Chương 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU 3 1. Đặc điểm hình thái và trình tự gen phân loại của cây Bách bộ 3 1. Đặc điểm hình thái 3 1.
Trình tự một số gen phân loại cây Bách bộ 3 1. Thành phần hóa học của Bách bộ 9 1. Một số bài thuốc có nguồn gốc từ Bách bộ 10 Chương 2. ĐỐI TƯỢNG, ĐỊA ĐIỂM, NỘI DUNG, VẬT LIỆU VÀ 12 PHƯƠNG PHÁP 2.
Vật liệu, hóa chất và thiết bị 12 2. Đối tượng, địa điểm và vật liệu nghiên cứu 12 2. Phương pháp nghiên cứu 13 2. Mô tả đặc điểm hình thái 13 2.
Phương pháp lập tiêu bản giải phẫu lá, thân, rễ 13 2. Phương pháp tách DNA 13 2. Phương pháp nghiên cứu sinh học phân tử. Phương pháp chạy điện di kiểm tra sản phẩm PCR 15 2.
Phương pháp tinh sạch sản phẩm PCR 15 2. Phương pháp xác định trình tự nucleotide của đoạn gen matK, rbcL 15 2. Phương pháp định lượng alkalod toàn phần trong dược liệu Bách bộ 16 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 17 3. Đặc điểm hình thái cây Bách bộ 17 3.
Đặc điểm giải phẫu cuống lá, thân, rễ cây Bách bộ 21 3. Đặc điểm giải phẫu cuống lá 21 iii 3. Đặc điểm giải phẫu của thân Bách bộ 22 3. Đặc điểm giải phẫu của rễ Bách bộ 23 3.
Kết quả phân tích đoạn gen matK và rbcL của cây Bách bộ 25 3. Kết quả tách chiết DNA tổng số từ lá Bách bộ 25 3. Kết quả phân lập và phân tích trình tự nucleotide của đoạn gen matK 25 3. Kết quả phân lập và phân tích trình tự nucleotide của đoạn gen rbcL 34 3.
Kết quả hàm lượng một số hoạt chất trong hạt của hai mẫu Bách bộ thu 41 được tại Thanh Hóa và Hòa Bình KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 43 TÀI LIỆU THAM KHẢO 44 Phụ lục 1 P1 Phụ lục 2 P2 Phụ lục 3 P3 Phụ lục 4 P4 iv DANH MỤC BẢNG Bảng 2. Trình tự các cặp mồi sử dụng để nhân bản 2 trình tự tương ứng 12 Bảng 2. Thành phần phản ứng PCR nhân gen 15 Bảng 3. Nồng độ và độ tinh sạch các mẫu 25 Bảng 3.
Trình tự matK của mẫu Bách bộ thu tại Thanh Hóa 27 Bảng 3. Trình tự matK của mẫu Bách bộ thu tại Hòa Bình 27 Bảng 3. Kết quả so sánh trình tự matK thu được so với các trình tự matK 32 đã công bố trên gen banks Bảng 3. Trình tự rbcL của mẫu Bách bộ thu tại Thanh Hóa 35 Bảng 3.
Trình tự rbcL của mẫu Bách bộ thu tại Hòa Bình 35 Bảng 3. Kết quả so sánh trình tự rbcL thu được so với các trình tự rbcL 39 đã công bố trên gen banks Bảng 3. Hàm lượng alkaloid toàn phần và tuberostemonine trong hạt 41 của 2 mẫu Bách bộ thu được tại Thanh Hóa và Hòa Bìn v DANH MỤC HÌNH Hình 3. Ảnh chụp cây Bách bộ tại Thanh Hóa và Hòa Bình 17 Hình 3.
Ảnh chụp lá Bách bộ 18 Hình 3. Ảnh chụp hoa Bách bộ 19 Hình 3. Ảnh chụp quả Bách bộ 20 Hình 3. Ảnh chụp hạt Bách bộ 21 Hình 3.
Ảnh chụp giải phẫu cuống lá Bách bộ 21 Hình 3. Ảnh chụp giải phẫu thân cây Bách bộ thu tại Thanh Hóa 22 Hình 3. Ảnh chụp giải phẫu thân cây Bách bộ thu tại Hòa Bình 23 Hình 3. Ảnh chụp giải phẫu thân cây Bách bộ thu tại Thanh Hóa 24 Hình 3.
Ảnh chụp giải phẫu thân cây Bách bộ thu tại Hòa Bình 24 Hình 3. Kết quả PCR gen matK của hai mẫu Bách bộ với cặp mồi matK- 26 F/matK-R Hình 3. Kết quả so sánh trình tự matK thu được với các trình tự matK 31 đã công bố trên gen banks Hình 3. Kết quả xác định quan hệ di truyền của các trình tự matK thu 33 được với các trình tự matK đã công bố trên gen banks Hình 3.
Kết quả PCR gen rbcL của hai mẫu Bách bộ với cặp mồi rbcL- 34 F/rbcL-R Hình 3. Kết quả so sánh trình tự rbcL thu được với các trình tự rbcL đã 38 công bố trên gen banks Hình 3. Kết quả xác định quan hệ di truyền của các trình tự rbcL thu 40 được với các trình tự rbcL đã công bố trên gen banks vi DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT BioEdit và DNAstar: Phần mềm Tin sinh học phân tích dữ liệu DNA BB : Bách bộ Blast : Basic Local Alignment Search Tool CTAB : Cetyl trimethyllammonium Bromide matK : Maturase K rbcL : ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit PCR : Polymerase chain reaction vii MỞ ĐẦU 1. Đặt vấn đề Bách bộ có tên khoa học là Stemona tuberosa Lour., thuộc họ Stemonaceae, được biết đến như là một loại cây thuốc có giá trị đông y cao, trong y học cổ truyền, Bách bộ có tên trong nhiều bài thuốc dân gian có khả năng kháng khuẩn, diệt vi trùng, trị ho, trị giun kim, hen suyễn, trị lao phổi, trị vàng da, phù nề cơ thể… [36].
Trên thế giới, Stemona tuberosa Lour. có phạm vi phân bố rộng, gần như loài cây này có khắp châu lục trên thế giới, chủ yếu là ở Ấn Độ, Úc, Bangladesh, Campuchia, Lào, Malaysia, Myanmar, Philippines, Thailand và Việt Nam [2]. Tại Việt Nam, Bách bộ có phạm vi phân bố rộng rãi, bao gồm vùng đồng bằng, ven biển, trung du, các tỉnh miền núi (độ cao dưới 1000m). Những tỉnh có nhiều Bách bộ là Cao Bằng, Lạng Sơn, Thái Nguyên, Tuyên Quang, Hòa Bình, Phú Thọ, Bắc Giang và Thanh Hóa [2], [32].
Tại Thanh Hóa, theo truyền thống, Bách bộ được dùng chữa ho, trị giun và diệt sâu bọ, ngoài ra, Bách bộ cũng có khả năng kháng khuẩn, được sử dụng chữa bệnh lao phổi, giảm ho, sát trùng, dùng ngoài làm thuốc sát trùng ngoài da, chữa các bệnh về phụ khoa. Theo thông tư số 40/2013/TT – BYT ngày 01/01/2014 của Bộ Y tế, Bách bộ là vị thuốc thiết yếu thuộc danh mục thuốc thiết yếu thuốc đông y và thuốc từ dược liệu lần thứ 6. Tuy nhiên, trong thực tế, việc nghiên cứu về đặc điểm thực vật học và gen phân loại cũng như vai trò dược liệu về loài cây này còn nhiều hạn chế. Các nghiên cứu chủ yếu là hình thái và các bài thuốc theo đông y.
Do vậy, việc nghiên cứu đặc điểm thực vật học và gen phân loại loài cây này có vai trò quan trọng trong việc cung cấp cơ sở dữ liệu khoa học nhằm bảo tồn, phát triển và khai thác hợp lý nguồn dược liệu quý này. Xuất phát từ giá trị dược học nhiều mặt của cây Bách bộ, đồng thời với mục đích cung cấp tư liệu hóa loài cây dược liệu này, phục vụ khai thác và phát triển nguồn gen cây dược liệu quý thuộc danh lục cây thuốc quý ở Việt Nam và 1 Thanh Hóa, chúng tôi chọn “Nghiên cứu một số đặc điểm thực vật học và gen phân loại cây Bách bộ (Stemona tuberosa Lour.) tại Việt Nam” làm đề tài nghiên cứu. Mục tiêu nghiên cứu Phân tích được đặc điểm hình thái, giải phẫu, alcaloide toàn phần, tuberostemonine và xác định được quan hệ chủng loài của một số trình tự gen phân loại phân lập được từ cây Bách bộ tại khu vực nghiên cứu, góp phần cung cấp cơ sở khoa học cho việc bảo tồn và phát triển nguồn gen dược liệu này tại Việt Nam. Phạm vi nghiên cứu Trong phạm vi nghiên cứu, đề tài tập trung phân tích đặc điểm hình thái, giải phẫu và gen rbcL, matK cây Bách bộ ở hai địa phương là Thanh Hóa và Hòa Bình.
Bước đầu tạo dữ liệu phân loại học phân tử dựa trên cơ sở phân tích đặc điểm của đoạn gen rbcL và matK phân lập được phục vụ nhận diện cây Bách bộ tại Việt Nam. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn Kết quả phân tích các đặc điểm về hình thái, giải phẫu là dữ liệu được tư liệu khoa học cho cây Bách bộ tại Việt Nam. Đặc biệt là đặc điểm về trình tự nucleotide của đoạn gen rbcL và matK phân lập từ cây Bách bộ là những dữ liệu khoa học quý giúp nhận diện cây Bách bộ bằng công nghệ gen. Kết quả nghiên cứu vừa có ý nghĩa về khoa học và vừa có nhiều ứng dụng trong thực tiễn.
TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU 1. Đặc điểm hình thái và trình tự gen phân loại của cây Bách bộ 1. Đặc điểm hình thái Cây Bách bộ có tên khoa học là Stemona tuberosa Lour. Thân thuộc dạng dây leo có kích thước nhỏ, nhẵn, quấn vào giá thể để leo, tuy nhiên khả năng leo không cao, mỗi đốt thân có thể dài trên 10cm.
Lá hình trái tim, mọc đối có khi thuôn dài, gân lá chạy dọc theo phiến lá và nổi rõ trên phiến lá, ngoài gân chính, trến phiến lá còn có 10 – 12 gân phụ chạy dọc từ cuống lá đến ngọn lá [33]. Hoa có dạng cụm, mọc ở kẽ lá, cuống hoa dài từ 2- 4cm, trong cụm hoa có 1-2 bông hoa to màu vàng hoặc màu đỏ. Bao hoa có cấu tạo gồm 4 nhụy giống nhau, chỉ nhị ngắn. Bầu hoa hình nón, quả nặng có 4 hạt, mua ra hoa thường là từ tháng 4 đến tháng 6 hàng năm [33].
Bách bộ có dạng rễ củ dài khoảng 6-12cm, đường kính của củ khoảng 0,5- 1,5cm, đầu trên hơi phình to, đầu dưới thuôn nhỏ dần, bên ngoài có vết nhăn tạo thành rãnh dọc sâu, củ có màu vàng trắng hoặc xám vàng. Củ có chất cứng giòn chắc, có vị ít ngọt, đắng nhiều, có mùi thơm ngát, vỏ ngoài rễ củ có màu đỏ hoặc nâu sẫm là tốt [33], [35]. Trình tự một số gen phân loại cây Bách bộ 1. DNA barcode DNA barcode được biết đến như là một công cụ thữu ích trong việc nhận diện các mẫu sinh vật và phân loại học phân tử có độ tin cậy cao.
Hiện nay, việc sử dụng DNA barcode trong phân loại học phân tử đang được các nhà khoa học trong và ngoài nước quan tâm đặc biệt. Việc làm này không chỉ giúp các nhà khoa học phân loại và sắp xếp một cách chính xác các loài sinh vật trong hệ thống phân loại sinh vật mà còn giúp nhận diện một cách chính xác các mẫu sinh vật không đầu đủ về hình thái, hoặc các mẫu sinh vật chưa phát triển hoàn thiện,… trong đó có thực vật.