Các Phương Pháp Dự Đoán Khả Năng Ức Chế Bệnh Dựa Trên RNA

Luận văn thạc sĩ trình bày các phương pháp dự đoán khả năng ức chế bệnh dựa trên biểu diễn RNA và ứng dụng máy tính trong nghiên cứu.

• Tác giả: Phạm Thị Mai Hoa
• Người hướng dẫn: TS. Bùi Ngọc Thăng
• Trường học: Đại học Quốc gia Hà Nội
• Chuyên ngành: Công nghệ thông tin
• Đề tài: Phương Pháp Dự Đoán Khả Năng Ức Chế Bệnh Dựa Trên RNA
• Loại tài liệu: luận văn thạc sĩ
• Năm xuất bản: 2017
• Địa điểm: Hà Nội

Tóm tắt

I. Tổng Quan Về RNAi Khám Phá Khả Năng Ức Chế Bệnh Tiềm Năng

RNA (Axit Ribonucleic) đóng vai trò then chốt trong biểu hiện gen và di truyền. Ngoài các vai trò quen thuộc như vận chuyển thông tin (mRNA), tổng hợp protein (tRNA, rRNA), RNA còn tham gia điều hòa biểu hiện gen thông qua RNAi (RNA interference). RNAi là cơ chế điều hòa biểu hiện gen, trong đó RNA mạch kép ức chế biểu hiện gen bằng cách bổ sung trình tự nucleotide. Cơ chế này liên quan đến sự phân giải mRNA, gây ức chế biểu hiện gen và giảm tổng hợp protein. Việc phát hiện ra RNAi đã mở ra hướng mới trong nghiên cứu và điều trị bệnh.

1.1. Lịch Sử Nghiên Cứu RNAi Từ Cosuppression Đến Giải Nobel

Lịch sử RNAi bắt đầu với những hiện tượng như cosuppression và quelling, nhưng bước đột phá đến từ Andrew Fire và Craig Mello năm 1998. Họ phát hiện dsRNA (double-stranded RNA) hiệu quả hơn nhiều trong việc ức chế biểu hiện gen so với RNA đơn. Thí nghiệm của họ trên Caenorhabditis elegans chứng minh rằng dsRNA có thể làm 'tắt' gen mục tiêu. Phát hiện này đã mang về cho họ giải Nobel Sinh lý học và Y học năm 2006, mở đường cho các nghiên cứu sâu rộng hơn về khả năng ức chế bệnh của RNA.

1.2. Cơ Chế Can Thiệp RNA siRNA và miRNA Hoạt Động Ra Sao

Cơ chế RNAi xoay quanh siRNA (short interfering RNA) và miRNA (microRNA). siRNA, có kích thước khoảng 21-23 nucleotide, được tạo ra từ dsRNA bởi enzyme Dicer. Sau đó, siRNA kết hợp với phức hệ RISC (RNA-induced silencing complex), nhắm mục tiêu và phân giải mRNA có trình tự bổ sung. miRNA hoạt động tương tự, nhưng thường liên kết không hoàn toàn với mRNA mục tiêu, dẫn đến ức chế dịch mã thay vì phân giải. Cơ chế này rất quan trọng trong việc điều chỉnh biểu hiện gen, bảo vệ chống lại virus và kiểm soát sự phát triển.

II. Các Hướng Nghiên Cứu Tiềm Năng Ức Chế Bệnh Bằng RNA Hiện Nay

Nghiên cứu về khả năng ức chế bệnh của RNA đang phát triển mạnh mẽ. Các hướng nghiên cứu tập trung vào siRNA, miRNA, và các loại RNA không mã hóa khác như lncRNA và circRNA. Mục tiêu là khai thác khả năng ức chế gen mục tiêu để điều trị các bệnh di truyền, ung thư, nhiễm virus và các bệnh lý khác. Các nghiên cứu sử dụng tin sinh học và học máy để dự đoán hiệu quả của RNAi và thiết kế các phân tử RNA có khả năng ức chế bệnh cao.

2.1. Ứng Dụng RNAi Trong Điều Trị Ung Thư Tiềm Năng và Thách Thức

RNAi có tiềm năng lớn trong điều trị ung thư bằng cách ức chế các gen quan trọng cho sự phát triển và di căn của tế bào ung thư. Các nghiên cứu đang tập trung vào việc phát triển các phương pháp phân phối siRNA và miRNA đến các tế bào ung thư một cách hiệu quả và an toàn. Tuy nhiên, thách thức vẫn còn lớn, bao gồm việc vượt qua các rào cản sinh học, giảm thiểu tác dụng phụ và đảm bảo tính đặc hiệu của RNAi đối với các tế bào ung thư.

2.2. RNAi Trong Điều Trị Bệnh Nhiễm Virus Cơ Chế Tác Động và Triển Vọng

RNAi có thể được sử dụng để ức chế sự nhân lên của virus bằng cách nhắm mục tiêu vào các gen virus quan trọng. Các nghiên cứu đã chứng minh rằng siRNA có thể ức chế hiệu quả các virus như HIV, HBV và HCV trong môi trường in vitro và in vivo. Tuy nhiên, thách thức là phát triển các phương pháp điều trị RNAi có thể vượt qua sự biến đổi gen nhanh chóng của virus và đảm bảo hiệu quả lâu dài.

III. Phương Pháp Biểu Diễn RNA Bí Quyết Tối Ưu Dự Đoán Ức Chế

Việc biểu diễn RNA, đặc biệt là siRNA, một cách hiệu quả là rất quan trọng để dự đoán khả năng ức chế bệnh. Các phương pháp biểu diễn bao gồm sử dụng trình tự nucleotide, cấu trúc bậc hai, năng lượng tự do, và các đặc tính hóa lý khác. Gần đây, các phương pháp sử dụng học máy và trí tuệ nhân tạo (AI) để học các biểu diễn từ dữ liệu RNA lớn đang trở nên phổ biến. Mục tiêu là tạo ra các biểu diễn có thể nắm bắt được các đặc điểm quan trọng của siRNA liên quan đến hiệu quả ức chế của nó.

3.1. Biểu Diễn Dựa Trên Trình Tự Sử Dụng Thuật Toán Tìm Kiếm Motif

Phương pháp này biểu diễn RNA bằng cách sử dụng trình tự nucleotide của nó. Các thuật toán tìm kiếm motif có thể được sử dụng để xác định các motif trình tự liên quan đến khả năng ức chế. Các motif này có thể là các đoạn trình tự cụ thể, hoặc các cấu trúc bậc hai đặc biệt. Việc kết hợp thông tin về vị trí và tần suất của các motif có thể cải thiện độ chính xác dự đoán.

3.2. Biểu Diễn Cấu Trúc Phân Tích Năng Lượng và Hình Dạng RNA

Cấu trúc của RNA có ảnh hưởng lớn đến chức năng của nó. Phương pháp này biểu diễn RNA bằng cách sử dụng thông tin về cấu trúc bậc hai và bậc ba của nó. Các công cụ tin sinh học có thể được sử dụng để dự đoán cấu trúc RNA dựa trên trình tự nucleotide. Các đặc điểm cấu trúc như vòng lặp, thân kẹp, và các vùng không ghép cặp có thể liên quan đến khả năng ức chế.

IV. Ứng Dụng Học Máy Xây Dựng Mô Hình Dự Đoán Khả Năng Ức Chế

Học máy đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng các mô hình dự đoán khả năng ức chế bệnh dựa trên dữ liệu RNA. Các thuật toán như hồi quy tuyến tính, máy vector hỗ trợ (SVM), và mạng nơ-ron nhân tạo (ANN) có thể được huấn luyện để phân loại siRNA thành các nhóm có khả năng ức chế cao hoặc thấp. Việc sử dụng dữ liệu RNA sequencing và các loại dữ liệu omics khác có thể cải thiện hiệu quả của các mô hình dự đoán.

4.1. Hồi Quy Tuyến Tính Phương Pháp Đơn Giản Cho Dự Đoán Ban Đầu

Hồi quy tuyến tính là một phương pháp đơn giản nhưng hiệu quả để xây dựng các mô hình dự đoán ban đầu. Phương pháp này tìm cách thiết lập mối quan hệ tuyến tính giữa các đặc điểm của RNA (ví dụ: trình tự, cấu trúc) và khả năng ức chế của nó. Mặc dù đơn giản, hồi quy tuyến tính có thể cung cấp thông tin hữu ích về các yếu tố quan trọng ảnh hưởng đến hiệu quả ức chế.

4.2. Mạng Nơ Ron Nhân Tạo ANN Mô Hình Phức Tạp Cho Độ Chính Xác Cao

ANN là các mô hình học máy phức tạp có thể học các mối quan hệ phi tuyến tính giữa các đặc điểm của RNA và khả năng ức chế. Deep learning, một nhánh của ANN, đặc biệt hiệu quả trong việc xử lý dữ liệu RNA lớn và phức tạp. Tuy nhiên, việc huấn luyện ANN đòi hỏi lượng dữ liệu lớn và chi phí tính toán cao.

V. Đánh Giá Thực Nghiệm Kiểm Chứng Mô Hình và Chọn Lọc siRNA

Sau khi xây dựng các mô hình dự đoán, việc đánh giá độ chính xác dự đoán của chúng là rất quan trọng. Các phương pháp đánh giá bao gồm sử dụng dữ liệu kiểm tra, validation trên các tập dữ liệu độc lập, và kết quả thực nghiệm. Việc sử dụng các dòng tế bào và mô hình động vật in vivo để kiểm chứng khả năng ức chế của siRNA được dự đoán là hiệu quả cao là bước quan trọng để đưa các phương pháp điều trị RNAi vào thực tế.

5.1. Độ Chính Xác Dự Đoán Các Chỉ Số Đánh Giá Mô Hình

Các chỉ số như độ nhạy, độ đặc hiệu, độ chính xác dự đoán, và diện tích dưới đường cong ROC (AUC-ROC) thường được sử dụng để đánh giá hiệu quả của các mô hình dự đoán. Các chỉ số này cung cấp thông tin về khả năng của mô hình trong việc phân loại chính xác siRNA thành các nhóm có khả năng ức chế cao hoặc thấp.

5.2. Thử Nghiệm In Vitro và In Vivo Xác Nhận Khả Năng Ức Chế

Các thử nghiệm in vitro và in vivo cung cấp bằng chứng trực tiếp về khả năng ức chế của siRNA. Các thử nghiệm in vitro thường được thực hiện trên các dòng tế bào để đánh giá hiệu quả của siRNA trong việc giảm biểu hiện gen mục tiêu. Các thử nghiệm in vivo được thực hiện trên mô hình động vật để đánh giá hiệu quả của siRNA trong việc điều trị bệnh.

VI. Tương Lai Của RNAi Triển Vọng Ứng Dụng Trong Y Học và Nông Nghiệp

RNAi có tiềm năng cách mạng hóa y học và nông nghiệp. Trong y học, RNAi có thể được sử dụng để điều trị một loạt các bệnh, từ ung thư đến các bệnh di truyền. Trong nông nghiệp, RNAi có thể được sử dụng để cải thiện năng suất cây trồng, bảo vệ cây trồng khỏi sâu bệnh, và giảm thiểu sử dụng thuốc trừ sâu. Việc phát triển các phương pháp phân phối RNAi hiệu quả và an toàn là chìa khóa để hiện thực hóa tiềm năng của công nghệ này.

6.1. Thách Thức và Cơ Hội Vượt Qua Rào Cản Để Ứng Dụng Thực Tế

Mặc dù RNAi có tiềm năng lớn, nhưng vẫn còn nhiều thách thức cần vượt qua. Các thách thức bao gồm việc đảm bảo tính đặc hiệu của RNAi, giảm thiểu tác dụng phụ, và phát triển các phương pháp phân phối RNAi hiệu quả và an toàn. Tuy nhiên, những tiến bộ gần đây trong lĩnh vực này đang mở ra nhiều cơ hội mới cho việc ứng dụng RNAi trong thực tế.

6.2. Nghiên Cứu Liên Ngành Hợp Tác Để Thúc Đẩy Tiến Bộ RNAi

Sự tiến bộ trong lĩnh vực RNAi đòi hỏi sự hợp tác giữa các nhà khoa học từ nhiều lĩnh vực khác nhau, bao gồm sinh học phân tử, tin sinh học, hóa học, và y học. Việc chia sẻ dữ liệu, kiến thức, và kinh nghiệm có thể giúp thúc đẩy sự phát triển của các phương pháp điều trị RNAi hiệu quả và an toàn.

Trích đoạn nội dung tài liệu

Chương 1: Giới thiệu về khả năng ức chế bệnh của RNA. Chương này giới thiệu tổng quan về RNA, RNAi và đi sâu vào siRNA, ý nghĩa của chúng trong nghiên cứu và thực tiễn. Chương 2: Các hướng nghiên cứu khả năng ức chế bệnh của RNA. Chương này sẽ trình bày một số nghiên cứu tiếp cận theo hướng sinh học và tin sinh học.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.604801 11 Chương 3: Các cách thức biểu diễn RNA.

Trình bày các cách thức biểu diễn chuỗi RNA Chương 4: Đánh giá thực nghiệm các mô hình dự đoán khả năng ức chế bệnh của siRNA theo các biểu diễn dữ liệu khác nhau. Chương này trình bày các áp dụng cụ thể một số phương pháp dự đoán như Hồi quy tuyến tính và Luật kết hợp trên các biểu diễn khác nhau của chuỗi siRNA và đánh giá kết quả Phần Kết luận sẽ tổng kết lại nội dung đã nghiên cứu, đưa ra khả năng áp dụng thực tế và hướng đi tiếp theo. Phần còn lại là các nội dung bổ sung cho luận văn và các tài liệu tham khảo đã được sử dụng cho nghiên cứu.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail. GIỚI THIỆU VỀ KHẢ NĂNG ỨC CHẾ BỆNH CỦA RNA 1.

Tổng quan RNA can thiệp (RNAi) 1. Tổng quan RNAi RNA (Hoặc ARN) là axit ribonucleic – một trong hai loại axit nucleic (ADN, ARN) và là cơ sở di truyền cấp độ phân tử. Ở những loài không có ADN ví dụ một số loại virut thì ARN đóng vai trò là vật chất di truyền [1]. RNA tham gia vào quá trình phiên mã và dịch mã thông tin di truyền với nhiều vai trò khác nhau được đảm nhận bởi ba loại RNA (mRNA – RNA thông tin, tRNA – RNA vận chuyển, rRNA – RNA riboxom).

Ngoài ra RNA còn có các chức năng điều hòa biểu hiện gen hoặc có chức năng tham gia các quá trình phát triển, biệt hoá tế bào như RNAi (interfering RNA). RNA can thiệp (RNA interference, RNAi) là một cơ chế điều hòa biểu hiện gen được hướng dẫn (guiding) bởi RNA mà bằng cách này RNA mạch kép ức chế biểu hiện của các gen bằng các trình tự nucleotide bổ sung. Đó là trình tự đặc biệt và liên quan đến sự suy thoái của cả hai loại phân tử RNA: RNA sợi kép (dsRNA) và RNA sợi đơn thường mRNA là những sợi tương đồng trong trình tự dsRNA làm kích hoạt phản ứng trả lời [1]. Khả năng ức chế của RNAi có thể gây nên các hiệu ứng: Ức chế dịch mã đơn vị mRNA, ức chế sự phiên mã của gen ở trong nhân, phân giải mRNA.

Các hiệu ứng này gây nên sự ức chế biểu hiện của gen (ức chế gen), cụ thể sự tổng hợp protein sẽ bị giảm (knockdown) hoặc ngừng hoàn toàn (knock out) dẫn đến các tính trạng được quy định bởi gen đó bị suy giảm hoặc không xuất hiện.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail. Lịch sử nghiên cứu RNAi Hình 1: Lịch sử nghiên cứu RNAi [2] Trong lịch sử, sự can thiệp RNA được biết đến với những tên gọi khác như: RNA silencing, quelling, cosuppresion, RNA inteference - Năm 1984, Pesthea và các cộng sự đã nghiên cứu kỹ thuật Antisense-RNA trên vi khuẩn Escherichia Coli được đăng trên tạp chí PNAS số 81. Tuy nhiên ở giai đoạn này vẫn chưa hình dung được cơ chế gây ra sự ức chế gen. - Đến những năm đầu thập niên 1990, một số kết quả nghiên cứu được công bố trên các tạp chí quốc tế (Napoli và cộng sự, Vander Krol và cộng sự đều vào năm 1990) dựa trên quan sát hiện tượng của hoa dạ yến thảo (pentunia) khi cố gắng tạo cánh hoa màu tím bằng cách chuyển gen quy định màu tím Chalcone synthase (CHS) dưới tác động của promoter 35S.

Tuy nhiên cánh hoa lại bị đốm màu, có chỗ còn màu trắng, hiện tượng này được gọi là “đồng ức chế” - Năm 1992, phát hiện “quelling” ở Neurospora (Neurospora crassa - vi khuẩn mốc bánh mì màu đỏ (red bread mold)). Năm 1994, Cogoni và cộng sự đã tiến hành thí nghiệm tăng màu cam của nấm Neurospora crassa, và kết quả hầu như nấm không thể hiện và hiện tượng này được gọi là “quelling”. - Năm 1995, trên tạp chí Cell số 81, nhóm nghiên cứu của Guo và Kemphues đã đưa ra bằng chứng đầu tiên trên tuyến trùng Caenorhabditis elegans rằng: Phân (LUAN.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.604801 14 tử RNA chiều thuận (sense RNA) cũng gây ra sự ức chế gen tương đương với với phân tử RNA chiều ngược. Điều này gây ra sự lúng túng do kết quả khác với điều các nhà khoa học mong đợi.

- Đóng góp quan trọng nhất là việc phát hiện cơ chế RNAi từ việc nghiên cứu và thí nghiệm của Andrew Fire và C. Năm 1998, nhóm nghiên cứu Fire đã giải thích được điều nghịch lý này bằng những thí nghiệm trên tuyến trùng C. Mục đích của các thí nghiệm này là nhằm kiểm tra sự hỗ trợ lẫn nhau giữa các phân tử RNA theo cả hai chiều trong quá trình ức chế sự biểu hiện của gen. Kết quả là dsRNA ức chế sự biểu hiện của gen gấp 10 lần so với việc dùng phân tử RNA đơn lẻ theo chiều thuận hay chiều nghịch khi dùng phân tử RNA đơn lẻ còn dần dần mất tác dụng ức chế gen.

Như vậy nhóm nghiên cứu của giáo sư Fire đã xác định được ngyên nhân chủ yếu của hiện tượng RNA silencing chính là do phân tử dsRNA gây nên. Hiện tượng này được các nhà khoa học đặt cho một thuật ngữ là RNA interference (RNAi). Việc tiêm mRNA mã hóa protein cơ không gây ra sự thay đổi nào ở giun. Mã di truyền của mRNA được mô tả như là một trình tự sense.

Việc tiêm RNA antisense, một trình tự bổ sung với mRNA, cũng không mang lại tác động nào. Nhưng khi Fire và Mello tiêm RNA sence và antisense cùng với nhau thì họ quan sát thấy giun có những biểu hiện co giật đặc trưng. Những biểu hiện tương tự cũng được ghi nhận ở các giun bị khuyết hoàn toàn gen chức năng mã hóa protein cơ. Hình 2: Biểu hiện của giun khi tiêm RNA liên quan đến mã hóa protein cơ [3] (LUAN.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.604801 15 - Năm 2000, trên tạp chí Nature cũng công bố việc phát hiện hiện tượng RNAi trên loài ruồi giấm ProSophila do nhóm nghiên cứu của Richard Cathew tiến hành.

- Năm 2001, lần đầu tiên RNAi được mô tả trong các tế bào động vật có vú (Tuschl và cộng sự). - 2002, Tạo ra tái tổ hợp dicer để tạo siRNA, công nghệ RNAi trở thành công nghệ của năm. - 2003-2005, khoảng thời gian cải tiến và tìm hiểu rõ hơn về công nghệ RNAi. - Năm 2006, giải thưởng Nobel sinh lý và y học cho phát hiện cơ chế RNAi của hai nhà bác học Mỹ là Andrew Fire (ĐH Stanford) và Craig C.

Ý nghĩa của việc phát hiện ra RNAi - Can thiệp RNA chống lại sự nhiễm virus - Can thiệp RNA bảo đảm ổn định hệ gen - Can thiệp RNA như cơ chế kiểm soát quá trình tổng hợp protein và điều khiển sự phát triển - Can thiệp RNA như cơ chế bảo vệ nhiễm sắc tử cô đặc và tăng cường phiên mã - Can thiệp RNA cống hiến một phương pháp mới để kiềm chế gen chuyên biệt - Can thiệp RNA đã đề xuất một giải pháp hiệu quả trong điều trị bệnh di truyền trong tương lai 2. Cơ chế can thiệp RNAi 2. Các loại RNAi Trung tâm của quá trình can thiệp RNAi gồm 2 thành phần siRNA và miRNA và những RNA này có thể liên kết với các mRNA khác, tăng hoặc giảm hoạt động của chúng hoặc là ngăn không cho mRNA tổng hợp protein. siRNA (small interfeing RNA, short interfering RNA) là các RNA ngắn có kích thước khoảng 19 đến 25 nucleotit, được hình thành từ các RNA sợi đôi, tham gia vào quá trình tổng hợp protein, siRNA có khả năng điều khiển protein họ Argomaute tới đích điều hòa.

siRNA tổng hợp hóa học là dạng đơn giản nhất của RNAi. Một trong những rào cản lớn nhất để đạt được hiệu quả RNAi với siRNA là nhiều tế bào khó để chuyển nạp. Thử nghiệm RNAi thường được coi là thành (LUAN.604801 TIEU LUAN MOI download : skknchat@gmail.604801 16 công khi biểu hiện của gen mục tiêu giảm đến hơn 70%, khó có thể đạt được ở nhiều loại tế bào do hiệu quả của việc truyền thấp. Một nhược điểm nữa của việc sử dụng siRNA tổng hợp là thời gian hạn chế của các hiệu ứng sau khi truyền, điển hình là các hoạt động im lặng gen trong 24 giờ và giảm trong 48 giờ.

Tổng hợp hóa học của siRNA tốn kém trong việc chuyển nạp cơ sở liên quan tới các thuốc thử nghiệm dựa trên vector DNA. miRNA (micro RNA) là những đoạn RNA ngắn khoảng từ 19 đến 25 nucleotit, không tham gia vào quá trình tổng hợp protein. Tiền thân miRNA (Pre- miRNA) có cấu trúc dạng thân vòng (steen-loop) hay dạng kẹp tóc (hairpin). Ngoài ra, một loại RNAi khác là shRNA có thể được đưa vào bởi DNA plasmid, mẫu tuyến tính hoặc vector virus hoặc vi khuẩn.

Chính vì vậy loại RNAi này gây ra mối quan ngại về sự an toàn khi sử dụng. Cơ chế can thiệp RNA Khi các phần khác nhau của cơ chế RNAi đang được phát hiện, cơ chế RNAi đang trở nên ngày càng rõ ràng hơn. Trong vài năm gần đây, các nhà khoa học đã thu được những hiểu biết quan trọng trong việc làm sáng tỏ cơ chế RNAi. Sự kết hợp của các kết quả thu được từ một số thí nghiệm trên cơ thể sống (vivo) và trong ống nghiệm (vitro) đã tạo thành mô hình cơ học hai bước cho RNAi/PTGS (mô hình 2 bước được mô tả trong hình bên dưới).

Bước đầu tiên, được gọi là bước khởi đầu RNAi, liên quan đến việc gắn các phân tử RNA vào một sợi kép dsRNA lớn và sự phân tách của nó thành các đoạn RNA rời rạc có kích thước xấp xỉ 21 đến 25 nucleotide (siRNA). Trong bước thứ hai, mỗi siRNA kép được tách thành 2 sợi đơn siRNA, sợi passenger và sợi guider. Sợi passenger bị suy thoái còn sợi guider sẽ kết hợp vào RNA gây ra sự im lặng phức tạp (RISC). Các siRNA này tham gia một phức hợp đa nuclease (enzyme thủy phân), làm giảm các mRNA đơn mạch tương đồng.

Khi các phân tử mRNA này biến mất thì gen tương ứng bị bất hoạt, không có protein nào do gen đó mã hóa được tạo thành. Ngoài ra trong bước 1 có thể xảy ra sự khuếch đại siRNA. Vì các đột biến gen mã hóa polymeraza RNA phu ̣ thuô ̣c RNA (RNA-dependent RNA polymerase - RdRP) ảnh hưởng đến RNAi nên loại polymerase này được đề xuất là có thể sao chép siRNA như các tác nhân biểu sinh, cho phép chúng lan truyền khắp cây trồng và giữa các thế hệ trong C.