Nghiên cứu xác định các gen alen đặc thù liên quan đến sự phát triển bộ rễ của giống lúa Việt Nam

Người đăng

Ẩn danh

Thể loại

luận văn

2019

205
2
0

Phí lưu trữ

55 Point

Mục lục chi tiết

LỜI CAM ĐOAN

LỜI CẢM ƠN

MỤC LỤC

DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT

DANH MỤC BẢNG

DANH MỤC HÌNH

TRÍCH YẾU LUẬN ÁN

1. CHƯƠNG 1: MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU

1.1. Mục tiêu nghiên cứu của đề tài

1.2. Phạm vi nghiên cứu

1.3. Những đóng góp mới của đề tài

1.4. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của đề tài

2. CHƯƠNG 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU

2.1. Tổng quan tài liệu

2.2. Vai trò và đặc điểm bộ rễ lúa

2.2.1. Vai trò của bộ rễ cây lúa

2.2.2. Đặc điểm cấu trúc của bộ rễ lúa

2.2.3. Đặc điểm phát triển của bộ rễ lúa

2.3. QTLs và Gen liên quan đến sự phát triển bộ rễ lúa

2.3.1. Các QTLs liên quan đến sự phát triển bộ rễ lúa

2.3.2. Các gen liên quan đến sự hình thành và phát triển bộ rễ lúa

2.4. Nguyên lý và ứng dụng của GBS

2.4.1. Phương pháp giải trình tự NGS – nền tảng của GBS

2.4.2. Nguyên lý của phương pháp GBS

2.4.3. Các ứng dụng của GBS trong chọn giống cây trồng

2.5. Nguyên lý và ứng dụng của GWAS

2.5.1. GWAS là một công cụ mới hữu hiệu

2.5.2. Các bước xây dựng một nghiên cứu GWAS

2.5.3. Ý nghĩa và tiềm năng của GWAS trong chọn tạo giống lúa

3. CHƯƠNG 3: NGUỒN GEN VÀ TÌNH HÌNH NGHIÊN CỨU LÚA VIỆT NAM

3.1. Nguồn gen lúa Việt Nam

3.2. Tình hình nghiên cứu đặc điểm bộ rễ lúa Việt Nam

4. CHƯƠNG 4: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

4.1. Thời gian nghiên cứu

4.2. Vật liệu nghiên cứu

4.3. Nội dung nghiên cứu

4.4. Phương pháp nghiên cứu

4.4.1. Chiết tách ADN tổng số

4.4.2. Phân tích đa dạng di truyền bằng chất đánh dấu DArT

4.4.3. Phân tích kiểu gen thông qua giải trình tự (GBS)

4.4.4. Phân tích cấu trúc di truyền của tập đơn mẫu giống nghiên cứu

4.4.5. Xác định mức độ phân rã của LD (Linkage Disequilibrium)

4.4.6. Đánh giá đặc điểm nông sinh học

4.4.7. Phương pháp đánh giá kiểu hình bộ rễ

4.4.8. Lập bản đồ liên kết (GWAS)

4.4.9. Phương pháp xác định các gen ứng viên

5. CHƯƠNG 5: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN

5.1. Đặc điểm của bộ sưu tập giống lúa

5.2. Đặc điểm thu được qua thông tin hồ sơ mẫu giống

5.3. Đặc điểm nông sinh học cơ bản

5.4. Kết quả phân tích đa dạng di truyền với chất đánh dấu DArT

5.5. Kết quả phân tích đa hình và cấu trúc di truyền

5.6. Xây dựng cây phân loại cho các giống lúa nghiên cứu

5.7. Kết quả phân tích kiểu gen thông qua giải trình tự (GBS – Genotyping by sequencing)

5.8. Kết quả phân tích đa hình và cấu trúc di truyền với SNPs marker

5.9. Đặc điểm của các mẫu giống lúa trong các phân nhóm khác nhau

5.10. Kết quả phân tích Linkage Disequilibrium (LD)

5.11. Kết quả đánh giá kiểu hình các tính trạng liên quan đến sự phát triển bộ rễ các mẫu giống nghiên cứu

5.12. Kết quả phân tích phương sai với các thống kê cơ bản

5.13. Kết quả phân tích thành phần chính

5.14. Kết quả phân tích liên kết toàn hệ gen (GWAS)

5.15. Các QTLs liên kết với tính trạng liên quan đến sự phát triển bộ rễ

5.16. Các gen ứng viên liên quan đến đặc điểm phát triển bộ rễ

5.17. Điểm đặc biệt của vùng QTLs liên kết với NCR trên NST số 11

6. CHƯƠNG 6: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ

DANH SÁCH CÁC CÔNG TRÌNH LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN

TÀI LIỆU THAM KHẢO

Luận án tiến sĩ xác định các gen alen đặc thù liên quan đến sự phát triển bộ rễ của các giống lúa việt nam