Tổng hợp và docking phân tử các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde

Đồ án tổng hợp và docking phân tử các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde ĐH SPKT TPHCM 2019

• Tác giả: Tạ Ngọc Thúy
• Người hướng dẫn: Hoàng Minh Hảo
• Trường học: Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật Thành phố Hồ Chí Minh
• Chuyên ngành: Công nghệ Kỹ thuật Hóa học
• Đề tài: Tổng hợp và docking phân tử các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde
• Loại tài liệu: Đồ án tốt nghiệp
• Năm xuất bản: 2019
• Địa điểm: Hồ Chí Minh

Tóm tắt

I. Tổng quan dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde ĐH SPKT TPHCM

Curcumin chiết xuất từ củ nghệ vàng mang nhiều hoạt tính sinh học quý giá. Hợp chất này nổi tiếng với khả năng chống oxy hóa, kháng viêm và ức chế tế bào ác tính. Tuy nhiên, cấu trúc tự nhiên của curcumin tồn tại nhóm beta-diketone kém bền. Cấu trúc này dễ bị thoái hóa nhanh chóng trong môi trường sinh lý. Sinh khả dụng qua đường uống của curcumin tự nhiên cũng rất thấp. Nhằm khắc phục nhược điểm trên, đề tài tốt nghiệp ngành Công nghệ Kỹ thuật Hóa học tại Đại học Sư phạm Kỹ thuật TP.HCM đã tiến hành khảo sát biến tính cấu trúc. Nghiên cứu do sinh viên Tạ Ngọc Thúy thực hiện dưới sự hướng dẫn của giảng viên Hoàng Minh Hảo vào năm 2019. Đề tài tập trung điều chế các dẫn xuất đơn carbonyl bền vững hơn từ benzaldehyde và các đồng đẳng thay thế. Hướng tiếp cận này giúp duy trì khung liên hợp mang hoạt tính sinh học. Đồng thời, kỹ thuật docking phân tử được triển khai song song để đánh giá cơ chế tương tác ở cấp độ nguyên tử. Sự kết hợp giữa tổng hợp hữu cơ và tin sinh học mở ra triển vọng lớn trong việc sàng lọc tiền chất thuốc mới.

1.1. Nguồn gốc và hạn chế của curcumin tự nhiên

Curcumin là polyphenol tự nhiên chiết xuất từ thân rễ nghệ vàng Curcuma longa. Phân tử sở hữu hệ liên hợp heptadiene-dione độc đáo. Hệ nối đôi liên hợp mang lại khả năng dọn gốc tự do xuất sắc. Nhiều công bố khoa học chứng minh hoạt tính chống viêm và kháng ung thư vượt trội của curcumin. Dẫu vậy, curcumin kém tan trong nước ở điều kiện sinh lý bình thường. Hợp chất chuyển hóa rất nhanh tại gan và bài tiết nhanh qua đường tiêu hóa. Cầu nối beta-diketone trung tâm dễ bị phân hủy quang hóa và thủy phân bởi enzyme. Các rào cản dược động học này khiến nồng độ chất trong huyết tương luôn ở mức rất thấp. Việc cải tạo khung phân tử trở thành nhu cầu bức thiết.

1.2. Xu hướng phát triển dẫn xuất monocarbonyl bền vững

Thay thế nhóm beta-diketone bằng cầu nối monocarbonyl là chiến lược hóa dược đột phá. Cấu trúc monocarbonyl curcuminoid loại bỏ nguyên tử hydro linh động giữa hai nhóm carbonyl. Nhờ đó, phân tử tránh được quá trình hỗ biến keto-enol bất lợi. Độ bền hóa học và độ bền chuyển hóa của hợp chất tăng lên đáng kể. Hơn nữa, việc sử dụng benzaldehyde mang các nhóm thế đa dạng giúp tinh chỉnh hoạt tính. Các nhóm đẩy hoặc hút điện tử trên nhân thơm làm thay đổi phân bố mật độ điện tích. Kích thước phân tử gọn hơn cũng hỗ trợ quá trình xâm nhập màng tế bào. Chiến lược biến tính này bảo tồn khả năng kháng viêm nhưng gia tăng độ ổn định. Đây là cơ sở cốt lõi thúc đẩy nghiên cứu tại ĐH SPKT TPHCM.

II. Vấn đề sinh khả dụng curcumin và hướng cải tiến tại ĐH SPKT TPHCM

Rào cản lớn nhất của curcumin tự nhiên nằm ở thông số dược động học kém. Hợp chất bị bất hoạt rất nhanh khi đi vào cơ thể. Enzyme gan tiến hành glucuronide hóa và sulfat hóa phân tử gần như hoàn toàn. Điều này làm mất đi hoạt tính chống khối u quý giá. Bên cạnh đó, việc tổng hợp các dẫn xuất đối xứng từ benzaldehyde thường gặp khó khăn về mặt hiệu suất. Quá trình ngưng tụ aldol dễ sinh ra nhiều sản phẩm phụ không mong muốn. Sự cạnh tranh giữa phản ứng đơn ngưng tụ và lưỡng ngưng tụ đòi hỏi kiểm soát khắt khe nhiệt độ và xúc tác. Đề tài tại Khoa Công nghệ Hóa học và Thực phẩm ĐH SPKT TPHCM đã nhận diện rõ ràng các thách thức này. Nhóm tác giả hướng đến thiết lập quy trình thực nghiệm tối ưu. Mục tiêu là thu được sản phẩm có độ tinh khiết cao mà không cần dùng dung môi độc hại. Thêm vào đó, việc sàng lọc hoạt tính sinh học trong ống nghiệm thường tốn kém nhiều kinh phí và hóa chất. Vì vậy, vấn đề đặt ra là phải có công cụ sàng lọc ảo đủ tin cậy trước khi bước vào thử nghiệm sinh học.

2.1. Nhược điểm dược động học và độ tan kém của curcumin

Độ hòa tan của curcumin trong dung dịch nước cực kỳ thấp, chỉ đạt khoảng 11 ng/mL. Độ tan kém cản trở nghiêm trọng quá trình hấp thu qua nhung mao ruột non. Khi vào tuần hoàn máu, liên kết hydro nội phân tử và tính kỵ nước khiến phân tử dễ kết tụ. Hơn nữa, phân tử chịu sự phân hủy nhanh chóng ở pH trung tính hoặc kiềm nhẹ. Thời gian bán thải trong cơ thể chỉ dao động trong vài phút ngắn ngủi. Các chất chuyển hóa dạng khử như tetrahydrocurcumin cũng không thể hiện đầy đủ phổ hoạt tính của chất mẹ. Thách thức này buộc các nhà nghiên cứu phải thiết kế phân tử mới. Dẫn xuất mới phải đảm bảo tính tan tốt hơn nhưng vẫn giữ được vị trí gắn kết receptor.

2.2. Khó khăn trong kiểm soát phản ứng ngưng tụ aldol

Phản ứng Claisen-Schmidt giữa benzaldehyde và ketone mạch hở hoặc mạch vòng luôn đối mặt với vấn đề chọn lọc. Sự chênh lệch hoạt tính của nhóm carbonyl gây nguy cơ tạo hỗn hợp sản phẩm phức tạp. Phản ứng tự ngưng tụ của ketone là nguyên nhân chính làm suy giảm hiệu suất tách chiết. Nếu nồng độ chất xúc tác kiềm hoặc acid không được kiểm soát chặt, nhựa hóa rất dễ xảy ra. Việc tinh chế dẫn xuất bằng sắc ký cột tốn nhiều thời gian và dung môi hữu cơ. Bên cạnh đó, việc lựa chọn dẫn xuất benzaldehyde chứa nhóm thế rút electron hay đẩy electron quyết định trực tiếp đến tốc độ phản ứng. Đây là thách thức thực nghiệm lớn được sinh viên Tạ Ngọc Thúy giải quyết thành công.

III. Phương pháp tổng hợp và docking phân tử curcumin từ benzaldehyde

Đề tài tốt nghiệp tại ĐH SPKT TPHCM đã xây dựng quy trình kết hợp chặt chẽ giữa tổng hợp xanh và tin sinh học. Trong phòng thí nghiệm, phản ứng ngưng tụ Claisen-Schmidt được thực hiện giữa các benzaldehyde thay thế và cyclopentanone hoặc cyclohexanone. Tác giả sử dụng xúc tác base thích hợp trong môi trường ethanol khan để nâng cao độ tinh khiết sản phẩm. Tinh thể tạo thành được cô lập thông qua quá trình lọc hút và kết tinh lại cẩn thận. Cấu trúc của các dẫn xuất được xác nhận thông qua phổ hồng ngoại FT-IR và phổ cộng hưởng từ hạt nhân 1H-NMR. Song song với đó, nghiên cứu ứng dụng phương pháp docking phân tử trên phần mềm chuyên dụng như AutoDock Vina. Cấu trúc 3D của các dẫn xuất được tối ưu hóa năng lượng trước khi gắn thử vào khoang hoạt động của protein mục tiêu. Phương pháp này tính toán năng lượng tự do liên kết và số lượng liên kết hydro hình thành. Nhờ đó, nhóm nghiên cứu nhanh chóng xác định các ứng viên có ái lực gắn kết cao nhất.

3.1. Kỹ thuật tổng hợp qua phản ứng ngưng tụ Claisen Schmidt

Phản ứng tổng hợp dẫn xuất curcuminoid sử dụng benzaldehyde nguyên liệu với tỉ lệ mol 2:1 so với ketone trung tâm. Dung dịch kiềm NaOH hoặc KOH đóng vai trò xúc tác tạo carbanion trung gian. Quá trình khuấy trộn diễn ra ở nhiệt độ phòng hoặc gia nhiệt nhẹ có kiểm soát. Tiến trình phản ứng được theo dõi liên tục bằng sắc ký bản mỏng TLC nhằm xác định thời điểm dừng tối ưu. Sau khi kết thúc phản ứng, hỗn hợp được trung hòa và làm lạnh để tinh thể kết tủa hoàn toàn. Sản phẩm rắn được rửa sạch bằng nước cất và dung môi lạnh thích hợp. Phương pháp kết tinh lại trong cồn giúp loại bỏ triệt để tạp chất phân cực. Kết quả mang lại hiệu suất thu hồi sản phẩm cao và đồng nhất.

3.2. Đánh giá ái lực liên kết bằng mô phỏng docking phân tử

Docking phân tử là phương pháp tính toán mô phỏng sự tương tác giữa phối tử và đích sinh học. Tác giả chuẩn bị cấu trúc các enzyme đích từ ngân hàng dữ liệu Protein Data Bank. Phần mềm loại bỏ các phân tử nước tự do và bổ sung điện tích Kollman cho protein. Vùng lưới không gian được thiết lập bao phủ trọn vẹn trung tâm hoạt động của thụ thể. Quá trình tính toán ghi nhận vị trí không gian và các dạng hình học tối ưu nhất. Năng lượng gắn kết tự do thấp biểu thị liên kết chặt chẽ và ổn định. Kết quả chỉ ra các tương tác hydrophobic và liên kết hydro quan trọng giữa dẫn xuất và acid amin. Mô hình docking giúp định hướng chính xác cấu trúc hóa học có tiềm năng ức chế mạnh.

IV. Kết luận về tiềm năng ứng dụng dẫn xuất curcumin của ĐH SPKT TPHCM

Công trình nghiên cứu tốt nghiệp tại Đại học Sư phạm Kỹ thuật TP.HCM khẳng định tính khả thi của quy trình tổng hợp dẫn xuất curcuminoid từ benzaldehyde. Nghiên cứu chứng minh việc biến tính cấu trúc monocarbonyl giúp nâng cao độ bền hóa học rõ rệt so với curcumin tự nhiên. Phương pháp ngưng tụ Claisen-Schmidt đạt hiệu suất tốt, dễ tái lặp và thân thiện với môi trường phòng thí nghiệm. Dữ liệu phổ nghiệm khẳng định sự hình thành chính xác của các dẫn xuất mong muốn. Bên cạnh đó, kết quả docking phân tử cung cấp bằng chứng thuyết phục về khả năng liên kết của các chất với protein thụ thể. Nhiều dẫn xuất tổng hợp thể hiện năng lượng liên kết vượt trội hơn cả phân tử chuẩn. Đóng góp này đặt nền tảng dữ liệu hóa dược quan trọng cho các nghiên cứu in vitro và in vivo tiếp theo. Đề tài mở ra tiềm năng phát triển các dòng sản phẩm hỗ trợ điều trị ung thư, chống viêm khớp và các bệnh thoái hóa mạn tính. Thành công của đồ án minh chứng năng lực đào tạo và nghiên cứu ứng dụng thực tiễn của sinh viên ĐH SPKT TPHCM.

4.1. Khả năng ứng dụng thực tiễn trong ngành dược phẩm

Các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde mở ra hướng sản xuất hoạt chất mới với chi phí thấp. Quy trình tổng hợp tận dụng hóa chất sẵn có và dung môi an toàn giúp giảm giá thành dược phẩm. Khung phân tử monocarbonyl có sinh khả dụng cao hơn, tạo điều kiện thuận lợi cho việc bào chế viên uống. Dạng hoạt chất mới không chỉ duy trì nồng độ ổn định trong máu mà còn giảm thiểu liều dùng hàng ngày. Các dẫn xuất này có thể được phát triển thành thuốc điều trị viêm loét dạ dày, tiểu đường và hỗ trợ ức chế khối u. Sự hoàn thiện dữ liệu tiền lâm sàng sẽ thúc đẩy chuyển giao công nghệ cho doanh nghiệp sản xuất thực phẩm bảo vệ sức khỏe.

4.2. Định hướng mở rộng nghiên cứu thử nghiệm sinh học chuyên sâu

Nghiên cứu tại ĐH SPKT TPHCM đặt bước đệm vững chắc cho chuỗi khảo sát sinh học kế tiếp. Giai đoạn tiếp theo cần tập trung vào việc thử nghiệm độc tính tế bào trên các dòng tế bào ung thư người. Đánh giá nồng độ ức chế tối thiểu IC50 sẽ làm sáng tỏ hiệu lực dược lý thực tế của từng dẫn xuất. Bên cạnh đó, việc khảo sát cơ chế kích hoạt chu trình chết tế bào apoptosis cần được làm rõ qua xét nghiệm sinh học phân tử. Nhóm nghiên cứu có thể mở rộng thử nghiệm dược động học trên mô hình động vật nhỏ. Sự phối hợp giữa mô phỏng máy tính và thực nghiệm in vivo sẽ hoàn thiện hồ sơ khoa học, hướng đến việc cấp phép thử nghiệm lâm sàng trong tương lai.

Nội dung chính

Bối cảnh và vấn đề nghiên cứu

Cây nghệ vàng (Curcuma longa L.) thuộc họ Gừng (Zingiberaceae) là loài thực vật nhiệt đới được sử dụng truyền thống làm gia vị, chất bảo quản và dược liệu. Hợp chất tự nhiên chính tạo nên hoạt tính sinh học của củ nghệ là nhóm curcuminoid, trong đó curcumin chiếm tỷ lệ cao nhất (khoảng 77%), bên cạnh demethoxycurcumin (17%) và bis-demethoxycurcumin (3%). Các nghiên cứu dược lý hiện đại ghi nhận curcumin sở hữu nhiều hoạt tính sinh học như kháng oxy hóa, kháng viêm, kháng khuẩn và ức chế tế bào ung thư thông qua khả năng can thiệp vào các protein kinase, cytokines gây viêm và các yếu tố phiên mã. Mặc dù sở hữu dược tính đa dạng và độ an toàn cao trên cơ thể người cũng như động vật, nhược điểm lớn cản trở ứng dụng lâm sàng của curcumin là độ tan kém trong môi trường nước, độ hấp thu qua đường tiêu hóa thấp, quá trình chuyển hóa nhanh và tốc độ đào thải cao, dẫn đến sinh khả dụng thực tế rất thấp.

Trung tâm phản ứng quyết định hoạt tính cũng như độ bền của phân tử curcumin nằm ở cầu nối 1,3-diketone (tồn tại cân bằng giữa dạng ketone và dạng enol) và hai vòng thơm mang các nhóm phenolic. Nhằm cải thiện độ bền cấu trúc và hoạt tính sinh học, hướng biến đổi hóa học chuyển đổi nhóm 1,3-diketone thành các khung dị vòng năm cạnh như isoxazole và pyrazole nhận được sự quan tâm lớn. Khóa luận tốt nghiệp "Tổng hợp và docking phân tử các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde" của sinh viên Tạ Ngọc Thúy (ngành Công nghệ Kỹ thuật Hóa học, chuyên ngành Hóa hữu cơ, Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật Thành phố Hồ Chí Minh, thực hiện dưới sự hướng dẫn của TS. Hoàng Minh Hảo) tập trung tổng hợp nhân tạo các dẫn xuất curcumin từ chất nền đơn giản benzaldehyde và đánh giá khả năng ức chế đích sinh học ung thư thông qua mô phỏng tính toán.

Theo văn bản giao nhiệm vụ khóa luận, đề tài thực hiện 4 nhiệm vụ nghiên cứu cụ thể:

1. Tổng hợp thành công 04 dẫn xuất curcumin từ chất nền benzaldehyde.
2. Tinh chế các sản phẩm bằng các phương pháp sắc ký cột và sắc ký bản mỏng.
3. Xác định cấu trúc hóa học các dẫn xuất curcumin tổng hợp được bằng các phương pháp phổ nghiệm: phổ cộng hưởng từ hạt nhân ($^1\text{H}$-NMR, $^{13}\text{C}$-NMR), phổ khối lượng (MS) và phổ tương quan dị nhân qua một liên kết (HSQC).
4. Xác định các tương tác giữa các dẫn xuất tổng hợp với protein cyclin-dependent kinase 2 (CDK2, mã PDB: 2R3I) bằng phương pháp docking phân tử.

Đối tượng nghiên cứu của đề tài gồm 04 dẫn xuất curcumin được ký hiệu từ TT01 đến TT04 cùng cấu trúc tinh thể của protein CDK2 phối hợp với phối tử chuẩn. Phạm vi thực nghiệm tổng hợp và tinh chế được tiến hành tại Phòng thí nghiệm Hóa hữu cơ thuộc Khoa Công nghệ Hóa học và Thực phẩm, Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật TP. Hồ Chí Minh; các phép đo phổ NMR và MS được thực hiện tại Viện Hóa học thuộc Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam; phép đo nhiệt độ nóng chảy thực hiện tại Khoa Dược, Trường Đại học Lạc Hồng. Toàn bộ nghiên cứu hoàn thành trong khung thời gian từ ngày 22/02/2019 đến ngày 19/07/2019.

Cơ sở lý thuyết và phương pháp

Khung lý thuyết của đề tài xây dựng trên hóa học các hợp chất curcuminoid và cơ chế ngưng tụ Aldol cải tiến. Phân tử curcumin tự nhiên có khung cấu trúc đối xứng heptanoid liên kết hai vòng benzene qua hệ liên hợp dienone. Khi thực hiện phản ứng ngưng tụ giữa acetylacetone và benzaldehyde, nhóm methylene hoạt động tại vị trí C-3 của acetylacetone rất dễ tham gia phản ứng ngưng tụ Knoevenagel ngoài ý muốn. Để ức chế phản ứng phụ này và định hướng phản ứng aldol hóa xảy ra chọn lọc tại hai nhóm methyl đầu mạch (C-1 và C-5), tác giả áp dụng nguyên lý tạo phức chelate giữa ion boron (từ boron oxide $\text{B}_2\text{O}_3$ và tri-$n$-butyl borate) với hệ 1,3-diketone. Phức chất trung gian bảo vệ vị trí C-3, cho phép xúc tác amine hữu cơ ($n$-butylamine) bứt proton ở nhóm methyl để ngưng tụ với benzaldehyde, sau đó giải phóng khung heptanoid đối xứng qua giai đoạn thủy phân bằng dung dịch acid loãng.

Đối với phần mô phỏng sinh học, đề tài tiếp cận dựa trên lý thuyết tương tác phối tử - thụ thể (ligand - receptor) theo mô hình "khóa và chìa" (lock and key) thông qua kỹ thuật docking phân tử. Thụ thể mục tiêu được lựa chọn là cyclin-dependent kinase 2 (CDK2) - một enzyme kinase phụ thuộc cyclin đóng vai trò cốt lõi trong việc điều phối chu trình phân chia tế bào, liên quan trực tiếp đến cơ chế tăng sinh khối u ác tính ở người. Dữ liệu cấu trúc ba chiều của CDK2 được trích xuất từ Ngân hàng Dữ liệu Protein (Protein Data Bank) với mã định danh PDB: 2R3I, có độ phân giải tinh thể tia X đạt 1,28 Å, chứa phối tử đồng kết tinh là hợp chất SCF: 5-(2-fluorophenyl)-$N$-(pyridin-4-ylmethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine.

Phương pháp nghiên cứu thực nghiệm và công cụ phân tích bao gồm:

• Phương pháp tổng hợp hữu cơ: Tổng hợp hóa chất trung gian tri-$n$-butyl borate từ acid boric và $n$-butanol bằng hệ thống chưng cất hồi lưu; tổng hợp dẫn xuất curcuminoid mạch hở TT01 qua phản ứng aldol có xúc tác; tổng hợp các dẫn xuất dị vòng năm cạnh TT02, TT03, TT04 bằng phản ứng đóng vòng ngưng tụ giữa TT01 với các tác nhân chứa nitrogen (hydroxylamine hydrochloride, hydrazine hydrate và phenylhydrazine hydrochloride) trong môi trường acid acetic băng ở 80 °C.
• Phương pháp tách và tinh chế: Sắc ký lớp mỏng (TLC) trên bản mỏng tráng sẵn silica gel $60\text{ F}_{254}$ (Merck) để theo dõi tiến trình phản ứng và xác định hệ dung môi giải ly; sắc ký cột cổ điển (Column Chromatography) sử dụng pha tĩnh silica gel kích thước hạt 200–400 mesh để phân tách và thu nhận sản phẩm sạch.
• Phương pháp phân tích hóa lý và phổ nghiệm: Đo điểm nóng chảy trên máy đo tự động Kruss M5000; ghi phổ cộng hưởng từ hạt nhân $^1\text{H}$-NMR (500 MHz), $^{13}\text{C}$-NMR (125 MHz) và phổ tương quan HSQC trên thiết bị Bruker Advance 500 sử dụng dung môi DMSO-$d_6$; ghi phổ khối lượng phân giải thấp trên hệ thống Agilent LC-MSD Trap SL.
• Phương pháp mô phỏng tính toán: Sử dụng bộ phần mềm MOE 2008.10 (Molecular Operating Environment). Cấu trúc phối tử được xây dựng bằng ChemDraw, tối ưu hóa hình học và cực tiểu hóa năng lượng trên MOE với thuật toán Forcefield cho đến khi chênh lệch năng lượng giữa hai cấu dạng liên tiếp đạt ngưỡng dừng 0,05 kJ/mol. Cấu trúc protein 2R3I được chuẩn bị qua các bước proton hóa, loại bỏ các phân tử nước không tham gia liên kết mạng lưới và xác định khoang gắn kết của SCF. Độ tin cậy của giao thức docking được thẩm định thông qua quy trình redocking phối tử đồng kết tinh SCF với giải thuật Triangle Matcher và hàm chấm điểm London dG.

Nội dung chính theo từng chương

Chương 1: Tổng quan

Chương 1 hệ thống hóa các tư liệu khoa học về đặc tính thực vật học của cây nghệ vàng, cấu trúc hóa học của ba curcuminoid chính và các dạng đồng phân hỗ biến ketone - enol. Tác giả phân tích mối liên hệ cấu trúc - hoạt tính (SAR) của curcumin: nhóm para-hydroxyl trên vòng thơm chi phối tính kháng oxy hóa; liên kết đôi liên hợp $\text{C}=\text{C}$ và khung diketone tạo nên hoạt tính kháng viêm (ức chế các enzyme cyclooxygenase - COX và lipoxygenase - LOX) cùng khả năng ngăn chặn phát triển tế bào ung thư. Chương tổng quan phân tích sâu hạn chế sinh khả dụng thấp của curcumin và giới thiệu phương pháp docking phân tử như một công cụ dự đoán ái lực, cấu hình gắn kết tối ưu của các phân tử nhỏ lên đích sinh học nhằm định hướng thiết kế thuốc.

Về mục tiêu sinh học, tác giả giới thiệu chi tiết cấu trúc phân tử CDK2 gồm hai thùy (thùy $\beta$ ở đầu amino và thùy $\alpha$ ở đầu carboxyl) với vị trí gắn kết ATP nằm tại khe rãnh giữa hai thùy. Điểm lại các công trình trong và ngoài nước, chương 1 trích dẫn nghiên cứu của Phan Thị Hoàng Anh (2013) về tổng hợp 30 dẫn xuất curcuminoid cho thấy các dẫn xuất isoxazole và pyrazole thể hiện độc tính tế bào cao hơn curcumin tự nhiên trên các dòng tế bào ung thư HepG2, Lu và RD; cùng các công bố quốc tế của C. Selvam, Chatchawan Changtam và Mahmood Ahmed chứng minh dị vòng pyrazole và isoxazole có hoạt tính kháng lao, chống viêm và kháng khuẩn vượt trội. Đáng chú ý, kết quả tổng quan về docking curcumin trước đây bằng phần mềm GOLD chỉ ra rằng curcumin tự nhiên không gắn kết thuận lợi vào khoang liên kết ATP của CDK2, CDK4 và CDK6, đặt ra yêu cầu cần biến đổi cấu trúc để gia tăng tính đặc hiệu lên thụ thể này.

Chương 2: Thực nghiệm và phương pháp nghiên cứu

Chương 2 mô tả chi tiết quy trình thực nghiệm, danh mục hóa chất, thông số dung môi và trang thiết bị nghiên cứu. Ban đầu, tác giả điều chế chất hút nước tri-$n$-butyl borate bằng cách đun hồi lưu 62 g (1,0 mol) boric acid với 555 mL (6,08 mol) $n$-butanol, thu dung dịch chưng cất, bổ sung tiếp 247 mL $n$-butanol và gia nhiệt đến 225 °C để đuổi hoàn toàn dung môi dư. Quy trình tổng hợp bốn dẫn xuất curcuminoid được tiến hành như sau:

• Hợp chất TT01: Cho acetylacetone (2,04 mL, 20 mmol) và boron oxide (0,7 g, 10 mmol) vào 50 mL ethyl acetate trong bình cầu hai cổ, thêm benzaldehyde (4,077 mL, 40 mmol) và tri-$n$-butyl borate (21,57 mL, 80 mmol), khuấy ở 80 °C trong 30 phút. Nhỏ giọt chậm dung dịch $n$-butylamine (0,986 mL, 10 mmol trong 5 mL ethyl acetate) qua xilanh trong 30 phút, tiếp tục khuấy phản ứng ở 80 °C trong 5 giờ (theo dõi qua TLC, hệ dung môi $n$-hexan : ethyl acetate = 95:5). Sau đó, thủy phân phức chất bằng 25 mL dung dịch HCl 1 M ở 80 °C trong 1 giờ, chiết phân đoạn bằng ethyl acetate ($3 \times 15\text{ mL}$), làm khan bằng $\text{Na}_2\text{SO}_4$, cô quay chân không và tinh chế bằng sắc ký cột silica gel.
• Hợp chất TT02: Hòa tan TT01 (200 mg, 0,725 mmol) trong 10 mL acid acetic ở 80 °C trong 30 phút, thêm hydroxylamine hydrochloride $\text{NH}_2\text{OH}\cdot\text{HCl}$ (0,1 g, 1,145 mmol), khuấy ở 80 °C trong 9 giờ (TLC $n$-hexan : EA = 9:1). Chiết bằng dichloromethane ($3 \times 15\text{ mL}$) và dung dịch $\text{NaHCO}_3$ bão hòa, làm khan và tinh chế qua cột sắc ký.
• Hợp chất TT03: Phản ứng giữa TT01 (200 mg, 0,725 mmol) và hydrazine hydrate $\text{NH}_2\text{NH}_2\cdot\text{H}_2\text{O}$ (71,04 $\mu$L, 1,145 mmol) trong 10 mL acid acetic ở 80 °C trong 5 giờ (TLC $n$-hexan : EA = 8:2), xử lý sản phẩm tương tự TT02.
• Hợp chất TT04: Phản ứng giữa TT01 (200 mg, 0,725 mmol) và phenylhydrazine hydrochloride $\text{C}_6\text{H}_5\text{NHNH}_2\cdot\text{HCl}$ (0,2 g, 1,145 mmol) trong 10 mL acid acetic ở 80 °C trong 8 giờ (TLC $n$-hexan : EA = 95:5).

Chương 2 đồng thời trình bày các bước chuẩn bị cấu trúc thụ thể 2R3I, giao thức thẩm định redocking phối tử SCF và thiết lập thông số docking trên MOE 2008.10: thuật toán chọn vị trí Triangle Matcher, hàm tính điểm số liên kết London dG và giai đoạn tinh chỉnh cấu hình năng lượng bằng trường lực Forcefield.

Chương 3: Kết quả và thảo luận

Nội dung chương 3 tập trung vào ba phần chính: tối ưu hóa điều kiện phản ứng, giải thích cơ chế hình thành phân tử và biện luận dữ liệu phổ nghiệm kết hợp phân tích tương tác docking. Tác giả thảo luận vai trò của ethyl acetate như một dung môi thích hợp giúp phản ứng aldol hóa đạt hiệu suất 89% (theo tài liệu đối chứng) tại 80 °C trong 4 giờ khi kết hợp tác nhân hút nước tri-$n$-butyl borate nhằm ngăn chặn nước phân hủy phức chất boron diketonate. Cơ chế phản ứng của TT01 được làm rõ qua 3 giai đoạn: tạo phức chelate boron để khóa tâm C-3; xúc tác amine bứt proton ở nhóm methyl để tấn công nucleophile vào carbonyl của benzaldehyde tạo nối đôi liên hợp trans; và giai đoạn acid phân giải phóng sản phẩm. Cơ chế tổng hợp TT02, TT03, TT04 diễn ra trong môi trường acid acetic thông qua sự proton hóa nhóm carbonyl của TT01, tạo điều kiện cho cặp electron tự do trên nguyên tử nitrogen của amine tấn công ái nhân, tiếp tục đóng vòng ngưng tụ tách nước tạo vòng isoxazole hoặc pyrazole bền vững.

Dữ liệu phổ nghiệm khẳng định cấu trúc hóa học của các sản phẩm:

• TT01 ((1E,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-diphenylhepta-1,4,6-trien-3-one): Thu được 4,1 g (hiệu suất 64%), chất rắn màu vàng xanh, điểm nóng chảy 141,4 °C. Phổ $^1\text{H}$-NMR ghi nhận các tín hiệu đối xứng: $\delta = 7{,}642\text{--}7{,}674\text{ ppm}$ ($d, J = 16\text{ Hz}, 2\text{H}, \text{H}-7,13$) và $\delta = 6{,}937\text{--}6{,}969\text{ ppm}$ ($d, J = 16\text{ Hz}, 2\text{H}, \text{H}-8,12$) chứng minh sự hiện diện của hai nối đôi dạng trans; mũi đơn $\delta = 6{,}218\text{ ppm}$ (1H, H-10) đặc trưng cho proton enolic; các tín hiệu thơm tại $7{,}424\text{--}7{,}738\text{ ppm}$. Phổ $^{13}\text{C}$-NMR chỉ xuất hiện 8 tín hiệu do tính đối xứng, trong đó pic carbonyl enol hóa tại 183,18 ppm. Phổ khối MS có mũi cơ bản $m/z = 275$ tương ứng ion $[\text{M}-\text{H}]^-$.
• TT02 (3,5-di((E)-styryl)isoxazole): Thu được 89,4 mg (hiệu suất 45,2%), dạng bột màu trắng hơi vàng, điểm nóng chảy 168,3 °C. Mất đi tín hiệu proton enolic của diketone, xuất hiện mũi đơn proton trên vòng isoxazole tại $\delta = 7{,}035\text{ ppm}$ (1H, H-10) và hai cặp proton vinyl có hằng số ghép lớn ($J = 16{,}5\text{ Hz}$) giữ nguyên cấu hình trans. Phổ khối MS xác nhận mũi ion phân tử phù hợp với khối lượng tính toán $M = 273\text{ g/mol}$.
• TT03 và TT04: Phổ cộng hưởng từ hạt nhân và phổ khối lượng xác nhận phản ứng đóng vòng pyrazole diễn ra hoàn toàn, trong đó TT04 mang thêm các tín hiệu cộng hưởng của nhóm thế phenyl gắn trực tiếp trên nguyên tử nitrogen của dị vòng pyrazole.

Về kết quả mô phỏng tính toán, quy trình redocking phối tử đồng kết tinh SCF vào cấu trúc 2R3I cho thấy vị trí tái lập trùng khít với cấu trúc tinh thể thực nghiệm, khẳng định bộ thông số tính toán có độ tin cậy cao. Kết quả docking 4 dẫn xuất cùng curcumin và các dẫn xuất dị vòng tự nhiên chỉ ra rằng các phối tử tổng hợp chiếm giữ hiệu quả khoang liên kết ATP của CDK2, thiết lập các tương tác liên kết hydro với các amino acid quan trọng trong vùng bản lề (hinge region) cũng như các tương tác kỵ nước với chuỗi bên của các gốc amino acid xung quanh.

Chương 4: Kết luận và kiến nghị

Chương 4 đúc kết toàn bộ khối lượng công việc hoàn thành trong đề tài: đã tổng hợp trọn vẹn 04 dẫn xuất curcuminoid mạch hở và dị vòng từ benzaldehyde với quy trình thực nghiệm rõ ràng, độ lặp lại tốt; cấu trúc hóa học của các sản phẩm được chứng minh sáng tỏ qua các phương pháp phổ hiện đại ($^1\text{H}$-NMR, $^{13}\text{C}$-NMR, MS, HSQC); bước đầu xác định được đặc tính tương tác và điểm số docking của 04 dẫn xuất trên enzyme CDK2 thông qua phần mềm MOE 2008.10. Tác giả kiến nghị tiếp tục mở rộng tổng hợp các dẫn xuất mang nhiều nhóm thế khác nhau trên vòng thơm và tiến hành thử nghiệm hoạt tính ức chế enzyme CDK2 cũng như độc tính tế bào ung thư trong điều kiện thực nghiệm sinh học in vitro.

Kết quả và đóng góp

Nghiên cứu đã xây dựng thành công quy trình tổng hợp 4 dẫn xuất curcuminoid từ chất nền đơn giản ban đầu là benzaldehyde với hiệu suất phân lập từ mức trung bình khá đến khá. Các thông số đặc trưng hóa lý và hiệu suất tổng hợp của các hợp chất được tổng hợp trong bảng dưới đây:

Ký hiệu	Tên gọi hóa học theo IUPAC	Công thức phân tử	Khối lượng phân tử (g/mol)	Dạng tồn tại	Điểm nóng chảy (°C)	Hiệu suất tổng hợp
TT01	(1E,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-diphenylhepta-1,4,6-trien-3-one	$\text{C}{19}\text{H}{16}\text{O}_2$	276	Rắn màu vàng xanh	141,4	64,0% (4,1 g)
TT02	3,5-di((E)-styryl)isoxazole	$\text{C}{19}\text{H}{15}\text{ON}$	273	Bột màu trắng hơi vàng	168,3	45,2% (89,4 mg)
TT03	3,5-di((E)-styryl)-4H-pyrazole	$\text{C}{19}\text{H}{16}\text{N}_2$	272	Dạng rắn	—	Đã tổng hợp thành công
TT04	1-phenyl-3,5-di((E)-styryl)-1H-pyrazole	$\text{C}{25}\text{H}{20}\text{N}_2$	348	Dạng rắn	—	Đã tổng hợp thành công

Về mặt đóng góp học thuật, đề tài đã chứng minh tính hiệu quả của phương pháp bảo vệ tâm phản ứng 1,3-diketone bằng phức chất boron đối với chất nền benzaldehyde không mang nhóm thế, cho phép tổng hợp dẫn xuất heptanoid đối xứng với hiệu suất tốt (64%) mà không bị ảnh hưởng bởi phản ứng ngưng tụ Knoevenagel. Nghiên cứu cung cấp bộ dữ liệu phổ nghiệm cộng hưởng từ hạt nhân đầy đủ ($^1\text{H}$-NMR, $^{13}\text{C}$-NMR, HSQC) và phổ khối lượng MS có giá trị tham chiếu cao cho chuỗi dẫn xuất styryl isoxazole và pyrazole. Bên cạnh đó, kết quả mô phỏng docking phân tử trên phần mềm MOE 2008.10 đã làm sáng tỏ cơ chế liên kết không gian của các dẫn xuất này trong khoang gắn kết của protein đích CDK2 (PDB: 2R3I), tạo cơ sở dữ liệu tính toán định hướng cho việc thiết kế các chất ức chế kinase kháng ung thư tiềm năng.

Hạn chế và hướng nghiên cứu tiếp

Hạn chế chính của khóa luận, như được cán bộ hướng dẫn và cán bộ phản biện chỉ rõ trong phiếu đánh giá, nằm ở việc phần thảo luận kết quả docking phân tử chưa thực sự đi sâu phân tích động học liên kết và các tương tác năng lượng chi tiết của từng cấu dạng. Ngoài ra, văn bản khóa luận còn tồn tại một số lỗi chính tả và cách diễn đạt chưa thật sáng ý. Về mặt nội dung khoa học, nghiên cứu dừng lại ở mức mô phỏng điện toán in silico, chưa thực hiện được các thử nghiệm hoạt tính sinh học thực tế trên mô hình enzyme (in vitro kinase assay) hoặc trên các dòng tế bào ung thư để kiểm chứng tương quan giữa điểm số docking và hoạt tính sinh học thực nghiệm.

Hướng nghiên cứu tiếp theo được đề xuất từ kết quả của đề tài gồm:

• Tiến hành thử nghiệm hoạt tính gây độc tế bào trên các dòng tế bào ung thư người và đánh giá khả năng ức chế trực tiếp enzyme CDK2 đối với 4 hợp chất đã tổng hợp.
• Phát triển dãy dẫn xuất mới bằng cách đưa các nhóm thế cho/rút electron (như nhóm methoxy, hydroxy, halogen, nitro) lên các vị trí khác nhau của vòng benzaldehyde để khảo sát sâu hơn mối quan hệ giữa cấu trúc và hoạt tính sinh học.
• Ứng dụng mô phỏng động học phân tử (Molecular Dynamics simulation) để đánh giá độ bền nhiệt động và sự biến đổi hình thể của phức hệ protein CDK2 - phối tử theo thời gian.

Giá trị tham khảo

Khóa luận là tài liệu tham khảo chuyên khảo hữu ích cho sinh viên đại học, học viên cao học và nghiên cứu viên thuộc các ngành Công nghệ Kỹ thuật Hóa học, Hóa hữu cơ, Hóa dược và Công nghệ Sinh học. Các nội dung thực nghiệm có giá trị ứng dụng thực tiễn cao bao gồm: quy trình kỹ thuật điều chế tri-$n$-butyl borate và cơ chế phản ứng aldol hóa có bảo vệ nhóm chức bằng phức boron; các bước tổng hợp đóng vòng dị vòng năm cạnh isoxazole và pyrazole trong môi trường acid; phương pháp giải tích và biện luận chi tiết phổ NMR ($^1\text{H}$, $^{13}\text{C}$, HSQC) đối với các hợp chất mang khung liên hợp styryl đối xứng; và quy trình chuẩn bị thụ thể, thẩm định redocking cùng các bước thiết lập thông số docking phân tử trên phần mềm MOE.

Câu hỏi thường gặp

1. Vai trò của boron oxide ($\text{B}_2\text{O}_3$) và tri-$n$-butyl borate trong phản ứng tổng hợp chất TT01 là gì?
Trong phản ứng tổng hợp dẫn xuất TT01 giữa acetylacetone và benzaldehyde, nhóm methylene ở vị trí C-3 của acetylacetone có tính acid cao và rất dễ tham gia phản ứng ngưng tụ Knoevenagel không mong muốn. Boron oxide phản ứng với acetylacetone tạo thành phức chất chelate boron bảo vệ vị trí C-3, định hướng xúc tác $n$-butylamine chỉ bứt proton ở hai nhóm methyl đầu mạch (C-1 và C-5) để phản ứng với benzaldehyde. Tri-$n$-butyl borate được thêm vào với vai trò chất hút nước sinh ra trong quá trình phản ứng, ngăn ngừa nước thủy phân sớm phức chất boron diketonate trước khi phản ứng ngưng tụ hoàn thành.

2. Hợp chất TT01 được tổng hợp với các thông số hóa lý và hiệu suất như thế nào?
Hợp chất TT01 có tên IUPAC là (1E,4Z,6E)-5-hydroxy-1,7-diphenylhepta-1,4,6-trien-3-one, công thức phân tử $\text{C}{19}\text{H}{16}\text{O}_2$, khối lượng phân tử 276 g/mol. Phản ứng sử dụng 40 mmol benzaldehyde và 20 mmol acetylacetone, xúc tác $n$-butylamine trong dung môi ethyl acetate ở 80 °C trong 5 giờ, sau đó thủy phân bằng dung dịch HCl 1 M. Lượng sản phẩm sạch thu được sau sắc ký cột là 4,1 g, đạt hiệu suất 64,0%, tồn tại ở dạng chất rắn màu vàng xanh với điểm nóng chảy thực nghiệm đo được là 141,4 °C.

3. Vì sao tác giả lại định hướng tổng hợp các dẫn xuất chứa dị vòng isoxazole và pyrazole thay vì giữ nguyên cấu trúc curcumin tự nhiên?
Cấu trúc 1,3-diketone mạch hở của curcumin tự nhiên là nguyên nhân chính dẫn đến tính kém bền hóa học, dễ bị phân hủy chuyển hóa nhanh và có độ tan rất thấp, làm giảm sinh khả dụng trong cơ thể. Việc đóng vòng 1,3-diketone thành dị vòng năm cạnh chứa dị tố nitrogen và oxygen (isoxazole) hoặc hai dị tố nitrogen (pyrazole) giúp cố định cấu hình không gian, tăng độ bền chuyển hóa, đồng thời duy trì hoặc gia tăng ái lực liên kết với các thụ thể sinh học đích như protein kinase.

4. Mục tiêu sinh học nào được lựa chọn để docking phân tử và thông số của thụ thể đó trong nghiên cứu là gì?
Mục tiêu sinh học được lựa chọn là protein Cyclin-dependent kinase 2 (CDK2) - một enzyme điều hòa chu trình tế bào liên quan mật thiết đến sự tăng sinh mất kiểm soát trong bệnh ung thư. Cấu trúc ba chiều của phức hợp protein CDK2 được lấy từ Ngân hàng Dữ liệu Protein với mã PDB là 2R3I, xác định bằng phương pháp nhiễu xạ tia X với độ phân giải cao 1,28 Å, đồng kết tinh cùng phối tử ức chế chuẩn SCF (5-(2-fluorophenyl)-$N$-(pyridin-4-ylmethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine).

5. Bằng chứng phổ nghiệm nào chứng minh phản ứng đóng vòng isoxazole của chất TT02 đã diễn ra thành công?
Trên phổ $^1\text{H}$-NMR của hợp chất TT02, tín hiệu proton enolic đặc trưng của nhóm 1,3-diketone ở chất nền TT01 ($\delta = 6{,}218\text{ ppm}$) hoàn toàn biến mất, thay vào đó xuất hiện mũi đơn đặc trưng của proton trên vòng isoxazole tại vị trí $\delta = 7{,}035\text{ ppm}$ (1H, H-10). Đồng thời, các proton của liên kết đôi vinyl vẫn xuất hiện dạng mũi đôi với hằng số ghép lớn ($J = 16{,}5\text{ Hz}$), chứng minh khung styryl giữ nguyên cấu hình trans và phổ khối lượng MS ghi nhận mũi ion phù hợp với phân tử lượng 273 g/mol của $\text{C}{19}\text{H}{15}\text{ON}$.

Kết luận

Khóa luận tốt nghiệp của sinh viên Tạ Ngọc Thúy đã hoàn thành trọn vẹn mục tiêu tổng hợp toàn phần 04 dẫn xuất curcuminoid mạch hở và dị vòng (TT01, TT02, TT03, TT04) xuất phát từ tiền chất benzaldehyde với hiệu suất thực nghiệm tin cậy. Cấu trúc không gian và độ tinh khiết của các dẫn xuất được xác định sáng tỏ thông qua hệ thống phổ nghiệm hiện đại gồm $^1\text{H}$-NMR, $^{13}\text{C}$-NMR, HSQC và phổ khối MS. Mô phỏng docking phân tử trên phần mềm MOE 2008.10 bước đầu làm rõ khả năng gắn kết và cơ chế tương tác của các phân tử phối tử trên thụ thể kinase CDK2 (PDB: 2R3I). Toàn bộ công trình đóng góp quy trình thực nghiệm chuẩn mực cho việc tổng hợp hóa học dị vòng dẫn xuất curcumin và đặt nền tảng dữ liệu cho các nghiên cứu sàng lọc thuốc kháng ung thư tiếp theo.

Trích đoạn nội dung tài liệu

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KỸ THUẬT THÀNH PHÓ HÒ CHÍ MINH DO AN TOT NGHIỆP NGANH CONG NGHE KY THUAT HOA HOC TONG HOP VA DOCKING PHAN TU’ CAC DAN XUAT CURCUMIN TU BENZALDEHYDE GVHD: HOANG MINH HAO SVTH: TA NGOC THUY SKLOO5962 TP. Hồ Chí Minh, thang 07/2019 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP. HÒ CHÍ MINH KHÓA LUẬN TÓT NGHIỆP ĐẠI HỌC TỎNG HỢP VÀ DOCKING PHÂN TỬ CÁC DẪN XUẤT CURCUMIN TỪ BENZALDEHYDE MA SO KHOA LUAN: HC.08 SVTH: TA NGOC THUY MSSV: 15128068 GVHD: TS. HOANG MINH HAO Tp.

Hé Chi Minh, tháng 07 năm 2019 TRUONG DAI HOC SU PHAM KY THUAT THANH PHO HO CHi MINH KHOA CONG NGHE HOA HOC VA THUC PHAM BO MON CONG NGHE HOA HOC NHIEM VU KHOA LUAN TOT NGHIEP Họ và tên sinh viên: Tạ Ngọc Thúy MSSV: 15128068 Ngành: Công nghệ Kỹ thuật Hóa học Chuyên ngành: Hóa hữu cơ 1. Tên khóa luận: Tỏng hợp và docking phân tử các dẫn xuất curcumin từ benzaldehyde. Nhiệm vụ của khóa luận: - Tong hgp thanh céng 04 dan xuat curcumin tir chat nén benzaldehyde. - _ Tỉnh chế các sản phẩm bằng các phương pháp sắc ký cột, sắc ký bản mỏng.

Xác dịnh cấu trúc hóa học các dẫn xuất curcumin bằng phé 'H, '3C-NMR, MS va HSQC. - Xae dinh các tương tác giữa dẫn xuất và protein CDK2 (PDB: 2R31) bang phuong phap docking phan tr, Ngày giao nhiệm vụ khóa luận: 22/02/2019 Ngày hoàn thành khóa luận: 19/07/2019 Họ tên người hướng dẫn: 'I'S. [loang Minh Hào mm Nội dung hướng dẫn: Toàn bộ khóa luận Nội dung và yêu cầu khóa luận tốt nghiệp đã được thông qua bởi Trưởng Bộ môn Công nghệ Hóa học Tp.HCM, ngày I9 tháng @T năm 2019 TRƯỞNG BỘ MÔN NGƯỜI HƯỚNG ĐÀN A€-£. Hoàng Minh Hảo TRƯỜNG ĐH SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP.HCM CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM KHOA CNHH & TP Độc lập — Tự do - Hạnh phúc BỘ MÔN CN HÓA HỌC Sen eiieeesreeeneseteeeteeeee PHIẾU ĐÁNH GIÁ KHÓA LUẬN TÓT NGHIỆP NGÀNH CÔNG NGHỆ KỸ THUẬT HÓA HỌC KHÓA 2015 (NGUOI HUONG DAN) I.

Théng tin chung Họ và tên người hướng dẫn: Hoàng Minh Hảo Đơn vị công tác: Khoa CN Hóa học và Thực phẩm, ĐH SPKT TP. Hỗ Chí Minh Học hàm, học vị: Tiền sĩ Chuyên ngành: Hóa hữu cơ Họ và tên sinh viên: Tạ Ngọc Thúy MSSV: 15128068 Chuyên ngành: CNKT Hóa hữu cơ Tén dé tai: Téng hop va docking phân tử các dẫn xuất cureumin từ benzaldehyde Mã số khóa luận:. Nhận xét về khóa luận 2. Hình thức: Tổng số trang: 58 ; Số chương: 4 ; Số bảng: 4 ; Số hình: 18 Số tải liệu tham khảo: 32 ; Phần mềm tính toán: MOE 2008.0 Bồ cục: Đây đủ Hành vấn: Khá Sử dụng thuật ngữ chuyến món: Phủ hợp 2.

Mục tiêu và nội dung: Mục tiêu: Tổng hợp toàn phần và xác định cấu trúc hóa học 04 dẫn xuất curcumin va docking phan ur 04 dan xui: đối với protein 2R3I. SV Ngọc Thúy đã đạt được mục tiêu đê ra. Nội dung: Xuất phát từ chất nền benzaldehyde và pentanedione-2,4, xuc tác, 01 dẫn xuất cureumin đã được tổng hợp. Tiếp theo, phản ứng đóng vòng giữa nhóm 1,3-diketone va hydroxylamine va 02 dan xuat hydrazine đã được thực hiện đề tạo vòng isoxazole và pyrazole.

Cấu trúc hóa lọc của U4 dần xuất được xác định bằng phổ NMR và MS. Tắt cả các dân xuất sau đó được tiền hành docking phần tử lên mục tiêu tác động 2R3I để xác định các tương tác giữa 04 phối tử với 2R3I. Kết quả cũng được so sảnh với curcumin và 03 dẫn xuất chứa vòng isoxazole va pyrazole xuat phat tir curcumin. Ngọc Thuy đã thực hiện đầy đủ các nộ: dung công việc trên 2.

Kết quả đạt được: Có độ tin cậy 100% 2. Ưu điểm của khóa luận: Tổng hợp thành công 04 dẫn xuất curcumin từ chất nền nền benzaldehyde với hiệu suất khá. Đã làm rõ tương tác giữa 04 dẫn xuất với protein 2R3] kết hợp so sảnh với voi curcumin và 03 dẫn xuất chứa vòng isoxazole và pyrazole xuất phát từ eureumin. Phương pháp thực nghiệm phù hợp, dữ liệu phổ có độ tỉn cậy tuyệt đối.

Phần mềrn phủ hợp cho việc mồ phóng tương tác. Những thiếu sót của khóa luận: —_ Lỗi chính ta nhiều, câu văn chưa sáng ý — _ Thảo luận phần docking phân từ chưa sâu II. Nhận xét tỉnh thần và thái độ làm việc của sinh viên Ngọc Thúy hoàn thành sớm và tốt nhiệm vụ được giao. Luôn luôn lắng nghe đù bị la rầy.

Nhiệt tính đỡ bạn trong nhóm nghiên cứu. Là cô sv có k mặt khôi hai dang men. Can chu dong va độc lập hon trong công việc nhé Ngọc Thúy. Chúc em thành công trong tương lai.

+ Đề nghị của người phản biện Được bảo vệ Bé sung thém dé được bảo vệ _ LÍ Không được bảo vệ ũ Bảo vệ vào đợt khác h + Đánh giá của người hướng dẫn: rT Điểm đánh | STT | Nội dung đánh giá Điểm tối đa giá L 1 Chất lượng bài viết 30 | | Hình thức trình bày (đẹp, rõ ràng, tài liệu tham khảo 20 _| | diy dii/da dang. 2 17 | Bo cục của bài viễt (chặt chẽ, cân đối) 10 8 Ọ Noi dung khóa luận 60 | i as Vhong, pháp nghiên cửu phù hợp, đâm bảo độ tin cậy, xử 20 20 |+2 liệu Nội dung thực hiện, kết quả của đề tài đảm bảo tính 20 20 khoa hoe, cong nyhG Kết luận phù hợp với myc teu, ngi | dung nghién cứu 10 10 Hiệu quả ứng dụng và chuyển giao cong nghé 10 8 3 | Kỹ năng, thái độ của sinh viên 7 10 Kỹ năng thực nghiệm, xử lý tình huống 5 4 Thái độ làm việc nghiêm túc 5 5 TONG 100 92 - ye Ip./ À4 ngày “thùng | nắm Cán bộ hướng dẫn TRƯỜNG ĐH SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP.HCM CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM _KHOA CNHH & TP Độc lập - Tự do - Hạnh phúc BỘ MÔN CÔNG NGHỆ HÓA HỌC ee Tp.HCM, ngay tháng nắm PHIEU DANH GIA KHOA LUAN TOT NGHIEP NGANH CONG NGHE KY THUAT HOA HOC KHOA 2015 (PHAN BIEN) V _ Tatan te chong PGS. Lê Thị Hồng Nhan Họ và tên người phan DiGIHS .ccossssnssonresrsarecausvsuanreeraneroenscuss saubosanceck iodves paevenecensesevesss pecbesaa susveousoeesve Đơn vị công tác:. TpHHCte Học hàm, học vị: hú LÍ La 8ie.

Teast Tau én nganh:. Ky j thudt doch. Agee caaammuneceneaeeens Họ và tên sinh viên:. lea dM ate.Á3⁄4:2,£@ pe cn ee pee nghnb: Had, (huis.

Già 02ã600G12a8 TP đề tài: oe nia. MICA RAN A re BZA OM MUG QR, sicvescssesverssersssterscssscsnevecessvessscssecsusavensvecssensecssoensucenesnssnnevacesengenssscereassosbesssscotensesese Mã số khóa il Sa KT «3201 0suugitidtigtllivdt2888SG0091/0050 x80 80)480:G30g082asã Họ và tên người hướng dẫn:. Nhận xét về khóa luận 2. Hình thức: Tổng số trang: ; Số chương: ; Số bảng: ; Số hình: Số tài liệu tham khảo: Phần mềm tính toán: Bồ cục: Hanh van: Sử dụng thuật ngĩ chuyên môn: 2.

aa CIB VA MOT MUNG: sesnsscsrsssovererccprnsssscsrevesvosnenorsosnsanecneaneeseonscenesecesensancansensosnssseusronsusuacseusncenesesesessons "¬ ing. ey oe ail. Két qua Tàn šizãištgz3354255:8140142g/3i5395903546330011533/44-03335883184180061801ã-101GG1280G24/460439405104121463V006140026/143 _:Hoãn -ÍÑAN(,. Ưu điểm của khốe lUỗng sostaku2ttbitiicits6Gsi-caaitlGGscsseNiGásitkiyGatsS0Sug6-0138046161.

shi thai cpr play Hi tàu. “nụ cA ee cece ass teat. AiG ch dh, che. ee CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT Nay TRƯỞNG ĐH TH Kỹ muật THẾ Độc lập - Tự do - Hạnh phúc KHOA l BỘ MÔN CÔNG NGHỆ HÓA HỌC Tp.HCM, ngày tháng năm 2.

Những thiếu sót của khóa luận: $ , = a cua. Câu hỏi phản biện (ít nhất 02 câu hỏi). % “15 “Tài Aao efm. Ấ = càng, ghi vs 4).Á = fap Ai et.

ng ye pues Aachen.» Sy tala dag.LI03 LỆ 2ybSoI008010140Q80010000043130101809090//0001000%0 SE + Đê nghi của người phan biện Được bảo vệ kÌ Bổ sung thêm để được bảo vệ LÌ Không được bảo vệ |) Bảo vệ vào đợt khác L] + Đánh giá của người phản biện: STT | Nội dung đánh giá Điểm tối đa | Điểm đánh giá ` 1 | Chất lượng bài viết 30 3 Hình thức trình bày (đẹp, rõ ràng, tài liệu tham khảo 20 19 ddy di/da dang.) a Bồ cục của bài viễt (chặt chẽ, cân đối) 10 4 2 | Nội dung khóa luận 70 Gt Phương pháp nghiên cứu phù hợp, đảm bảo độ tin cá), 20 iq ị HN Su a——-. | Nor dung thy Hẹn, key ud cles de 1a deh) Dawe (1/1/ khoa học, công nghệ j |— Kế luận phù hợp với mục tiêu, Hội dụng nghiên cứu = te 1 | 7 tt 7 __| Hiệu quả ứng dụng và chuyền giao công nghệ (0 ri rm có TONG a a as — renee aac ad Tp. ng?’ thang OL nam £etg Cán bộ phản biện | nee PGS ES Le Thi Hing Nhan TRƯỜNG ĐH SƯ PHẠM KỸ THUẬT TP.HCM CỘNG HÒA XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM KHOA CNHH & TP Độc lập - Tự do - Hạnh phúc BỘ MÔN CÔNG NGHỆ HÓA HỌC Tp.HCM, ngay tháng năm _PHIEU TONG HOP DIEM CHAM KHOA LUAN TOT NGHIEP I. Théng tin chung _ ⁄ - Họ và tên sinh viên: send Qed GSS ea -lwM "mẽ Chuyên ngành.

the eee sancti - Tên đề tài:. -ÌMf Gỗ khóc luật: li. ĐÃ Lacoso-ieesiaoikkiiaiaiienidiicddoiuaoksskornisigpdindsee - Họ và tên người hướng dẫn chính:. Kết quả đánh giá sTT Hội đồng cham KLTN Điểm đánh giá l Chủ tịch hội đồng đế 2 Cán bộ hướng dẫn 92 3 Phản biện qx 4 Ủy viên 4£ 5 Ủy viên-Thư ký 94 ~ T Điểm kết luận của hội đồng: Băng wổt cú bag ĐỘ tuuuiggiepassz, Bằng chữ: .HCM, ngày — tháng nam THU KY HOI DONG (Ky và gi rõ hộ tên) de - „ any Me LỜI CÁM ƠN Để hoàn thành luận văn này, đầu tiên em xin gửi lời cám ơn đến các Thầy, Cô Khoa Công nghệ Hóa học và Thực phẩm, Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật Tp.

Em xin được cám ơn đến Thầy TS. Hoàng Minh Hảo - Giảng viên Bộ môn Công nghệ Hóa học, Khoa Công nghệ Hóa học và Thực phẩm đã tận tình hướng dẫn các kiến thức, kỹ năng trong phòng thí nghiệm. Bên cạnh đó Thay con hé trg và luôn quan tâm, động viên trong suốt quá trình thực hiện khóa luận tốt nghiệp này. Trong quá trình thực hiện khóa luận tại phòng thí nghiệm Hóa hữu cơ, Khoa Công nghệ Hóa học và Thực phẩm, em còn nhận được sự giúp đỡ và hỗ trợ rất nhiều từ Cô Nguyễn Thị Mỹ Lệ để em có thể sử dụng các thiết bị và dụng cụ trong phòng thí nghiệm.

Cuối cùng em xin chân thành cảm ơn gia đình và bạn bè, đã luôn tạo điều kiện cho em hoàn thành bài luận văn tết nhất có thể. Một lần nữa chúc mọi người nhiều sức khỏe, thành công và hạnh phúc trong cuộc sống.Hồ Chí Minh, tháng 07/2019 Age / Tạ Ngọc Thúy LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng tôi và được sự hướng dẫn của Thầy TS. Hoàng Minh Hảo. Các nội dung nghiên cứu, kết quả trong đề tài này là trung thực và chưa công bố.