Luận văn thạc sĩ: Khả năng ức chế protein gây ung thư của cây lá đắng Veronia Amygdalina qua phương pháp docking phân tử

• Tác giả: Huỳnh Thị Yến Nhi
• Người hướng dẫn: PGS. Vũ Thị Ngân
• Trường học: Trường Đại Học Quy Nhơn
• Chuyên ngành: Hóa lí thuyết và hóa lí
• Đề tài: Nghiên Cứu Ức Chế Protein Gây Ung Thư Từ Cây Lá Đắng Vernonia Amygdalina Bằng Phương Pháp Docking Phân Tử
• Loại tài liệu: luận văn thạc sĩ
• Năm xuất bản: 2021
• Địa điểm: Bình Định

• LỜI CAM ĐOAN
• 1. MỞ ĐẦU
• 1.1. Tổng quan tình hình nghiên cứu
• 1.2. Lý do chọn đề tài
• 1.3. Mục tiêu nghiên cứu
• 1.4. Đối tượng, phạm vi nghiên cứu
• 1.5. Phương pháp nghiên cứu
• 1.5.1. Phương pháp tính hóa học lượng tử bán kinh nghiệm
• 1.5.2. Phương pháp docking phân tử
• 1.5.2.1. Thuật toán docking phân tử
• 1.5.2.2. Các thuật toán docking phổ biến
• DANH MỤC CÁC CHỮ CÁI VIẾT TẮT
• DANH MỤC BẢNG
• DANH MỤC HÌNH
• KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO

I. Tổng quan về protein gây ung thư và cây lá đắng

Nghiên cứu tập trung vào protein gây ung thư, đặc biệt là các thụ thể EGFR và HER2, liên quan đến nhiều loại ung thư phổ biến. Cây lá đắng (Veronia Amygdalina) được chọn làm đối tượng nghiên cứu do thành phần hóa học đa dạng và hoạt tính sinh học mạnh mẽ. Cây này chứa các hợp chất như flavonoid, terpenoid, và acid phenolic, có khả năng ức chế tế bào ung thư. Phương pháp docking phân tử được sử dụng để đánh giá tương tác giữa các hợp chất tự nhiên và protein mục tiêu.

1.1. Protein gây ung thư và cơ chế hoạt động

Các protein gây ung thư như EGFR và HER2 đóng vai trò quan trọng trong quá trình phân chia và tăng trưởng tế bào. Sự đột biến hoặc biểu hiện quá mức của các thụ thể này dẫn đến ung thư. Nghiên cứu nhấn mạnh tầm quan trọng của việc ức chế các thụ thể này để ngăn chặn sự phát triển của tế bào ung thư.

1.2. Thành phần hóa học của cây lá đắng

Cây lá đắng (Veronia Amygdalina) chứa nhiều hợp chất tự nhiên có hoạt tính sinh học cao, bao gồm flavonoid, terpenoid, và acid phenolic. Các hợp chất này đã được chứng minh có khả năng chống oxy hóa, kháng khuẩn, và đặc biệt là ức chế tế bào ung thư. Nghiên cứu tập trung vào việc khai thác tiềm năng của các hợp chất này trong điều trị ung thư.

II. Phương pháp docking phân tử và ứng dụng

Phương pháp docking phân tử là công cụ quan trọng trong nghiên cứu dược lý, giúp dự đoán tương tác giữa phối tử và thụ thể protein. Nghiên cứu sử dụng phương pháp này để đánh giá khả năng ức chế của các hợp chất tự nhiên trong cây lá đắng đối với EGFR và HER2. Kết quả docking phân tử cung cấp thông tin về năng lượng liên kết và cấu trúc tương tác, từ đó xác định các hợp chất tiềm năng.

2.1. Nguyên lý và quy trình docking phân tử

Docking phân tử là quá trình tìm kiếm cấu dạng tối ưu giữa phối tử và thụ thể protein. Nghiên cứu sử dụng các phần mềm như AutoDock và Gaussian để mô phỏng tương tác. Quy trình bao gồm tối ưu hóa cấu trúc phân tử, xác định vị trí liên kết, và đánh giá năng lượng liên kết. Phương pháp này giúp tiết kiệm thời gian và chi phí trong quá trình nghiên cứu dược lý.

2.2. Ứng dụng docking phân tử trong nghiên cứu ung thư

Docking phân tử được ứng dụng rộng rãi trong nghiên cứu ung thư, đặc biệt là trong việc tìm kiếm các hợp chất ức chế protein gây ung thư. Nghiên cứu so sánh hiệu quả của các hợp chất tự nhiên trong cây lá đắng với các thuốc tổng hợp đã được FDA chấp thuận. Kết quả cho thấy nhiều hợp chất tự nhiên có tiềm năng ức chế mạnh hơn hoặc tương đương với các thuốc tổng hợp.

III. Kết quả và đánh giá tiềm năng ứng dụng

Nghiên cứu đã xác định được nhiều hợp chất trong cây lá đắng có khả năng ức chế mạnh các protein gây ung thư EGFR và HER2. Các hợp chất flavonoid và terpenoid cho thấy năng lượng liên kết âm, chứng tỏ khả năng tương tác mạnh với thụ thể. Kết quả này mở ra hướng nghiên cứu mới trong việc phát triển thuốc điều trị ung thư từ nguồn dược liệu tự nhiên.

3.1. Kết quả docking phân tử với EGFR

Các hợp chất flavonoid và terpenoid trong cây lá đắng cho thấy khả năng ức chế mạnh thụ thể EGFR. Năng lượng liên kết của các hợp chất này thấp hơn so với thuốc tổng hợp Erlotinib, chứng tỏ tiềm năng ứng dụng cao trong điều trị ung thư phổi và gan.

3.2. Kết quả docking phân tử với HER2

Nghiên cứu cũng xác định các hợp chất trong cây lá đắng có khả năng ức chế thụ thể HER2, liên quan đến ung thư vú và buồng trứng. Các hợp chất này cho thấy năng lượng liên kết âm, tương đương hoặc thấp hơn so với thuốc tổng hợp Lapatinib.