Nghiên cứu chất ức chế hoạt tính protease HIV-1 từ dịch chiết lá thạch châu, ổi và ma hoàng

Luận văn thạc sĩ phân tích hus nghiên cứu chất ức chế hoạt tính protease hiv 1 từ dịch chiết của lá cây thạch châu pyrenaria, đánh giá thực trạng, chỉ ra hạn chế, đề xuất giải

• Tác giả: Nguyễn Hồng Anh
• Người hướng dẫn: TS. Nguyễn Thị Hồng Loan
• Trường học: Trường Đại Học Khoa Học Tự Nhiên
• Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm
• Đề tài: Nghiên cứu chất ức chế hoạt tính protease HIV-1 từ dịch chiết của lá cây Thạch châu (Pyrenaria jonqueriana), Ổi (Psidium guajava) và Ma hoàng (Ephedra distachya)
• Loại tài liệu: Luận văn thạc sĩ
• Năm xuất bản: 2015
• Địa điểm: Hà Nội

Mục lục chi tiết

• LỜI CẢM ƠN
• MỞ ĐẦU
• 1. CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• 1.1. GIỚI THIỆU CHUNG VỀ HIV VÀ PROTEASE CỦA HIV-1
• 1.1.1. Giới thiệu chung về HIV
• 1.1.2. Cấu trúc và chức năng của protease HIV-1
• 1.1.3. Phân tích hoạt độ của protease HIV-1
• 1.2. CÁC CHẤT ỨC CH PROTEASE HIV-1 VÀ ỨNG DỤNG TRONG ĐIỀU TRỊ AIDS
• 1.2.1. Chất ức chế protease HIV-1 có nguồn gốc hoá học
• 1.2.2. Chất ức chế protease HIV-1 có nguồn gốc tự nhiên
• 1.3. NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 1.3.1. Mẫu dƣợc liệu
• 1.3.2. Các hoá chất, nguyên liệu khác
• 1.4. MÁY MÓC VÀ TRANG THIẾT BỊ
• 1.5. PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 1.5.1. Phân tách các hợp chất từ dịch chiết thực vật
• 1.5.2. Xác định cấu trúc của chất đƣợc phân tách
• 1.5.3. Xác định hoạt tính ức chế pepsin bằng phƣơng pháp khuếch tán trên đĩa thạch có chứa cơ chất hemoglobin
• 1.5.4. Xác định hoạt tính ức chế pepsin theo phƣơng pháp Anson cải tiến
• 1.5.5. Xác định hoạt tính protease HIV-1 sử dụng cơ chất peptide đặc hiệu
• 1.6. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• 1.6.1. ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ PROTEASE HIV-1 CỦA THẠCH CHÂU (PYRENARIA JONQUERIANA PIERRE.), ỔI (PSIDIUM GUAJAVA L.) VÀ MA HOÀNG (EPHEDRA DISTACHYA L.)
• 1.6.2. TINH SẠCH VÀ ĐÁNH GIÁ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ PROTEASE HIV-1 CỦA HỢP CHẤT TỪ DỊCH CHIẾT LÁ CÂY ỔI (PSIDIUM GUAJAVA L.)
• 1.6.3. NGHIÊN CỨU MỘT SỐ TÍNH CHẤT CỦA ACID URSOLIC
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC

Tóm tắt

I. Tổng quan về nghiên cứu chất ức chế protease HIV 1 từ lá thạch châu ổi và ma hoàng

Nghiên cứu về chất ức chế protease HIV-1 từ các loại thực vật như lá thạch châu, ổi và ma hoàng đang thu hút sự chú ý của cộng đồng khoa học. HIV-1 là một trong những virus gây ra đại dịch AIDS, và việc tìm kiếm các chất ức chế hiệu quả từ thiên nhiên là một hướng đi tiềm năng trong điều trị. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng các hợp chất tự nhiên có thể có tác dụng ức chế mạnh mẽ đối với hoạt tính của protease HIV-1, từ đó ngăn chặn sự phát triển của virus. Việc khai thác nguồn dược liệu phong phú tại Việt Nam có thể mở ra những cơ hội mới trong việc phát triển thuốc điều trị HIV.

1.1. Giới thiệu về HIV 1 và tầm quan trọng của protease

HIV-1 là virus chính gây ra bệnh AIDS, và protease của nó đóng vai trò quan trọng trong quá trình tái bản của virus. Protease giúp cắt các polyprotein thành các protein chức năng cần thiết cho sự phát triển của virus. Việc ức chế hoạt động của protease HIV-1 có thể ngăn chặn sự lây lan của virus, từ đó giúp cải thiện tình trạng sức khỏe của bệnh nhân.

1.2. Tại sao cần nghiên cứu chất ức chế từ thiên nhiên

Việc phát triển các chất ức chế protease HIV-1 từ thiên nhiên không chỉ giúp tìm ra những phương pháp điều trị mới mà còn giảm thiểu tác dụng phụ so với các thuốc tổng hợp. Các hợp chất tự nhiên thường có tính an toàn cao hơn và ít gây ra hiện tượng kháng thuốc, điều này rất quan trọng trong điều trị HIV-1.

II. Thách thức trong việc phát triển chất ức chế protease HIV 1

Mặc dù có nhiều nghiên cứu về chất ức chế protease HIV-1, nhưng vẫn tồn tại nhiều thách thức trong việc phát triển và ứng dụng chúng. Một trong những thách thức lớn nhất là sự xuất hiện của các chủng virus kháng thuốc. Việc thiết kế các chất ức chế mới cũng gặp khó khăn do tính đa dạng và khả năng đột biến cao của virus. Hơn nữa, việc sàng lọc và xác định các hợp chất có hoạt tính ức chế từ hàng ngàn mẫu thực vật là một quá trình tốn thời gian và công sức.

2.1. Sự kháng thuốc của HIV 1

HIV-1 có khả năng đột biến cao, dẫn đến sự xuất hiện của các chủng kháng thuốc. Điều này làm giảm hiệu quả của các liệu pháp điều trị hiện tại, bao gồm cả các chất ức chế protease. Việc nghiên cứu các chất ức chế mới từ thiên nhiên có thể giúp vượt qua vấn đề này.

2.2. Khó khăn trong việc sàng lọc hợp chất

Quá trình sàng lọc các hợp chất từ thực vật để tìm ra chất ức chế protease HIV-1 là một thách thức lớn. Cần có các phương pháp phân tích hiện đại và chính xác để xác định hoạt tính của các hợp chất này, từ đó phát triển các sản phẩm điều trị hiệu quả.

III. Phương pháp nghiên cứu chất ức chế protease HIV 1 từ lá thạch châu ổi và ma hoàng

Nghiên cứu này sử dụng các phương pháp hiện đại để phân tích và xác định hoạt tính của các chất ức chế từ lá thạch châu, ổi và ma hoàng. Các mẫu dược liệu được chiết xuất và phân tích bằng các kỹ thuật như sắc ký lỏng hiệu năng cao (HPLC) và khối phổ (MS). Các phương pháp này giúp xác định cấu trúc và hoạt tính của các hợp chất có khả năng ức chế protease HIV-1.

3.1. Quy trình chiết xuất và phân tích hợp chất

Quy trình chiết xuất các hợp chất từ lá thạch châu, ổi và ma hoàng bao gồm các bước như thu hái, làm khô, chiết xuất bằng dung môi và phân tích bằng HPLC. Các hợp chất thu được sẽ được kiểm tra hoạt tính ức chế protease HIV-1 để xác định hiệu quả của chúng.

3.2. Đánh giá hoạt tính ức chế protease HIV 1

Hoạt tính ức chế protease HIV-1 được đánh giá thông qua các phương pháp như khuếch tán trên đĩa thạch và phương pháp Anson cải tiến. Các kết quả thu được sẽ giúp xác định khả năng ức chế của từng hợp chất và so sánh hiệu quả giữa các mẫu.

IV. Kết quả nghiên cứu và ứng dụng thực tiễn

Kết quả nghiên cứu cho thấy các dịch chiết từ lá thạch châu, ổi và ma hoàng có khả năng ức chế hoạt tính của protease HIV-1. Các hợp chất này không chỉ có tác dụng ức chế mạnh mà còn an toàn cho sức khỏe con người. Việc phát triển các sản phẩm từ các hợp chất này có thể mở ra hướng đi mới trong điều trị HIV-1, giúp cải thiện chất lượng cuộc sống cho bệnh nhân.

4.1. Khả năng ức chế của dịch chiết lá thạch châu

Dịch chiết từ lá thạch châu cho thấy hoạt tính ức chế mạnh mẽ đối với protease HIV-1. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng các hợp chất trong lá thạch châu có thể ngăn chặn sự phát triển của virus, từ đó hỗ trợ điều trị HIV hiệu quả.

4.2. Tác dụng của lá ổi và ma hoàng

Lá ổi và ma hoàng cũng cho thấy khả năng ức chế protease HIV-1 đáng kể. Các hợp chất trong hai loại lá này có thể được phát triển thành các sản phẩm điều trị, góp phần vào việc kiểm soát dịch bệnh HIV/AIDS.

V. Kết luận và triển vọng tương lai trong nghiên cứu chất ức chế HIV 1

Nghiên cứu về chất ức chế protease HIV-1 từ lá thạch châu, ổi và ma hoàng mở ra nhiều triển vọng trong việc phát triển các phương pháp điều trị mới cho bệnh nhân HIV/AIDS. Việc khai thác nguồn dược liệu tự nhiên không chỉ giúp tìm ra các chất ức chế hiệu quả mà còn góp phần bảo tồn và phát triển y học cổ truyền. Tương lai của nghiên cứu này hứa hẹn sẽ mang lại những kết quả tích cực trong việc điều trị HIV-1.

5.1. Hướng đi mới trong điều trị HIV

Việc phát triển các chất ức chế từ thiên nhiên có thể là một giải pháp hiệu quả trong điều trị HIV-1. Các nghiên cứu tiếp theo cần tập trung vào việc tối ưu hóa các hợp chất này để nâng cao hiệu quả điều trị.

5.2. Tầm quan trọng của nghiên cứu dược liệu tự nhiên

Nghiên cứu dược liệu tự nhiên không chỉ giúp phát triển các sản phẩm điều trị mới mà còn bảo tồn các giá trị văn hóa và y học cổ truyền. Việc kết hợp giữa y học hiện đại và y học cổ truyền có thể mang lại những lợi ích lớn cho sức khỏe cộng đồng.

Trích đoạn nội dung tài liệu

MỞ ĐẦU Hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải (AIDS) gây ra bởi virus gây suy giảm miễn dịch ở ngƣời (HIV). Đây là virus thuộc họ Retroviridae và có hai type chính là HIV-1 và HIV-2, trong đó type 1 xuất hiện phổ biến và là nguyên nhân chính gây ra AIDS ở ngƣời. Cho đến nay, dù đã có những chƣơng trình hành động toàn cầu cùng với sự phát triển của các phƣơng pháp điều trị, AIDS vẫn là đại dịch của toàn nhân loại và cần thiết phải tăng cƣờng các biện pháp phòng ngừa, điều trị bệnh hiệu quả. Trong phòng chống nhiễm HIV-1, phát triển vaccine gặp rất nhiều khó khăn và thƣờng thất bại do thời gian ủ bệnh của HIV-1 dài, thƣờng xuyên xảy ra đột biến ở vùng gen mã hóa cho kháng nguyên.

Vì vậy, cho đến hiện nay, ngƣời nhiễm HIV-1 muốn kéo dài cuộc sống chỉ có con đƣờng duy nhất là sử dụng liệu pháp dùng thuốc kháng retrovirus (ART) [39]. Trong chu trình tái bản của HIV-1, protease là enzyme có tác dụng phân cắt các polyprotein tiền thân gag và gag-pol thành những protein cấu trúc và chức năng trong quá trình trƣởng thành của virus. Khi ức chế hoạt tính của protease hoặc gây đột biến trên gen mã hóa cho protease, các hạt virus vẫn hình thành nhƣng không đƣợc đóng gói phù hợp để tạo thành virus hoàn chỉnh nên chúng không có khả năng xâm nhiễm vào tế bào vật chủ [26]. Vì vậy, một số chất ức chế protease HIV-1 (PI) đã đƣợc phát triển thành thuốc điều trị bệnh nhân HIV/AIDS.

Tuy nhiên, việc sử dụng thuốc trong thời gian dài với nồng độ cao cùng với tốc độ đột biến lớn của HIV-1 dẫn đến sự xuất hiện các chủng virus kháng thuốc là một trong những nguyên nhân chính gây thất bại điều trị với ART nói chung và PI nói riêng. Hơn nữa, việc thiết kế các chất PI mới không phải dễ dàng, không định hƣớng, phải sàng lọc trên số lƣợng khá lớn các hợp chất thiết kế tƣơng tự nhau trên cơ sở hiểu biết về cấu trúc và chức năng của protease HIV-1. Mặt khác, những chất này nhiều khi không thân thiện với con ngƣời, phải trải qua nhiều bƣớc thử nghiệm. Chính vì vậy, bên cạnh các thuốc tổng hợp hóa học, các nhà khoa học trên thế giới cũng không ngừng tìm kiếm và chọn lọc các chất tự nhiên từ dịch chiết thực vật có tác dụng ức chế protease của HIV-1 (protease HIV-1).

1 LUAN VAN CHAT LUONG download : add [e-mail] Việt Nam với nguồn thực vật phong phú và nhiều cây thuốc, vị thuốc có giá trị lớn với sức khỏe con ngƣời. Theo thống kê của Viện Dƣợc liệu, Việt Nam có hơn 12.000 loài thực vật, trong đó có gần 4.000 loài đƣợc dùng làm thuốc trong y học dân gian và y học cổ truyền. Nhƣ vậy, thực vật Việt Nam cũng s là nguồn nguyên liệu phong phú để sàng lọc và xác định các hoạt chất ức chế protease HIV-1, làm cở sở cho việc phát triển thuốc điều trị cho bệnh nhân HIV/AIDS. Tuy nhiên, cho đến nay chúng ta chƣa khai thác nguồn tài nguyên phong phú của đất nƣớc theo hƣớng này.

Xuất phát từ những thực tế trên, chúng tôi tiến hành đề tài “Nghiên cứu chất ức chế hoạt tính protease HIV-1 từ dịch chiết của lá cây Thạch châu (Pyrenaria jonqueriana), Ổi (Psidium guajava) và Ma hoàng (Ephedra distachya)” nhằm thu nhận đƣợc chất ức chế protease HIV-1 có nguồn gốc từ dƣợc liệu Việt Nam. 2 LUAN VAN CHAT LUONG download : add [e-mail] Chƣơng 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1. GIỚI THIỆU CHUNG VỀ HIV VÀ PROTEASE CỦA HIV-1 1.

Giới thiệu chung về HIV Đại dịch HIV/AIDS đã và đang là một thách thức to lớn đối với tiến trình phát triển xã hội. Sau 3 thập kỷ phát hiện mà đầu tiên là ở các nƣớc phát triển, HIV/AIDS đã lan rộng trên toàn thế giới, đặc biệt ở khu vực châu Phi và các nƣớc châu Á. Đến nay vẫn chƣa có vaccine phòng ngừa HIV hay thuốc chữa trị AIDS đặc hiệu. Theo chƣơng trình HIV/AIDS của Liên hiệp quốc (UNAIDS, 2015), tính đến cuối năm 2014, thế giới có khoảng 36,9 triệu ngƣời (dao động trong khoảng từ 34,3 triệu đến 41,4 triệu) đang mang căn bệnh AIDS, trong đó số đối tƣợng nhiễm mới là 2 triệu ngƣời và có khoảng 1,2 triệu bệnh nhân đã chết vì AIDS trong năm 2014.

Khu vực các nƣớc Châu Phi gần Sahara (Sub-Saharan Africa) vẫn là nơi có số ngƣời nhiễm HIV cao nhất trên thế giới với hơn 2/3 dân số, tiếp đến là châu Á Thái Bình Dƣơng với 5,0 triệu ngƣời nhiễm HIV [91]. Ở Việt Nam, theo số liệu mới nhất của Cục phòng chống HIV/AIDS, Bộ Y tế (Báo cáo số 561/BC-BYT của Cục phòng chống HIV/AIDS, ngày 18/6/2015) trong 6 tháng đầu năm 2015, số ngƣời xét nghiệm phát hiện mới nhiễm HIV là 3.204 ngƣời, số ngƣời nhiễm HIV chuyển sang giai đoạn AIDS là 1.326 ngƣời, số ngƣời nhiễm HIV tử vong là 438 và số tử vong báo cáo bổ sung quý II/2015 là 1500 ngƣời. Lũy tích số ngƣời nhiễm HIV đang còn sống 227.114 ngƣời, số bệnh nhân AIDS là 71.115 và số tử vong là 74. Nhìn chung, lây truyền HIV/AIDS qua đƣờng tình dục ngày càng gia tăng liên tục từ 2007 trở lại đây; số ngƣời nhiễm HIV phát hiện mới tiếp tục có xu hƣớng giảm, nhƣng lũy tích số ngƣời nhiễm HIV còn sống tiếp tục gia tăng.

Trong phòng chống nhiễm HIV/AIDS, phƣơng thức điều trị phổ biến nhất hiện nay vẫn là liệu pháp dùng thuốc chống virus (ART-antiretroviral drug therapy) bao gồm thuốc ức chế reverse transcriptase, thuốc ức chế integrase và thuốc ức chế 3 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail. Trong đó, protease đƣợc mã hóa bởi gen pol của virus có chức năng cắt các chuỗi polyprotein (gag, gag-pol) tại những vị trí nhất định để tạo thành các protein cấu trúc và chức năng cần thiết cho virus hoàn chỉnh. Nếu protease bị mất hoạt tính, HIV-1 không đƣợc đóng gói phù hợp để tạo virus hoàn chỉnh [26]. Vì vậy, protease của HIV-1 (protease HIV-1) là một trong những đích quan trọng để phát triển thuốc điều trị AIDS.

Cấu trúc và chức năng của protease HIV-1 Về cấu trúc, protease HIV-1 là một protease aspartyl (có chứa gốc aspartic trong trung tâm hoạt động), họ retropepsin A 2. Năm 1989, Navia và tập thể từ phòng thí nghiệm của Merck là nhóm đầu tiên công bố cấu trúc tinh thể của protease HIV-1. Sau đó, một cấu trúc chính xác hơn đã đƣợc báo cáo bởi Kent và tập thể [16]. Đến năm 2010, với sự đóng góp đáng kể của phƣơng pháp nhiễu xạ tia X, hơn 400 cấu trúc của protease HIV-1 (kiểu dại và dạng đột biến) trong phức hệ với các chất ức chế khác nhau đã đƣợc làm sáng tỏ.

Những dẫn liệu này giúp các nhà nghiên cứu có đƣợc hiểu biết sâu sắc về các kiểu liên kết của enzyme với chất ức chế và cơ sở phân tử của kháng thuốc [10, 83]. Protease HIV-1 là một homodimer, mỗi monomer gồm 99 acid amin và đƣợc sắp xếp gần nhƣ theo kiểu đối xứng. Mô hình cấu trúc bậc hai đƣợc thể hiện rõ ràng ở phiến nếp gấp β và một đoạn xoắn α ngắn gần đầu C [37]. Cấu tạo của protease HIV-1 có thể chia thành ba vùng chính: vùng dimer hóa, vùng lõi và vùng mũ (Hình 1.

Trong đó, vùng dimer hóa đƣợc hình thành nhờ tƣơng tác giữa 8 gốc acid amin 1 - 4 (vùng N đầu cùng) và 96 - 99 (vùng C tận cùng) từ mỗi monomer và các acid amin trong trung tâm hoạt động 24 - 29. Các gốc acid amin này là 2 đầu C của phiến gấp nếp β đƣợc cấu tạo theo nguyên tắc các acid amin kỵ nƣớc Pro1, Ile3, Leu97 và Phe99 hƣớng vào nội phân tử enzyme còn các gốc phân cực Gln2, Thr4, Thr96 và Asn98 thì quay ra ngoài tiếp xúc với dung môi [22]. Bốn gốc ở đầu C tận cùng tham gia vào tƣơng tác giữa các chuỗi để duy trì sự ổn định của cấu trúc dimer, bao gồm 34 liên kết hydro và 4 cầu muối. Tƣơng tác 4 LUAN VAN CHAT LUONG download : add [e-mail] giữa các gốc Ile50 và Gly51’; Asp29, Arg87 và Arg88’ cũng ảnh hƣởng đến sự ổn định của cấu trúc dimer.

Khi enzyme gắn thêm chất ức chế hoặc cơ chất, sự ổn định của cấu trúc dimer đƣợc tăng cƣờng. Vùng lõi gồm 4 đầu N sợi β (các gốc acid amin 10 - 32 và 63 - 85 của mỗi monomer) có vai trò quan trọng đối với sự ổn định cấu trúc dimer và hoạt tính xúc tác của enzyme. Trung tâm hoạt động của enzyme nằm trong vùng lõi và bao gồm ba gốc acid amin từ mỗi monomer. Vùng mũ đƣợc mở rộng tạo thành một vùng gấp xuống đóng vai trò giống nhƣ một giá đỡ cho chuyển động của vùng mũ.

Vùng mũ nằm ở phần rộng nhất của enzyme bao gồm các acid amin từ 33 - 43 và 44 - 63 bao quanh trung tâm hoạt động. Đầu N của vùng này rất giàu glycine, do đó tăng cƣờng tính linh hoạt về hình dáng của các enzyme ở dạng tự do [37, 78, 85]. Cấu trúc dạng dimer (A) và cấu trúc chi tiết (B) của protease HIV-1 [43] (Vùng dimer hóa (D), vùng mũ (F), và trung tâm hoạt động (A)) Trung tâm hoạt động của protease chứa bộ ba Asp - Thr - Gly nằm tại mặt phân giới của dimer. Tại một monomer nhóm bộ ba xúc tác đƣợc đặt ở vị trí 25 - 26 - 27 và do tính đối xứng ở monomer còn lại là 25’ - 26’ - 27’.

Trung tâm hoạt động đƣợc làm ổn định nhờ mạng lƣới các liên kết hydro giữa các gốc acid amin chính tại vị trí này với các gốc acid amin xung quanh. Cấu trúc khắt khe của trung tâm hoạt động là do gốc Thr26 hình thành các liên kết hydro với nhóm amin của Thr26' và với nhóm oxygen carbonyl của Leu24 nằm ở bên cạnh gốc Asp đóng vai trò xúc tác. Mỗi gốc Asp25 cũng đƣợc liên kết với nhóm NH của Gly27'. Phân tử Asp là cần thiết cho cả cấu trúc và hoạt tính xúc tác của protease.

Vai trò quan trọng của Asp25 đƣợc làm rõ khi thay thế Asp bằng các acid amin khác dẫn đến enzyme bị bất hoạt [27]. 5 LUAN VAN CHAT LUONG download : add [e-mail] Để làm rõ cơ sở phân tử và đánh giá những tiềm năng của một chất ức chế chống lại sự kháng thuốc, Hou và tập thể đã tiến hành nghiên cứu vai trò của các gốc riêng biệt trên phân tử protease HIV-1 dựa trên sự kết hợp giữa enzyme với 6 loại cơ chất và 8 chất ức chế đƣợc FDA công nhận. Nghiên cứu đã chỉ ra rằng sự đóng góp của các gốc khác nhau vào liên kết giữa enzyme với cơ chất là khác nhau.