Phân Lập Và Nhận Diện Vi Sinh Vật Phân Hủy Agar Từ Các Môi Trường Đa Dạng Tại Việt Nam - Khóa Luận Tốt Nghiệp

• Tác giả: Vu Thi My Duyen
• Người hướng dẫn: Assoc. Vu Nguyen Thanh
• Trường học: Vietnam National University of Agriculture
• Chuyên ngành: Biotechnology
• Đề tài: Isolation and Identification of Agar-Degrading Microorganisms from Diverse Environments in Vietnam
• Loại tài liệu: thesis
• Năm xuất bản: 2021
• Địa điểm: Hanoi

• COMMITMENT
• ACKNOWLEDGEMENTS
• TABLE OF CONTENTS
• LIST OF FIGURES
• LIST OF TABLES
• ABBREVIATIONS
• ABSTRACT
• 1. INTRODUCTION
• 1.1. Introduction of agar
• 1.2. Agar structure
• 1.3. Agar source
• 1.4. Properties of agar
• 1.5. Agarolytic microorganisms
• 1.6. Agar-degrading enzymes
• 1.6.1. Agarase source
• 1.6.2. α-Agarase
• 1.6.3. β-Agarase
• 2. MATERIALS AND METHODS
• 2.1. Study laboratory and time
• 2.2. Samples for isolation
• 2.3. Method of isolation. Purification and maintenance of isolates
• 2.4. Observation of colonies and cells
• 2.5. Protein fingerprinting by SDS-PAGE method
• 2.6. DNA extraction and purification
• 2.7. Agarase assay by Congo red staining
• 3. RESULTS AND DISCUSSION
• 3.1. Selection of agar degrading microorganisms
• 3.2. Observation of colonies, cells. Grouping by protein fingerprinting
• 3.3. Identification of microorganisms by rDNA sequencing
• 4. CONCLUSION AND SUGGESTION

I. Giới thiệu về agar

Agar là một polysaccharide quan trọng, chủ yếu được chiết xuất từ các loài tảo đỏ như Gelidium và Gracilaria. Agar được biết đến như một chất tạo gel trong ngành thực phẩm, mỹ phẩm và y tế. Thành phần chính của agar bao gồm agarose và agaropectin. Agarose là một polymer tuyến tính, trong khi agaropectin là một hỗn hợp không đồng nhất. Tính chất vật lý của agar phụ thuộc vào tỷ lệ giữa agarose và agaropectin, cũng như cấu trúc hóa học của chúng. Agar có khả năng tạo gel mà không cần thêm chất tạo gel, điều này làm cho nó trở thành một nguyên liệu lý tưởng trong nhiều ứng dụng công nghiệp.

1.1. Cấu trúc của agar

Agarose chiếm khoảng 70% trong cấu trúc của agar, trong khi agaropectin chiếm phần còn lại. Cấu trúc của agarose bao gồm các phân tử β-D-galactose và 3,6-anhydro-α-L-galactopyranose. Tính chất gel của agar phụ thuộc vào nồng độ và trọng lượng phân tử trung bình của nó. Agar có thể hòa tan trong nước ở nhiệt độ từ 95ºC đến 100ºC, và khả năng tạo gel của nó rất quan trọng trong các ứng dụng thực phẩm và sinh học.

II. Vi sinh vật phân hủy agar

Vi sinh vật phân hủy agar chủ yếu được tìm thấy trong môi trường biển, nhưng cũng đã được phát hiện trong nước ngọt và đất. Các vi sinh vật này thuộc nhiều phylum khác nhau, chủ yếu là Proteobacteria và Bacteroidetes. Nghiên cứu đã chỉ ra rằng các vi sinh vật này có khả năng sản xuất enzyme agarase, enzyme này có thể phân hủy agar thành các sản phẩm có giá trị như oligosaccharides. Việc phân lập và nhận diện các vi sinh vật này có ý nghĩa quan trọng trong việc phát triển các ứng dụng sinh học và công nghiệp.

2.1. Các loại vi sinh vật phân hủy agar

Nhiều loại vi sinh vật đã được phân lập từ môi trường biển, bao gồm các giống như Pseudomonas, Alteromonas và Vibrio. Các vi sinh vật này có khả năng sản xuất enzyme agarase, giúp phân hủy agar thành các sản phẩm có giá trị. Việc nghiên cứu và phân lập các vi sinh vật này không chỉ giúp hiểu rõ hơn về sự đa dạng sinh học mà còn mở ra cơ hội cho các ứng dụng trong y tế và công nghiệp.

III. Enzyme phân hủy agar

Enzyme agarase có khả năng phân hủy agar thành các sản phẩm có trọng lượng phân tử thấp hơn. Có hai loại enzyme chính là α-agarase và β-agarase, mỗi loại có cơ chế cắt khác nhau. α-agarase cắt liên kết α-1,3, trong khi β-agarase cắt liên kết β-1,4. Các sản phẩm từ quá trình phân hủy này có thể được sử dụng trong nhiều lĩnh vực, từ thực phẩm đến dược phẩm.

3.1. Tính chất của enzyme agarase

Enzyme agarase có thể được tìm thấy trong nhiều nguồn khác nhau, bao gồm nước biển, trầm tích biển và đất. Trọng lượng phân tử của enzyme này rất đa dạng, từ 20 đến 360 kDa. Việc nghiên cứu tính chất của enzyme agarase không chỉ giúp hiểu rõ hơn về cơ chế hoạt động của nó mà còn mở ra cơ hội cho việc phát triển các ứng dụng công nghiệp mới.

IV. Ứng dụng của enzyme agarase

Enzyme agarase có nhiều ứng dụng trong công nghiệp thực phẩm, dược phẩm và mỹ phẩm. Các sản phẩm từ quá trình phân hủy agar có thể được sử dụng như prebiotics, thành phần trong mỹ phẩm và trong các quy trình tinh chế DNA. Việc phát triển các ứng dụng này không chỉ giúp nâng cao giá trị của agar mà còn góp phần vào việc bảo vệ môi trường thông qua việc sử dụng các sản phẩm sinh học.

4.1. Ứng dụng trong ngành thực phẩm

Trong ngành thực phẩm, agar và các sản phẩm từ quá trình phân hủy của nó được sử dụng như chất tạo gel, chất ổn định và chất tạo độ nhớt. Các sản phẩm này không chỉ cải thiện chất lượng thực phẩm mà còn có lợi cho sức khỏe con người. Việc nghiên cứu và phát triển các ứng dụng này có thể giúp nâng cao giá trị kinh tế của ngành công nghiệp thực phẩm.