Khóa luận tốt nghiệp: Đánh giá khả năng phát hiện Mycoplasma hyopneumoniae ở lợn với bộ kit qpcr topspec®

• Tác giả: Dang Huynh Anh
• Người hướng dẫn: Dr. Dinh Xuan Phat
• Trường học: Nong Lam University Ho Chi Minh City
• Chuyên ngành: Biotechnology
• Đề tài: Evaluating the ability to detect Mycoplasma hyopneumoniae in swine of the TopSPEC® Mycoplasma hyopneumoniae qPCR Kit
• Loại tài liệu: Graduation thesis
• Năm xuất bản: 2019-2023
• Địa điểm: Thu Duc City

• ACKNOWLEDGEMENTS
• CONFIRMATION AND COMMITMENT
• ABSTRACT
• TÓM TẮT
• 1. CHAPTER 1: INTRODUCTION
• 1.1. Aims of this study
• 1.2. Mycoplasma hyopneumoniae
• 1.3. Basic biological characteristics of M. hyopneumoniae
• 1.4. Basic genomic characteristics of M. hyopneumoniae
• 2. MATERIALS AND METHODOLOGY
• 2.1. Time and location of the research
• 2.2. Materials
• 2.3. Checking the primer specificity by bioinformatics software
• 2.4. Sample pretreatment
• 2.5. DNA sample preparation
• 2.6. Real-time PCR reaction
• 2.7. Determine the limit of detection (LOD)
• 2.8. Testing analytical specificity
• 2.9. Evaluation of the diagnostic performance of the trial kit for the detection of M. hyopneumoniae
• 2.10. Survey the kit's detection of M. hyopneumoniae on field samples
• 3. RESULTS AND DISCUSSION
• 3.1. Checking the primer specificity by bioinformatics software
• 3.2. Determine the limit of detection (LOD) of the trial kit
• 3.3. Testing analytical specificity
• 3.4. Evaluation of the diagnostic performance of the trial kit for the detection of M. hyopneumoniae in field samples
• 3.5. Assessment of the stability of the trial kit for the detection of M. hyopneumoniae
• 4. CONCLUSION AND RECOMMENDATIONS
• 4.1. Conclusion
• 4.2. Recommendations
• REFERENCES
• APPENDIX
• LIST OF ABBREVIATIONS
• LIST OF TABLES
• LIST OF FIGURES

I. Giới thiệu về Mycoplasma hyopneumoniae và bệnh hô hấp ở lợn

Mycoplasma hyopneumoniae là tác nhân chính gây bệnh viêm phổi mãn tính ở lợn, một bệnh hô hấp phổ biến trong ngành chăn nuôi. Bệnh này gây thiệt hại kinh tế lớn do giảm năng suất và tăng tỷ lệ tử vong. Bộ kit qPCR TopSPEC® được phát triển để phát hiện nhanh và chính xác Mycoplasma hyopneumoniae, hỗ trợ chẩn đoán và quản lý dịch bệnh hiệu quả. Nghiên cứu này đánh giá khả năng phát hiện của bộ kit này trong điều kiện thực tế.

1.1. Tổng quan về Mycoplasma hyopneumoniae

Mycoplasma hyopneumoniae là vi khuẩn không có thành tế bào, thuộc họ Mycoplasmataceae. Chúng gây bệnh viêm phổi mãn tính ở lợn, làm suy giảm hệ hô hấp và tạo điều kiện cho các bệnh nhiễm trùng thứ cấp. Vi khuẩn này lây lan qua tiếp xúc trực tiếp hoặc qua không khí, gây khó khăn trong kiểm soát dịch bệnh. Bộ kit qPCR TopSPEC® được thiết kế để phát hiện nhanh và chính xác vi khuẩn này, giúp giảm thiểu thiệt hại kinh tế.

1.2. Tầm quan trọng của chẩn đoán nhanh

Chẩn đoán nhanh Mycoplasma hyopneumoniae là yếu tố then chốt trong quản lý dịch bệnh. Bộ kit qPCR TopSPEC® cung cấp phương pháp chẩn đoán nhanh với độ nhạy và độ đặc hiệu cao, giúp phát hiện sớm và kiểm soát hiệu quả dịch bệnh. Nghiên cứu này tập trung đánh giá hiệu quả của bộ kit trong việc phát hiện vi khuẩn này ở lợn.

II. Phương pháp và kết quả nghiên cứu

Nghiên cứu sử dụng bộ kit qPCR TopSPEC® để đánh giá khả năng phát hiện Mycoplasma hyopneumoniae trong mẫu lợn. Kết quả cho thấy bộ kit có độ nhạy và độ đặc hiệu cao, với giới hạn phát hiện (LOD) là 50 bản sao/phản ứng. Tuy nhiên, bộ kit cũng cho thấy phản ứng không đặc hiệu với một số chủng E. coli, cần cải thiện trước khi thương mại hóa.

2.1. Đánh giá độ nhạy và độ đặc hiệu

Bộ kit qPCR TopSPEC® đạt độ nhạy và độ đặc hiệu 100% trong phát hiện Mycoplasma hyopneumoniae. Giới hạn phát hiện (LOD) là 50 bản sao/phản ứng, cho thấy khả năng phát hiện vi khuẩn ở nồng độ thấp. Tuy nhiên, phản ứng không đặc hiệu với E. coli là hạn chế cần khắc phục.

2.2. Ứng dụng thực tế trong mẫu thực địa

Bộ kit được thử nghiệm trên các mẫu thực địa, cho kết quả chính xác trong phát hiện Mycoplasma hyopneumoniae. Tuy nhiên, phản ứng không đặc hiệu với E. coli cần được cải thiện để đảm bảo độ tin cậy trong ứng dụng thực tế.

III. Kết luận và khuyến nghị

Bộ kit qPCR TopSPEC® là công cụ tiềm năng trong chẩn đoán Mycoplasma hyopneumoniae ở lợn. Tuy nhiên, cần cải thiện độ đặc hiệu để tránh phản ứng chéo với E. coli. Nghiên cứu này cung cấp cơ sở cho việc phát triển và hoàn thiện bộ kit trước khi thương mại hóa.

3.1. Giá trị thực tiễn của nghiên cứu

Nghiên cứu đánh giá hiệu quả của bộ kit qPCR TopSPEC® trong phát hiện Mycoplasma hyopneumoniae, hỗ trợ chẩn đoán nhanh và quản lý dịch bệnh. Kết quả nghiên cứu có ý nghĩa quan trọng trong việc cải thiện công cụ chẩn đoán bệnh hô hấp ở lợn.

3.2. Hướng phát triển trong tương lai

Cần tiếp tục nghiên cứu để cải thiện độ đặc hiệu của bộ kit qPCR TopSPEC®, đặc biệt là khả năng phân biệt Mycoplasma hyopneumoniae với các vi khuẩn khác như E. coli. Điều này sẽ mở rộng ứng dụng của bộ kit trong thực tế.