A5 3 và ý nghĩa lâm sàng

Enzyme CYP3A5 có vai trò lớn trong chuyển hóa thuốc, đặc biệt là thuốc ức chế miễn dịch tacrolimus dùng trong ghép tạng. Hoạt động của enzyme này chủ yếu được quyết định bởi alen CYP3A5*3 (6986A>G). Những cá nhân mang kiểu gen đồng hợp tử *CYP3A5*3/3 hầu như không biểu hiện protein CYP3A5 chức năng, trong khi những người mang ít nhất một alen kiểu dại (CYP3A5*1) sẽ có hoạt tính enzyme đáng kể. Tần suất alen CYP3A5*3 rất khác nhau giữa các chủng tộc, cao ở người da trắng nhưng thấp hơn ở người gốc Phi. Việc xác định tần suất alen này ở quần thể người Kinh Việt Nam là cực kỳ quan trọng để định liều tacrolimus. Bệnh nhân biểu hiện CYP3A5 (mang alen *1) cần liều tacrolimus cao hơn để đạt được nồng độ điều trị trong máu, giúp ngăn ngừa thải ghép.

V. Ứng dụng kết quả nghiên cứu trong y học cá thể hóa

Các kết quả từ nghiên cứu đa hình gen CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 ở người Kinh Việt Nam cung cấp một cơ sở dữ liệu di truyền vô giá, làm nền tảng cho việc triển khai y học chính xác tại Việt Nam. Bằng cách so sánh tần suất alen của quần thể người Việt với các quần thể khác trên thế giới, nghiên cứu đã chỉ ra những đặc điểm di truyền người Kinh độc đáo, nhấn mạnh rằng không thể áp dụng một cách máy móc các hướng dẫn điều trị từ các quần thể khác. Thông tin này có thể được tích hợp vào thực hành lâm sàng thông qua xét nghiệm gen dược lý, cho phép các bác sĩ dự đoán đáp ứng thuốc của bệnh nhân trước khi bắt đầu điều trị. Điều này giúp tối ưu hóa liều lượng, tăng hiệu quả và giảm thiểu nguy cơ phản ứng có hại của thuốc (ADR). Hướng tới cá thể hóa điều trị dựa trên tương tác thuốc-gen không chỉ cải thiện chất lượng chăm sóc sức khỏe mà còn mang lại lợi ích kinh tế đáng kể bằng cách giảm chi phí liên quan đến các biến cố bất lợi và các liệu pháp không hiệu quả.

5.1. So sánh tần suất alen của người Việt với quần thể khác

Kết quả nghiên cứu cho thấy sự phân bố tần suất alen của các gen CYP450 trong quần thể người Kinh Việt Nam có nhiều điểm tương đồng với các quần thể Đông Á khác nhưng khác biệt rõ rệt so với người châu Âu và châu Phi. Ví dụ, tần suất cao của CYP2C19*2, CYP2C19*3CYP2D6*10 là đặc trưng của người châu Á, trong khi CYP2C9*2 và các alen giảm chức năng của CYP2D6 như 4 lại phổ biến hơn ở người da trắng. **Alen CYP3A53**, mặc dù phổ biến toàn cầu, nhưng tần suất của nó ở người Việt cũng cần được xác định chính xác để có hướng dẫn liều phù hợp. Sự so sánh này khẳng định tầm quan trọng của việc xây dựng cơ sở dữ liệu tham chiếu di truyền riêng cho từng quần thể, thay vì ngoại suy dữ liệu từ các nhóm dân tộc khác.

5.2. Hướng tới cá thể hóa điều trị dựa trên tương tác thuốc gen

Mục tiêu cuối cùng của dược lý di truyền là hiện thực hóa cá thể hóa điều trị. Dựa trên kiểu gen (genotype) CYP450 của một bệnh nhân, bác sĩ có thể lựa chọn loại thuốc và liều lượng phù hợp nhất. Ví dụ, một bệnh nhân là người chuyển hóa chậm (poor metabolizer) đối với CYP2C19 sẽ được khuyến cáo sử dụng một loại thuốc chống kết tập tiểu cầu thay thế cho clopidogrel. Một bệnh nhân mang các alen giảm chức năng của CYP2C9 sẽ được bắt đầu với liều warfarin thấp hơn. Việc hiểu rõ các tương tác thuốc-gen này giúp chuyển đổi mô hình điều trị từ 'một liều cho tất cả' sang một phương pháp tiếp cận chính xác, an toàn và hiệu quả hơn, phù hợp với từng cá nhân.

VI. Tương lai ngành dược lý di truyền tại Việt Nam ra sao

Nghiên cứu về đa hình gen CYP2C9, 2C19, 3A5, 2D6 ở người Kinh Việt Nam là một bước tiến quan trọng, nhưng đây mới chỉ là khởi đầu cho sự phát triển của ngành dược lý di truyền (pharmacogenomics) tại Việt Nam. Tương lai của lĩnh vực này phụ thuộc vào việc tiếp tục xây dựng và mở rộng cơ sở dữ liệu di truyền cho quần thể người Việt, không chỉ giới hạn ở người Kinh mà còn bao gồm các dân tộc thiểu số khác. Các nghiên cứu cần được mở rộng để bao gồm nhiều gen dược lý khác và xác định các biến thể hiếm nhưng có ý nghĩa lâm sàng. Thách thức lớn nhất là việc tích hợp thông tin di truyền vào hệ thống chăm sóc sức khỏe một cách hiệu quả, đòi hỏi sự hợp tác giữa các nhà nghiên cứu, bác sĩ lâm sàng, nhà quản lý và các công ty bảo hiểm. Cần có các hướng dẫn thực hành lâm sàng dựa trên bằng chứng, các chương trình đào tạo cho nhân viên y tế và các nền tảng công nghệ thông tin hỗ trợ ra quyết định. Vượt qua những thách thức này sẽ giúp Việt Nam khai thác tối đa tiềm năng của pharmacogenomics để nâng cao sức khỏe cộng đồng.

6.1. Xây dựng cơ sở dữ liệu di truyền cho quần thể người Kinh

Một cơ sở dữ liệu di truyền toàn diện và đặc thù cho quần thể người Kinh Việt Nam là tài sản quốc gia thiết yếu cho y học chính xác. Việc xây dựng cơ sở dữ liệu này đòi hỏi các nỗ lực nghiên cứu quy mô lớn, thu thập mẫu từ hàng nghìn cá thể để xác định chính xác tần suất alen của các gen quan trọng và phát hiện các biến thể mới. Dữ liệu này không chỉ phục vụ cho dược lý di truyền mà còn hữu ích trong nghiên cứu các bệnh di truyền, dịch tễ học và nhân chủng học. Việc chuẩn hóa quy trình thu thập, phân tích và lưu trữ dữ liệu là rất quan trọng để đảm bảo tính chính xác và khả năng tương tác giữa các nghiên cứu khác nhau. Đây là nền tảng để phát triển các panel xét nghiệm gen dược lý phù hợp với đặc điểm di truyền người Kinh.

6.2. Thách thức và kiến nghị cho các nghiên cứu pharmacogenomics

Để lĩnh vực pharmacogenomics phát triển bền vững tại Việt Nam, cần giải quyết một số thách thức chính. Thứ nhất là chi phí của các xét nghiệm gen dược lý vẫn còn cao, hạn chế khả năng tiếp cận của đa số người dân. Thứ hai là sự thiếu hụt các chuyên gia được đào tạo bài bản về di truyền học và tin sinh học để phân tích và diễn giải kết quả. Thứ ba là rào cản trong việc tích hợp dữ liệu di truyền vào hồ sơ bệnh án điện tử và các hệ thống hỗ trợ quyết định lâm sàng. Các kiến nghị bao gồm: (1) Nhà nước cần đầu tư vào các dự án nghiên cứu quy mô lớn; (2) Xây dựng các chương trình đào tạo liên ngành về dược lý di truyền; (3) Phát triển các hướng dẫn lâm sàng quốc gia dựa trên dữ liệu di truyền của quần thể người Việt; và (4) Thúc đẩy hợp tác quốc tế để học hỏi kinh nghiệm và chuyển giao công nghệ.

04/10/2025

Trích đoạn nội dung tài liệu

MỞ ĐẦU Các enzyme cytochrome P450 (CYP450) thuộc một họ protein-heme lớn, những enzyme này có vai trò thiết yếu đối với các quá trình chuyển hóa hợp chất nội sinh và ngoại sinh. Ở người, có 57 gen chức năng và 58 gen giả đã được báo cáo, trong đó các CYP450 được phân loại thành 18 họ và 44 phân họ. Hầu hết các gen trong nhóm này đều mang những chức năng sinh học trong chuyển hóa các chất nội sinh như acid mật, eicosanoid và steroid. Tuy nhiên, khoảng 12 enzyme CYP450 thuộc các phân họ CYP1, CYP2 và CYP3 là tham gia chuyển hóa thuốc chính.

Phần lớn các loại thuốc được kê đơn trong lâm sàng được chuyển hóa bởi các enzyme CYP450, ngoài ra cũng có rất nhiều loại thuốc chỉ được chuyển hóa bởi một CYP450 duy nhất. Có thể thấy, những yếu tố nội sinh và ngoại sinh gây ảnh hưởng đến hoạt tính enzyme của CYP450 đóng vai trò rất quan trọng đến dược động học của các loại thuốc được đưa vào cơ thể. Đối với một số các CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc như CYP2C9, CYP2C19 và CYP2D6, các biến thể di truyền trong các gen mã hóa cho protein có ảnh hưởng nhiều đến sự khác biệt trong hoạt tính của enzyme, trong khi đó đối với những CYP450 khác (CYP1A2, CYP3A4) thì tỉ lệ này không đáng kể. Các gen mã hóa cho các enzyme CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc có tính đa hình rất cao.

Sự đa dạng di truyền này được thể hiện ở những đa hình đơn nucleotide (Single nucleotide polymorphism-SNP) xuất hiện với tần số hiếm (rare) hoặc phổ biến (common), ngoài ra còn có các biến thể số bản sao (Copy number variant-CNV) bao gồm các mất/lặp đoạn. Chức năng của biến thể được phân loại từ không chức năng đến tăng cường chức năng, từ đó mà kiểu hình chuyển hóa được chia thành các cấp độ: chuyển hóa thuốc yếu (Poor Metabolizer-PM), chuyển hóa thuốc trung bình (Intermediate Metabolizer-IM), chuyển hóa thuốc bình thường (Extensive Metabolizer-EM) và chuyển hóa thuốc cực nhanh (Ultrarapid Metaolizer- UM). Những CYP450 tham gia vào chuyển hóa nhiều loại thuốc trên thị trường nhất hiện nay là CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A4/5. Năm gen CYP450 nói trên mã hóa cho các enzyme tham gia vào chuyển hóa 60-80% các loại thuốc thường được kê đơn.

2 Tính cấp thiết của vấn đề nghiên cứu: Sự khác nhau trong đáp ứng thuốc giữa các cá nhân là điều khó tránh khỏi trong điều trị, trong đó có các phản ứng có hại của thuốc (Adverse drugs reaction/ADR). Các ADR là một trong những nguyên nhân chính của các trường hợp bệnh nhân phải nhập viện, một số có thể dẫn tới tử vong. Ingelman-Sunberg và cộng sự đã ước tính ADR làm tiêu tốn khoảng 100 tỉ đô la Mỹ, đây cũng là nguyên nhân dẫn tới 100.000 ca tử vong mỗi năm tại Mỹ. Khoảng 7% các ca nhập viện tại Anh và Thụy Điển cũng có nguyên nhân từ các ADR.

Từ năm 2009, Hiệp hội ứng dụng Di truyền dược học lâm sàng (Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium- CPIC) đã cung cấp các thông tin về việc xét nghiệm di truyền có thể được sử dụng trong tối ưu hóa phác đồ sử dụng thuốc. Đối với một vài loại cặp gen-thuốc, CPIC cũng đã đưa ra những chỉ dẫn về liều dùng cụ thể. Như đã trình bày ở trên, các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 là 4 trong số các gen CYP450 có tính đa hình cao mà các dạng đa hình của chúng khiến cho bệnh nhân có khả năng chuyển hóa từng loại thuốc cụ thể rất khác nhau, từ mạnh tới yếu. Cho tới nay, các hiểu biết về đa dạng di truyền của nhóm gen CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc ở người Việt Nam còn rất hạn chế.

Ngày nay, vai trò của dược lý học di truyền liên quan đến chuyển hóa thuốc và tương tác thuốc trong lâm sàng mang tính cấp bách và rất cần đầu tư nghiên cứu. Hiểu biết về tính đa dạng di truyền của các gen tham gia chuyển hóa thuốc ở người Việt Nam được coi là tiền đề để phát triển lĩnh vực này. Nghiên cứu này tập trung vào việc phát hiện các allele đã biết cũng như xác định cả những allele mới ở người Việt Nam. Do vậy, số liệu thu được từ nghiên cứu sẽ cung cấp những thông tin khoa học về đa dạng di truyền của các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 trên người Việt Nam.

Đây cũng là những tiền đề có ý nghĩa và đóng góp một phần cho sự phát triển của lĩnh vực di truyền dược học và y học cá thể. Mục tiêu nghiên cứu: - Xây dựng cơ sở dữ liê ̣u về đa hình/đô ̣t biế n của 04 gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 ở người Kinh Viê ̣t Nam. - Xác định kiểu gen và tần số các allele của 04 gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 trên người Kinh ở Việt Nam đồ ng thời phân tích và dự đoán chức năng của các biế n thể mới. 3 Cách tiếp cận nghiên cứu: Đối tượng nghiên cứu là 136 người Kinh khỏe mạnh không có quan hệ huyết thống.

Nghiên cứu này sử dụng phương pháp giải trình tự Sanger nhằm xác định tất cả các biến thể nằm trong vùng promoter cùng với tất cả 9 exon và vùng biên của 03 gen CYP2C9, CYP2C19 và CYP2D6. Đối với gen CYP3A5, phương pháp giải trình tự Sanger cũng được áp dụng nhằm xác định các biến thể đã được công bố là có ảnh hưởng đến hoạt tính của enzyme bao gồm: *3, *6, *8 và *9. Các CNV của các gen nghiên cứu được xác định bằng phương pháp khuếch đại đa đầu dò phụ thuộc phản ứng ghép nối (Multiplex ligation-dependent probe amplification-MLPA). Những mẫu được xác định là có bất thường số bản sao được kiểm tra lại bằng phương pháp Long range PCR hoặc real-time PCR.

Các biến thể sau khi đã được xác định sẽ tiếp tục được tổng hợp số liệu để tính toán tần số allele cũng như tần số kiểu gen trên tổng số mẫu nghiên cứu đối với mỗi gen. Tiến hành so sánh về tần số và phân bố của các allele của mỗi gen ở quần thể người Kinh Việt Nam so với các quần thể người khác. Bên cạnh đó, những biến thể mới được tiến hành phân tích in silico nhằm dự đoán ảnh hưởng của các biến thể này đến chức năng của protein tương ứng. Những đóng góp mới của luận án: Xác định được một số biến thể mới trong promoter và intron của các gen CYP450, cụ thể: 5 biến thể mới trong in tron của CYP2C9, 3 biến thể mới trong intron của CYP2C19, 3 biến thể mới trong promoter và 2 biến thể mới trong intron của CYP2D6 và 3 biến thể mới thuộc vùng mã hóa của 2 gen CYP2C9 và CYP2D6.

Đã phân tích in silico cho thấy những biến thể này gây ảnh hưởng có hại đến chức năng của protein. Các biến thể CYP2D6*5, CYP2D6*10, CYP2D6*13 và CYP2D6*36-*10 đã được xác định trên người Kinh ở Việt Nam là những biến thể làm giảm hoặc mất hoạt tính của enzyme đã được xác định với tỉ lệ lần lượt là: 8,09%, 43,75%, 1,547% và 12,13%. CYP450 và chuyển hóa thuốc trong gan Thuốc là những chế phẩm có chứa dược chất dùng với mục đích phòng-chữa bệnh hay điều trị giảm nhẹ. Enzyme chuyển hóa thuốc được biết đến nhiều nhất là các enzyme CYP450, đây là những enzyme tham gia vào các quá trình oxi hóa khử và thủy phân.

Mục tiêu chính của quá trình chuyển hóa thuốc đó là giúp đào thải thuốc ra khỏi cơ thể. Ví dụ như các tiền chất (không có hoạt tính dược lý) sau khi được hấp thụ vào cơ thể sẽ được chuyển đổi thành thuốc có hoạt tính. Mặt khác đa số các loại thuốc sau khi chuyển hóa sẽ chuyển sang trạng thái kém hoạt động hơn. Quá trình chuyển hóa thuốc xảy ra ở nhiều cơ quan trong cơ thể như gan, thành ruột, phổi, thận và huyết tương.

Trong số đó, gan là cơ quan chuyển hóa thuốc đầu tiên, đóng vai trò như vị trí thải độc và loại thải các chất ngoại lai bằng cách biến đổi các hợp chất tan trong lipid trở nên ưa nước hơn, quá trình này có sự tham gia của các enzyme. Quá trình chuyển hóa thuốc tại gan trải qua 3 giai đoạn: pha I, pha II và pha III. Trong đó pha I có sự tham gia của các enzyme CYP450, pha II được thực hiện bởi các enzyme vận chuyển acid glucuronic của UDP (UDP-glucuronosyltransferase) (chuyển hóa 40-70% các loại thuốc) và trong pha III thì các enzyme vận chuyển thuốc (drug transporter) sẽ giúp đưa sản phẩm chuyển hóa thuốc tới mật. Klingenberg lần đầu tiên phát hiện ra CYP450 vào năm 1954 trong nghiên cứu về chuyển hóa hoocmon steroid, khi ông trích xuất một loại protein mới từ tế bào gan [1].

Gần một thập kỷ sau, chức năng và tầm quan trọng của CYP450 đã được xác định. Năm 1963, Estabrook và cộng sự đã mô tả vai trò của CYP450 như một chất xúc tác trong quá trình tổng hợp hormone steroid và chuyển hóa thuốc. Cooper và các đồng nghiệp sau đó đã xác nhận CYP450 là một enzyme chủ chốt liên quan đến phản ứng hydroxyl hóa thuốc và steroid [2]. Nhiều protein CYP450 đã được phát hiện rộng khắp cơ thể, chứng tỏ sự tham gia đáng kể vào hoạt hóa hóa học, khử hoạt tính và gây ung thư [3].

Các enzyme CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc pha I là các protein biểu hiện chủ yếu trên mạng lưới nội chất trơn và ti thể của các tế bào gan và biểu mô ruột non (ngoài ra cũng còn ở một số cơ quan khác). Ở người, có 115 gen CYP450 bao gồm 5 cả các gen giả, được đặt tên bắt đầu từ CYP1A1 và kết thúc bởi CYP51P3. Các protein được mã hóa bởi các CYP450 được phân loại dựa trên mức độ tương đồng về trình tự của các amino acid thành các cấp độ từ họ (ví dụ: họ CYP1, CYP2…), phân họ (ví dụ: phân họ CYP1A, CYP2B…) và từng enzyme riêng lẻ (ví dụ: enzyme CYP1A1, CYP2D6…). Trong số các CYP450 biểu hiện trong gan thì CYP3A4 có mức độ biểu hiện mạnh nhất (chiếm 22,1%), tiếp theo là 2 enzyme CYP2E1 (15,3%) và CYP2C9 (14,6%) tính trên tổng số protein trong gan.

Các enzyme CYP450 tham gia xúc tác cho nhiều loại phản ứng như: oxi hóa, oxi hóa sulpho (lưu huỳnh), hydroxyl hóa vòng (nhân) thơm, hydroxy hóa hợp chất không vòng, khử (tách) nhóm N-alkyl, khử (tách) nhóm O-alkyl (alkoxy). Trong số các phản ứng này, phản ứng oxi hóa là phản ứng giúp thêm một nguyên tử oxy vào phân tử thuốc, được biểu diễn bằng phương trình sau: NADPH + H+ + O2 + RH → NADP+ + H2O + ROH Về mặt cấu trúc, CYP450 là những protein có khoảng 400-500 amino acid và chứa một nhóm heme với nguyên tử Fe ở trung tâm. Tất cả các CYP450 đều có chung cấu trúc bảo thủ được tạo nên bởi bốn vòng xoắn D, L, I và E.

Nội dung được bảo vệ bản quyền — Tải xuống đầy đủ