Phân tích đa hình di truyền các gene CSN1S1 và β-LG của dê Nản Định Hóa sử dụng kỹ thuật PCR-RFLP

• Tác giả: Nguyễn Thanh Sơn
• Người hướng dẫn: TS. Nguyễn Xuân Vũ
• Trường học: Đại học Thái Nguyên
• Chuyên ngành: Công nghệ sinh học
• Đề tài: Phân Tích Đa Hình Di Truyền Gene CSN1S1 Và β-LG Ở Dê Nản Định Hóa Bằng PCR-RFLP
• Loại tài liệu: khóa luận tốt nghiệp
• Năm xuất bản: 2018
• Địa điểm: Thái Nguyên

• LỜI CẢM ƠN
• DANH MỤC TỪ VÀ THUẬT NGỮ VIẾT TẮT
• DANH MỤC BẢNG
• DANH MỤC HÌNH
• 1. PHẦN 1: MỞ ĐẦU
• 1.1. Đặt vấn đề
• 1.2. Mục tiêu của đề tài
• 1.2.1. Mục tiêu tổng quát
• 1.2.2. Mục tiêu cụ thể
• 1.3. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn
• 1.3.1. Ý nghĩa khoa học của đề tài
• 1.3.2. Ý nghĩa thực tiễn của đề tài
• 2. PHẦN 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• 2.1. Tổng quan về đối tượng nghiên cứu
• 2.2. Tổng quan về dê Nản
• 2.3. Tổng quan về sữa
• 2.4. Gene CSN1S1 - Alpha-S1 Casein
• 2.4.1. Nguồn gốc, cấu tạo và chức năng của gene CSN1S1
• 2.4.2. Các dạng allele của gene CSN1S1
• 2.4.3. Đa hình đoạn cắt gene CSN1S1 bằng enzyme giới hạn XmnI
• 2.4.4. Vị trí cắt đa hình của enzyme giới hạn XmnI trên đoạn gene CSN1S1
• 3. ĐỐI TƯỢNG, NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 3.1. Đối tượng nghiên cứu
• 3.2. Địa điểm và thời gian tiến hành nghiên cứu
• 3.3. Nội dung nghiên cứu
• 3.4. Phương pháp nghiên cứu
• 3.4.1. Phương pháp lấy mẫu
• 3.4.2. Phương pháp tách chiết DNA
• 3.4.3. Phương pháp PCR
• 3.4.4. Phương pháp cắt bằng enzyme giới hạn
• 3.4.5. Phân tích đa hình các gene
• 3.4.6. Các phương pháp xử lý số liệu
• 3.5. Dụng cụ, thiết bị và hóa chất nghiên cứu
• 3.5.1. Dụng cụ nghiên cứu
• 3.5.2. Thiết bị nghiên cứu
• 3.5.3. Hóa chất nghiên cứu
• 4. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN
• 4.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số từ mẫu mô tai dê Nản
• 4.2. Kết quả phân tích đa hình chiều dài đoạn gene CSN1S1
• 4.3. Kết quả PCR khuyếch đại gene CSN1S1 bằng cặp mồi đặc hiệu
• 4.4. Kết quả phân tích đa hình đoạn gene CSN1S1 bằng enzyme XmnI
• 4.5. Kết quả phân tích đa hình chiều dài gene β-LG
• 4.6. Kết quả PCR khuyếch đại gene β-LG bằng cặp mồi đặc hiệu
• 4.7. Kết quả phân tích đa hình đoạn gene β-LG bằng enzyme SacII
• 5. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC II

I. Phân tích gene

Nghiên cứu tập trung vào phân tích gene CSN1S1 và β-LG ở dê Nản Định Hóa bằng kỹ thuật PCR-RFLP. Phân tích di truyền này nhằm xác định đa hình di truyền của các gene liên quan đến chất lượng sữa và sinh trưởng của dê. Kỹ thuật PCR-RFLP được sử dụng để khuyếch đại và phân tích các đoạn gene, giúp xác định các allele khác nhau. Kết quả phân tích sẽ cung cấp thông tin quan trọng về sự đa dạng di truyền trong quần thể dê Nản, từ đó hỗ trợ công tác bảo tồn và chọn giống.

1.1. Kỹ thuật PCR RFLP

Kỹ thuật PCR-RFLP là phương pháp hiệu quả để phân tích đa hình di truyền. Quy trình bao gồm khuyếch đại đoạn gene bằng PCR và cắt bằng enzyme giới hạn. Kết quả điện di cho phép xác định các allele khác nhau dựa trên kích thước đoạn cắt. Phương pháp này đã được áp dụng thành công trong nghiên cứu gene CSN1S1 và β-LG, giúp xác định các allele liên quan đến chất lượng sữa và sinh trưởng của dê.

II. Đa hình di truyền

Nghiên cứu xác định đa hình di truyền của gene CSN1S1 và β-LG ở dê Nản Định Hóa. Đa hình di truyền được thể hiện qua sự khác biệt trong trình tự nucleotide của các allele. Kết quả phân tích cho thấy sự đa dạng allele của gene CSN1S1 và β-LG, với các allele A, B, F, N được xác định. Sự đa dạng này có ý nghĩa quan trọng trong việc chọn lọc giống dê có chất lượng sữa và sinh trưởng tốt.

2.1. Gene CSN1S1

Gene CSN1S1 mã hóa protein α-S1 Casein, một thành phần quan trọng trong sữa. Nghiên cứu xác định các allele của gene này, bao gồm A, B, F, N, với mức biểu hiện khác nhau. Các allele A và B có mức biểu hiện mạnh, trong khi allele F và N có mức biểu hiện yếu hoặc không biểu hiện. Kết quả này giúp hiểu rõ hơn về ảnh hưởng của đa hình di truyền đến chất lượng sữa.

2.2. Gene β LG

Gene β-LG mã hóa protein β-lactoglobulin, liên quan đến sản lượng và chất lượng sữa. Nghiên cứu xác định các allele của gene này, cho thấy sự đa dạng di truyền trong quần thể dê Nản. Kết quả phân tích đa hình di truyền của gene β-LG cung cấp thông tin quan trọng cho việc chọn lọc giống dê có sản lượng sữa cao.

III. Ứng dụng thực tiễn

Nghiên cứu có ý nghĩa thực tiễn trong việc bảo tồn và phát triển giống dê Nản Định Hóa. Phân tích di truyền giúp xác định các allele có lợi, hỗ trợ công tác chọn lọc giống. Kết quả nghiên cứu cung cấp cơ sở khoa học để phát triển các giống dê có chất lượng sữa và sinh trưởng tốt, đáp ứng nhu cầu thị trường.

3.1. Bảo tồn giống

Nghiên cứu góp phần vào công tác bảo tồn giống dê Nản Định Hóa. Phân tích đa hình di truyền giúp xác định các cá thể có gene tốt, từ đó duy trì và phát triển quần thể dê thuần chủng. Điều này đặc biệt quan trọng trong bối cảnh số lượng dê Nản đang giảm mạnh.

3.2. Chọn lọc giống

Kết quả nghiên cứu hỗ trợ công tác chọn lọc giống dê có chất lượng sữa và sinh trưởng tốt. Phân tích di truyền giúp xác định các allele có lợi, từ đó chọn ra các cá thể tốt nhất để làm giống. Điều này góp phần nâng cao hiệu quả chăn nuôi và phát triển kinh tế.