Luận án tiến sĩ về di truyền và sinh sản hàu năm 2016

• Tác giả: Vu Van In
• Người hướng dẫn: A/Prof. Wayne Knibb
• Trường học: University of the Sunshine Coast
• Chuyên ngành: Genetics, Ecology and Physiology
• Đề tài: Nghiên Cứu Di Truyền Và Sinh Sản Hàu
• Loại tài liệu: thesis
• Năm xuất bản: 2016
• Địa điểm: Maroochydore

• Declaration of the origin by author
• Statement of Contributions to Jointly Authored Works Contained in the thesis
• Statement of parts of the thesis submitted to qualify for the award of another degree
• Published Works by the author incorporated into the thesis
• Acknowledgments
• Abstract
• Table of Contents
• 1. CHƯƠNG 1: LITERATURE REVIEW
• 1.1. Genetic variation and genetic programs
• 1.2. DNA barcoding for resolving close-related oysters
• 2. CHƯƠNG 2: REPRODUCTIVE NEUROPEPTIDES THAT STIMULATE SPAWNING IN THE SYDNEY ROCK OYSTER SACCOSTREA GLOMERATA
• 2.1. Materials and methods
• 2.2. Transcriptomics and peptidomics
• 2.3. Neuropeptides identified from transcriptomes and LC-MS/MS analysis
• 2.4. In vivo bioassays
• 3. CHƯƠNG 3: CAN GENETIC DIVERSITY BE MAINTAINED ACROSS MULTIPLE MASS SELECTION LINES OF SYDNEY ROCK OYSTER, SACCOSTREA GLOMERATA DESPITE LOSS WITHIN EACH?
• 3.1. Materials and methods
• 3.2. Spawning and selection
• 3.3. Mitochondrial DNA sequencing and analysis
• 3.4. Validation and development of microsatellite primers
• 3.5. Data analysis and statistical methods
• 3.6. Microsatellite diversity within among lines and wild populations
• 3.7. mtDNA haplotype diversity among populations
• 4. CHƯƠNG 4: IS THE VIETNAM AQUACULTURE PACIFIC OYSTER CRASSOSTREA GIGAS? AND CAN CURRENT AQUACULTURE PRACTICES MAINTAIN GENETIC VARIATION AMONG LINES? A CASE STUDY ON TAXONOMY AND GENETIC DIVERSITY FOR A START OF BREEDING PROGRAM
• 4.1. Materials and methods
• 4.2. Mitochondrial DNA sequencing and analysis
• 4.3. Validation of microsatellite primers
• 4.4. Data analysis and statistical methods
• 4.5. ID identity and mtDNA haplotype diversity among lines
• 4.6. Identification of hatchery oyster ID in Nhatrang, Vietnam
• 4.7. Genetic diversity among C.
• 4.8. Inbreeding and effective population size assessed by analysis of genotypes using Colony software
• 5. CHƯƠNG 5: ARE STRAIN GENETIC EFFECT AND HETEROSIS EXPRESSION ALTERED WITH CULTURE SYSTEM AND REARING ENVIRONMENT IN THE PORTUGUESE OYSTER, CRASSOSTREA ANGULATA?
• 5.1. Materials and methods
• 5.2. Location of experiment
• 5.3. Family production and rearing
• 5.4. Grow-out testing environments and harvest measurement
• 5.5. Characteristics of the data
• 5.6. Effects of culture system (“single” vs. “cultch”) and environment (Catba vs.
• 5.7. Strain additive genetic effect
• 6. CHƯƠNG 6: FINAL STATEMENT
• 6.1. Reproductive neuropeptides of S.
• 6.2. Genetic loss in mass selected S.
• 6.3. Genetic integrity and diversity of aquaculture oyster in Vietnam
• 6.4. Evaluate strain genetic effect and heterosis
• Lists of Figures

I. Giới thiệu

Luận án tiến sĩ 'Nghiên cứu di truyền và sinh sản hàu' của tác giả Vu Van In tập trung vào các yếu tố di truyền và sinh lý liên quan đến sinh sản của hai loài hàu quan trọng: hàu Thái Bình Dương (Crassostrea gigas) và hàu Sydney (Saccostrea glomerata). Nghiên cứu này nhằm phát triển các công cụ di truyền, phân tử và sinh lý cần thiết cho việc quản lý chương trình di truyền trong nuôi trồng thủy sản. Tác giả nhấn mạnh rằng việc kiểm soát quá trình sinh sản là điều kiện tiên quyết để duy trì sự đa dạng di truyền và cải thiện các đặc tính của loài hàu. Các chương của luận án được chia thành bốn phần chính, mỗi phần tập trung vào một khía cạnh khác nhau của sinh sản và di truyền.

1.1. Mục tiêu nghiên cứu

Mục tiêu chính của nghiên cứu là xác định các gen và hormone peptide liên quan đến hiệu suất sinh sản của hàu Sydney. Nghiên cứu cũng nhằm phân tích sự đa dạng di truyền của các dòng hàu đã được chọn lọc và xác định danh tính loài hàu nuôi trồng tại Việt Nam. Từ đó, nghiên cứu sẽ cung cấp thông tin cần thiết để thiết lập các chương trình sinh sản bền vững và có thể tái tạo được.

II. Các phương pháp nghiên cứu

Luận án sử dụng nhiều phương pháp nghiên cứu khác nhau, bao gồm phân tích gen, sinh học phân tử và sinh lý học. Các phương pháp này cho phép tác giả xác định các peptide sinh sản có khả năng kích thích quá trình sinh sản ở hàu Sydney. Đặc biệt, nghiên cứu đã phát hiện ra khoảng 28 gen neuropeptide có liên quan đến sự phát triển của gonad và quá trình sinh sản. Các peptide này đã được thử nghiệm để xác định khả năng kích thích sinh sản, với một số peptide cho thấy khả năng thúc đẩy sự trưởng thành của gonad.

2.1. Phân tích gen và peptide

Phân tích gen và peptide được thực hiện thông qua các kỹ thuật như transcriptomics và peptidomics. Nghiên cứu đã xác định được các peptide sinh học có khả năng ảnh hưởng đến chu kỳ sinh sản của hàu, từ đó mở ra hướng nghiên cứu mới trong lĩnh vực sinh học thần kinh của hàu. Việc hiểu rõ hơn về các peptide này có thể giúp cải thiện quy trình nuôi trồng và sản xuất hàu.

III. Kết quả và thảo luận

Kết quả nghiên cứu cho thấy rằng sự đa dạng di truyền của hàu Sydney đã được duy trì qua nhiều thế hệ chọn lọc, mặc dù có sự mất mát trong từng dòng chọn lọc. Nghiên cứu cũng chỉ ra rằng việc duy trì nhiều dòng chọn lọc độc lập có thể giúp bảo tồn sự đa dạng di truyền. Điều này có ý nghĩa quan trọng trong việc phát triển các chương trình di truyền bền vững cho nuôi trồng thủy sản.

3.1. Đánh giá sự đa dạng di truyền

Nghiên cứu đã chỉ ra rằng mặc dù có sự mất mát về đa dạng di truyền trong từng dòng chọn lọc, nhưng khi xem xét tổng thể, các dòng khác nhau vẫn duy trì được mức độ đa dạng không khác biệt so với mẫu tự nhiên. Điều này cho thấy rằng các chương trình chọn lọc có thể được thiết kế để bảo tồn sự đa dạng di truyền, từ đó nâng cao hiệu quả sản xuất.

IV. Ứng dụng thực tiễn

Luận án không chỉ cung cấp kiến thức khoa học mà còn có giá trị thực tiễn cao trong ngành nuôi trồng thủy sản. Các kết quả nghiên cứu có thể được áp dụng để phát triển các chương trình sinh sản bền vững cho hàu, từ đó nâng cao năng suất và chất lượng sản phẩm. Việc hiểu rõ về di truyền và sinh sản của hàu sẽ giúp các nhà nghiên cứu và người nuôi trồng có thể đưa ra các quyết định hợp lý trong việc quản lý nguồn lợi thủy sản.

4.1. Tương lai của nghiên cứu

Nghiên cứu mở ra nhiều hướng đi mới cho các nghiên cứu tiếp theo trong lĩnh vực di truyền và sinh sản của hàu. Việc áp dụng các công nghệ sinh học hiện đại có thể giúp cải thiện quy trình chọn giống và sản xuất hàu, đồng thời bảo tồn sự đa dạng di truyền của các loài hàu nuôi trồng. Điều này không chỉ có lợi cho ngành nuôi trồng thủy sản mà còn góp phần bảo vệ môi trường sống tự nhiên của các loài hàu.