Luận văn thạc sĩ: Nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể bách xanh Calocedrus macrolepis ở Tây Nguyên

Luận văn thạc sĩ phân tích hus nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể bách xanh tự nhiên calocedrus macrolepis kurz ở tây, đánh giá thực trạng, chỉ ra hạn chế, đề xuất giải pháp

Chuyên ngành

Di truyền học

Người đăng

Ẩn danh

Thể loại

Luận văn thạc sĩ khoa học

2015

69
1
0

Phí lưu trữ

30 Point

Mục lục chi tiết

LỜI CAM ĐOAN

LỜI CẢM ƠN

1. CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU

1.1. Giới thiệu tổng quát về loài Bách xanh

1.2. Vị trí phân loại Bách xanh

1.3. Một số đặc điểm sinh học chính và giá trị bảo tồn loài Bách xanh

1.4. Tình hình phân bố Bách xanh ở Việt Nam

1.5. Tính đa dạng di truyền giữa các quần thể thực vật

1.5.1. Khái niệm về quần thể thực vật

2. CHƯƠNG II: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

2.1. Vật liệu nghiên cứu

2.2. Nội dung nghiên cứu

2.3. Địa điểm nghiên cứu

2.4. Phương pháp nghiên cứu

2.4.1. Phương pháp tách chiết DNA tổng số từ 70 mẫu Bách xanh

2.4.2. Phương pháp nhân bản PCR

2.4.3. Phương pháp phân tích số liệu

3. CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.1. Kết quả tách chiết DNA tổng số loài Bách xanh

3.2. Tính đa dạng di truyền quần thể loài Bách xanh ở Tây Nguyên phân tích với chỉ thị ISSR

3.3. Tính đa hình DNA của 70 mẫu Bách xanh với chỉ thị ISSR

3.4. Đa dạng di truyền của 3 quần thể Bách xanh phân tích với chỉ thị ISSR

3.5. Mối quan hệ di truyền giữa 70 mẫu Bách xanh phân tích với chỉ thị ISSR

3.6. Nhận xét chung kết quả phân tích đa dạng di truyền quần thể Bách xanh với chỉ thị ISSR

3.7. Tính đa dạng di truyền quần thể loài Bách xanh ở Tây Nguyên phân tích với chỉ thị SSR

3.8. Tính đa hình DNA của 70 mẫu Bách xanh với chỉ thị SSR

3.9. Đa dạng di truyền của 3 quần thể Bách xanh phân tích với chỉ thị SSR

3.10. Mối quan hệ di truyền giữa 70 mẫu Bách xanh của 3 quần thể Bách xanh phân tích với chỉ thị SSR

3.11. Nhận xét chung kết quả phân tích đa dạng di truyền quần thể Bách xanh với chỉ thị SSR

3.12. Mối quan hệ di truyền giữa 70 mẫu Bách xanh với tổ hợp chỉ thị ISSR và SSR

KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ

TÀI LIỆU THAM KHẢO

Tóm tắt

I. Tổng quan về nghiên cứu đa dạng di truyền Bách xanh Calocedrus macrolepis

Nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể Bách xanh (Calocedrus macrolepis) ở Tây Nguyên là một chủ đề quan trọng trong bảo tồn và quản lý tài nguyên thiên nhiên. Bách xanh là loài cây có giá trị kinh tế và sinh thái cao, nhưng đang đối mặt với nguy cơ tuyệt chủng do khai thác quá mức và mất môi trường sống. Việc hiểu rõ về đa dạng di truyền của loài này sẽ giúp xây dựng các chiến lược bảo tồn hiệu quả.

1.1. Đặc điểm sinh học và phân bố của Bách xanh

Bách xanh (Calocedrus macrolepis) là loài cây gỗ lớn, thường xanh, có chiều cao từ 20-30m. Loài này phân bố chủ yếu ở các vùng núi đá vôi và núi đất tại Việt Nam, đặc biệt là ở Tây Nguyên. Môi trường sống của Bách xanh đang bị thu hẹp do nạn phá rừng và khai thác gỗ.

1.2. Tầm quan trọng của nghiên cứu đa dạng di truyền

Nghiên cứu đa dạng di truyền giúp xác định mức độ biến đổi gen trong quần thể Bách xanh, từ đó đưa ra các biện pháp bảo tồn và phát triển bền vững. Việc sử dụng các chỉ thị phân tử như ISSR và SSR sẽ cung cấp thông tin quý giá về cấu trúc di truyền của loài này.

II. Vấn đề và thách thức trong bảo tồn Bách xanh ở Tây Nguyên

Bách xanh đang phải đối mặt với nhiều thách thức trong việc bảo tồn. Việc khai thác gỗ trái phép, sự thay đổi môi trường sống và biến đổi khí hậu là những yếu tố chính đe dọa sự tồn tại của loài này. Cần có các biện pháp khẩn cấp để bảo vệ quần thể Bách xanh.

2.1. Nguy cơ tuyệt chủng và nguyên nhân

Theo số liệu điều tra, số lượng cây Bách xanh đang giảm mạnh do khai thác gỗ và mất môi trường sống. Các quần thể Bách xanh hiện nay chủ yếu là những cây già cỗi, trong khi tỷ lệ cây con sống sót rất thấp.

2.2. Tác động của biến đổi khí hậu

Biến đổi khí hậu đang làm thay đổi điều kiện sinh thái, ảnh hưởng đến sự phát triển và sinh trưởng của Bách xanh. Nhiệt độ tăng cao và lượng mưa không ổn định có thể làm giảm khả năng tái sinh của loài này.

III. Phương pháp nghiên cứu đa dạng di truyền Bách xanh hiệu quả

Để nghiên cứu đa dạng di truyền của Bách xanh, các phương pháp sinh học phân tử hiện đại như ISSR và SSR được áp dụng. Những phương pháp này cho phép phân tích chính xác cấu trúc di truyền và mức độ đa dạng gen trong quần thể.

3.1. Kỹ thuật ISSR trong nghiên cứu di truyền

Kỹ thuật ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) là một phương pháp hiệu quả để đánh giá đa dạng di truyền. Phương pháp này sử dụng các đoạn lặp lại đơn giản trong DNA để phân tích sự khác biệt giữa các mẫu Bách xanh.

3.2. Kỹ thuật SSR và ứng dụng của nó

Kỹ thuật SSR (Simple Sequence Repeat) cũng được sử dụng để phân tích đa dạng di truyền. SSR cho phép xác định các locus đa hình và đánh giá mức độ tương đồng di truyền giữa các quần thể Bách xanh.

IV. Kết quả nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể Bách xanh

Kết quả nghiên cứu cho thấy mức độ đa dạng di truyền của Bách xanh ở Tây Nguyên khá phong phú. Các chỉ thị ISSR và SSR đã chỉ ra sự khác biệt rõ rệt giữa các quần thể, từ đó cung cấp thông tin quan trọng cho công tác bảo tồn.

4.1. Phân tích đa dạng di truyền bằng chỉ thị ISSR

Phân tích bằng chỉ thị ISSR cho thấy tỷ lệ locus đa hình cao, cho thấy sự đa dạng di truyền phong phú trong quần thể Bách xanh. Điều này cho thấy khả năng thích ứng của loài trong điều kiện môi trường khác nhau.

4.2. Kết quả từ chỉ thị SSR

Kết quả từ chỉ thị SSR cũng cho thấy mức độ đa hình cao, với nhiều locus có giá trị PIC lớn. Điều này chứng tỏ rằng quần thể Bách xanh có khả năng duy trì sự đa dạng di truyền cần thiết cho sự tồn tại lâu dài.

V. Kết luận và hướng đi tương lai cho nghiên cứu Bách xanh

Nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể Bách xanh là bước quan trọng trong việc bảo tồn loài này. Cần tiếp tục nghiên cứu và áp dụng các biện pháp bảo tồn hiệu quả để đảm bảo sự tồn tại của Bách xanh trong tương lai.

5.1. Đề xuất các biện pháp bảo tồn

Cần xây dựng các khu bảo tồn cho Bách xanh và tăng cường công tác quản lý rừng. Việc nhân giống và trồng mới Bách xanh cũng cần được thực hiện để phục hồi quần thể.

5.2. Hướng nghiên cứu tiếp theo

Các nghiên cứu tiếp theo nên tập trung vào việc đánh giá tác động của biến đổi khí hậu đến Bách xanh và phát triển các phương pháp bảo tồn bền vững hơn.

18/07/2025
Luận văn thạc sĩ hus nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể bách xanh tự nhiên calocedrus macrolepis kurz ở tây nguyên002

Trích đoạn nội dung tài liệu

MỞ ĐẦU Tây Nguyên là một trong những vùng giàu loài lá kim nhất Việt Nam. Hầu hết những loài lá kim ở Tây Nguyên đều là những loài có giá trị khoa học và kinh tế cao trong đó có loài Bách xanh (Calocedrus macrolepis Kurz). Bách xanh có khu phân bố rộng với số lƣợng cá thể lớn, nhƣng gần đây đã bị khai thác nhiều để lấy gỗ và làm bột hƣơng, nên môi trƣờng sống của loài đang bị thu hẹp dần. Theo số liệu điều tra gần đây nhất của Nguyễn Tiến Hiệp năm 2013, hiện ở vùng suối Đatanla (Đà Lạt) chỉ còn những cây nhỏ, đƣờng kính dƣới 10cm, ven thác Darơcao (Đà Lạt) chỉ còn hơn 50 cây có đƣờng kính trên 5cm (số liệu chƣa công bố).

Ƣớc tính cả nƣớc ta hiện tại không còn quá 500 cây Bách xanh có đƣờng kính trên 10cm [6]. Môi trƣờng sống của Bách xanh cũng đang bị thu hẹp dần do nạn phá rừng và nạn nƣơng rẫy. Theo tổ chức Bảo tồn Thiên nhiên quốc tế (IUCN) 2014, Bách xanh đƣợc xếp vào bậc bị đe dọa (VU A2cd). Vì vậy, việc bảo tồn hữu hiệu nguồn gen Bách xanh là nhiệm vụ cấp bách đặt ra cho các nhà nghiên cứu.

Tuy nhiên, các nghiên cứu trƣớc đây mới chỉ tập trung vào việc phân loại dựa trên đặc điểm hình thái và nơi phân bố, còn các nghiên cứu về đa dạng di truyền nguồn gen vẫn rất hạn chế và mới chỉ tập trung cho một số loài [6], [8]. Đặc biệt các dẫn liệu về đa dạng nguồn gen di truyền của loài Bách xanh ở Tây Nguyên hầu nhƣ chƣa đƣợc nghiên cứu. Với sự phát triển mạnh mẽ của công nghệ sinh học hiện đại, nhiều loại chỉ thị phân tử đã đƣợc sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền nguồn gen làm cơ sở cho nghiên cứu bảo tồn và tái tạo nguồn gen ở đối tƣợng sinh vật nói chung và ở các loài cây lá kim nói riêng. Trong các loại chỉ thị thì chỉ thị ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) và SSR (Simple Sequence Repeat) đang đƣợc ứng dụng rộng rãi và có hiệu quả trong việc đánh giá đa dạng di truyền ở cả mức độ quần thể và loài cả trên giới và Việt Nam.

Chẳng hạn nhƣ Wang và cộng sự (2004) đã sử dụng chỉ thị ISSR phân tích đa dạng di truyền của 5 quần thể Bách xanh ở Tây Nam Trung Quốc [56] và đã chỉ ra tỉ lệ locus đa hình P = 26,9%. Hay năm 2010, Wang và Hao cũng đã sử dụng chỉ thị ISSR để đánh giá đa dạng di truyền của 13 quần thể thông 7 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com tự nhiên ở Trung Quốc (Pinus tabulaeformis Carr. Kết quả chỉ ra rằng mức độ biến đổi di truyền trong quần thể Thông ở Trung Quốc chủ yếu duy trì bên trong quần thể. Sự đa dạng di truyền có xu hƣớng giảm từ quần thể trung tâm đến quần thể trung gian và quần thể biên.

Cả hai yếu tố phân bố tự nhiên và hoạt động của con ngƣời đều ảnh hƣởng đến sự hình thành cấu trúc di truyền của loài này. Tuy nhiên, ở Việt Nam cho đến nay mới chỉ có nhóm tác giả Vũ Thị Thu Hiền và cộng sự (2009) đã sử dụng chỉ thi RAPD và cpDNA để nghiên cứu đa dạng di truyền của 20 mẫu Bách xanh thu đƣợc Hà Nội, Lâm Đồng, Quảng Bình. Kết quả phân tích đã chỉ ra các mẫu phân tích có hệ số di truyền dao động từ 0,75 đến 1, kết quả thu đƣợc còn cho thấy tính bảo thủ di truyền rất cao trong hệ gen lục lạp ở loài Bách xanh [5]. Xuất phát từ các cơ sở khoa học trên đây, chúng tôi tiến hành đề tài “Nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể Bách xanh tự nhiên (Calocedrus macrolepis Kurz) ở Tây Nguyên” với mục tiêu và nội dung nghiên cứu sau: - Xác định mức độ đa dạng nguồn gen di truyền cho 3 quần thể Bách xanh tự nhiên thu tại 3 tỉnh Lâm Đồng, Đắk Lắk và Gia Lai ở Tây Nguyên bằng chỉ thị ISSR và SSR làm cơ sở cho nghiên cứu giải pháp khai thác, bảo tồn và tái tạo nguồn gen.

- Xây dựng cây phát sinh chủng loại quần thể loài Bách xanh trên cơ sở phân tích chỉ thị ISSR và SSR. 8 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1. Giới thiệu tổng quát về loài Bách xanh 1. Vị trí phân loại Bách xanh Bách xanh (Calocedrus macrolepis Kurz) là loài cây thân gỗ, thân thẳng, phân cành sớm và phân tán rộng.

Bách xanh phân bố ở vùng núi đá vôi phía Bắc và vùng núi đất phía Nam, trong các cánh rừng nguyên sinh rậm thƣờng xanh hỗn giao nhiệt đới gió mùa núi thấp và ở độ cao 800 - 1500m trên mặt biển. Theo phân loại khoa học, Bách xanh thuộc: Giới (regnum): Plantae Ngành (phylum): Pinophyta Lớp (class): Pinopsida Bộ (order): Pinales Họ (familia): Cupressaceae Chi (genus): Calocedrus Loài (species): macrolepis 1. Một số đặc điểm sinh học chính và giá trị bảo tồn loài Bách xanh Bách xanh (Calocedrus macrolepis Kurz) là loài cây gỗ lớn, thƣờng xanh, chiều cao từ 20 – 25m có khi trên 30m, đƣờng kính 0,6 – 0,8m [8]. Vỏ màu nâu sẫm, nứt dọc sau bong mảng, vết vỏ đẽo màu hồng dày 4 – 10mm có nhiều sợi dài.

Cành lớn xoè rộng, cành non dẹt, mọc cách, xếp thành mặt phẳng. Lá hình vảy mọc đôi, từng đôi xếp lợp lên nhau, đôi ở giữa lớn hơn, dài 5mm, đôi ở mép gấp nếp, dài 2mm. Mặt trên màu xanh thẫm mặt dƣới có nhiều phấn trắng. Nón đơn tính cùng gốc, mọc lẻ đầu cành.

Nón đực hình trứng dài, mang 6 – 8 đôi nhị. Nón cái hình trứng trái xoan, dài 12 – 15mm, rộng 4mm mang 3 đôi vảy nón. Thƣờng chỉ đôi vảy ở giữa mang 2 noãn. Khi chín vảy nón hoá gỗ, hạt có 2 cánh, cánh lớn hình trứng, cánh nhỏ hình dải.

Hạt rụng tháng 10 – 12 (hình 1. Tái sinh bằng hạt tốt, đặc biệt ở nơi có nhiều ánh sáng. Cây con mọc nhiều nhƣ mạ nhƣng chỉ một số rất ít phát triển thành cây trƣởng thành. Ở Việt Nam, Bách xanh đƣợc phân bố tự nhiên ở nhiều tỉnh thành trên cả nƣớc, thƣờng mọc thành đám nhỏ hoặc rải rác trên độ cao 9 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com 900 – 1100m vùng Ba Vì (Hà Tây) và Đà Lạt (Lâm Đồng).

Trên thế giới, loài Bách xanh đƣợc phân bố ở nhiều quốc gia nhƣ Trung Quốc, Đài Loan, Ấn Độ và Thái Lan. Bách xanh là loài có giá trị kinh tế cao, gỗ thƣờng dùng trong xây dựng nhà cửa, đóng đồ gỗ cao cấp, tiện đồ mỹ nghệ và làm đồ dùng văn phòng. Hơn nữa gỗ Bách xanh có mùi thơm dịu nên còn đƣợc dùng làm bột hƣơng. Ngoài ra cây có dáng đẹp, có thể trồng làm cảnh.

Cây Bách xanh ở Vƣờn quốc gia Chƣ Yang Sin, Đắk Lắk (A: Cây trƣởng thành, B: tiêu bản của loài) (Ảnh: Nguyễn Tiến Hiệp, 2013) Hiện nay, môi trƣờng sống của Bách xanh đang bị thu hẹp dần do nạn phá rừng và nạn nƣơng rẫy. Bách xanh tái sinh bằng hạt tốt nhƣng tỷ lệ cây con sống sót rất thấp. Những cá thể Bách xanh hiện nay nếu còn trong tự nhiên với độ tuổi rất cổ, hơn 400 năm tuổi. Vì thế số lƣợng cây con không đủ thay thế cho lớp cây trƣởng 10 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com thành già cỗi và những cây bị khai thác vì mục đích thƣơng mại.

Bách xanh đang có nguy cơ tuyệt chủng trên phạm vi toàn cầu. Vùng suối Đatanla (Đà Lạt) chỉ còn những cây nhỏ đƣờng kính dƣới 10cm, ven thác Darơcao (Đà Lạt) chỉ còn hơn 50 cây có đƣờng kính trên 5cm, ƣớc tính cả nƣớc ta hiện tại không còn quá 500 cây Bách xanh có đƣờng kính trên 10cm. Cần gấp rút khoanh vùng bảo vệ và đƣa vào gieo trồng ở một số nơi quanh Đà Lạt và trên đỉnh núi Ba Vì [2]. Theo Tổ chức Bảo tồn Thiên nhiên quốc tế (IUCN) 2014, Bách xanh đƣợc xếp vào bậc bị đe dọa (VU A2cd) [6].

Vì vậy, việc bảo tồn hiệu quả nguồn gen Bách xanh là nhiệm vụ cấp bách đặt ra cho các nhà nghiên cứu. Tình hình phân bố Bách xanh ở Việt Nam Ở Việt Nam, Bách xanh đƣợc ghi nhận có cả ở các vùng núi đá vôi phía Bắc và các núi đất phía Nam. Các quần thể phía Nam Việt Nam phân bố ở Đắk Lắk, Lâm Đồng, Khánh Hòa và Ninh Thuận). Những cây trên các vùng núi đá vôi ở phía Bắc (Sơn La, Hà Giang, Cao Bằng, Bắc Kạn, Hòa Bình và Nghệ An) cho thấy sự khác nhau về hình thái của các bộ phận sinh dƣỡng.

Đó có thể là điều kiện môi trƣờng khắc nghiệt hơn hoặc là một loài khác. Trên thế giới Bách xanh (C. macrolepis) gặp ở Đông Bắc Myanma, Thái Lan, Lào và Đông Nam Trung Quốc [6]. Bách xanh gặp thành từng đám nhỏ trong các rừng nguyên sinh rậm thƣờng xanh hỗn giao nhiệt đới gió mùa núi thấp (nhiệt độ trung bình năm 15 - 200C, lƣợng mƣa trên 1500mm) ở độ cao 800 – 1500m trên mặt biển, ở các loại đất sét.

Mối đe dọa chính đối với loài Bách xanh là việc khai thác quá mức để lấy gỗ trên toàn bộ vùng phân bố của loài. Ở phía Nam Việt Nam, đặc biệt là ở Tây Nguyên, Bách xanh còn bị đe dọa tuyệt chủng do các khu rừng bị chia cắt, lửa rừng và do chuyển đổi nơi sống của cây thành đất nông nghiệp. Bách xanh đã đƣợc xếp vào nhóm IIA của Danh mục các loài động vật và thực vật quí hiếm [6] nên việc khai thác bị luật pháp hạn chế. Để bảo tồn loài Bách xanh, Sở Khoa học và Công nghệ tỉnh Lâm Đồng đã giao cho xí nghiệp giống Lâm nghiệp vùng Tây Nguyên và Dự án giống Lâm nghiệp Việt Nam có nhiệm vụ nhân giống một số loài cây lâm 11 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com nghiệp trong đó có Bách xanh để cung cấp cây con phục vụ cho việc trồng bổ sung cho rừng nguyên sinh.

Các quần thể Bách xanh chính đƣợc xác định nằm ngoài các khu bảo tồn nhƣng vẫn thuộc diện rừng phòng hộ nhƣ ở khu vực Thƣợng Đa Nhim (Lâm Đồng), Tân Tiến (Ninh Thuận), Khánh Sơn (Khánh Hòa). Vì việc khai thác loài cây này bị luật pháp hạn chế nên cần nâng cao nhận thức về bảo tồn tại các khu vực này [6], [8]. Tính đa dạng di truyền giữa các quần thể thực vật 1. Khái niệm về quần thể thực vật Quần thể là tập hợp các cá thể trong cùng một loài, cùng sinh sống trong một khoảng không gian xác định, vào một thời gian nhất định, có khả năng sinh sản và tạo thành những thế hệ mới [1].

Nội dung được bảo vệ bản quyền — Tải xuống đầy đủ

Tài liệu "Nghiên cứu đa dạng di truyền quần thể bách xanh Calocedrus macrolepis ở Tây Nguyên" cung cấp cái nhìn sâu sắc về sự đa dạng di truyền của loài bách xanh, một loài cây quan trọng trong hệ sinh thái Tây Nguyên. Nghiên cứu này không chỉ giúp xác định các yếu tố ảnh hưởng đến sự đa dạng di truyền mà còn mở ra hướng đi mới cho công tác bảo tồn và phát triển bền vững loài cây này. Độc giả sẽ tìm thấy thông tin hữu ích về các phương pháp nghiên cứu di truyền, cũng như tầm quan trọng của việc bảo tồn đa dạng sinh học trong khu vực.

Để mở rộng kiến thức của bạn về các nghiên cứu di truyền khác, bạn có thể tham khảo tài liệu Luận văn tốt nghiệp nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật rapd pcr đánh giá đa dạng di truyền của cam bố hạ với các dòng cây có múi, nơi nghiên cứu về sự đa dạng di truyền của một loài cây khác. Ngoài ra, tài liệu Phân tích mối quan hệ di truyền quần thể long não cinnamomum camphora bằng kỹ thuật rapd làm cơ sở cho bảo tồn và cải thiện giống cũng sẽ cung cấp thêm thông tin về các phương pháp bảo tồn di truyền. Cuối cùng, bạn có thể tìm hiểu thêm về Nghiên cứu đa dạng di truyền loài dầu song nàng dipterocarpus dyeri pierre ở rừng nhiệt đới đông nam bộ, một nghiên cứu khác trong lĩnh vực đa dạng di truyền cây trồng. Những tài liệu này sẽ giúp bạn có cái nhìn toàn diện hơn về sự đa dạng di truyền trong các loài thực vật khác nhau.