Khảo sát đột biến gen ở bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ bằng giải trình tự gen thế hệ mới

LỜI CAM ĐOAN

1. CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN

1.1. TỔNG QUAN VỀ UNG THƯ PHỔI KHÔNG TẾ BÀO NHỎ

1.2. Yếu tố nguy cơ

1.3. Tính nhạy cảm di truyền

1.4. Tuổi

1.5. Giới tính

1.6. Lâm sàng

1.7. Cận lâm sàng

1.8. Giải phẫu bệnh

1.9. Các giai đoạn UTPKTBN

1.10. Điều trị

2. CHƯƠNG 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU

2.1. Thiết kế nghiên cứu

2.2. Đối tượng nghiên cứu

2.3. Thời gian và địa điểm nghiên cứu

2.4. Cỡ mẫu nghiên cứu

2.5. Xác định các biến số nghiên cứu

2.6. Phương pháp, công cụ đo lường, thu thập số liệu

2.7. Quy trình nghiên cứu

2.8. Phương pháp phân tích dữ liệu

2.9. Đạo đức trong nghiên cứu

3. CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

3.1. Một số đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng ở bệnh nhân UTPKTBN

3.2. Xác định tỉ lệ các đột biến gen (EGFR, ALK, ROS1, BRAF, KRAS, NRAS) bằng phương pháp NGS mô u và mối liên quan giữa các đột biến gen với một số đặc điểm lâm sàng của bệnh nhân

3.3. So sánh sự tương đồng trong phát hiện đột biến gen EGFR giữa NGS mô u với ddPCR và EGFR Cobas V2

3.4. So sánh sự tương đồng trong phát hiện các đột biến gen giữa NGS sinh thiết lỏng với NGS mô u, ddPCR và EGFR Cobas V2

4. CHƯƠNG 4: BÀN LUẬN

4.1. Một số đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng ở bệnh nhân UTPKTBN

4.2. Xác định tỉ lệ các đột biến gen (EGFR, ALK, ROS1, BRAF, KRAS, NRAS) bằng phương pháp NGS mô u và mối liên quan giữa các đột biến gen với một số đặc điểm lâm sàng của bệnh nhân

4.3. So sánh sự tương đồng trong phát hiện đột biến gen EGFR giữa NGS mô u với ddPCR và EGFR Cobas V2

4.4. So sánh sự tương đồng trong phát hiện các đột biến gen giữa NGS sinh thiết lỏng với NGS mô u, ddPCR và EGFR Cobas V2

DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH CÔNG BỐ KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI LUẬN ÁN

TÀI LIỆU THAM KHẢO

PHỤ LỤC

I. Tổng quan về ung thư phổi không tế bào nhỏ

Ung thư phổi không tế bào nhỏ (UTPKTBN) chiếm 85% các trường hợp ung thư phổi. Yếu tố nguy cơ chính bao gồm hút thuốc lá, tiếp xúc với các tác nhân sinh khối u từ môi trường, và tính nhạy cảm di truyền. Đột biến gen đóng vai trò quan trọng trong cơ chế bệnh sinh của UTPKTBN, ảnh hưởng đến sự phát triển khối u và khả năng đáp ứng điều trị. Các triệu chứng lâm sàng thường gặp bao gồm ho, ho ra máu, và khó thở. Chẩn đoán hình ảnh và sinh thiết mô là các phương pháp chính để xác định bệnh.

1.1. Yếu tố nguy cơ

Hút thuốc lá là yếu tố nguy cơ chính, với nicotine thúc đẩy sự tăng sinh tế bào và ức chế quá trình chết tế bào theo chương trình. Tiếp xúc với amiăng, phóng xạ radon, và ô nhiễm không khí cũng làm tăng nguy cơ. Các bệnh phổi mãn tính như bệnh phổi tắc nghẽn mạn tính và lao phổi cũng liên quan đến UTPKTBN.

1.2. Cơ chế bệnh sinh

Các đột biến gen như khuếch đại gen gây ung thư và bất hoạt gen ức chế khối u là nguyên nhân chính dẫn đến sự phát triển của UTPKTBN. Những đột biến này làm tế bào ung thư thoát khỏi sự kiểm soát của cơ thể, dẫn đến sự tăng sinh không kiểm soát.

II. Phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới

Giải trình tự gen thế hệ mới (NGS) là công nghệ tiên tiến cho phép xác định đồng thời nhiều đột biến gen trên các mẫu sinh thiết mô và sinh thiết lỏng. So với phương pháp giải trình tự Sanger, NGS có độ nhạy cao hơn, chi phí hợp lý, và khả năng phát hiện các alen đột biến ở tần số thấp. NGS đã được ứng dụng rộng rãi trong nghiên cứu và chẩn đoán ung thư phổi, đặc biệt là UTPKTBN.

2.1. Ưu điểm của NGS

NGS cho phép phân tích đồng thời nhiều gen mục tiêu, giúp tiết kiệm thời gian và chi phí. Độ nhạy cao của NGS giúp phát hiện các đột biến gen ở mức độ thấp, điều mà các phương pháp truyền thống khó có thể đạt được.

2.2. Ứng dụng trong UTPKTBN

NGS được sử dụng để xác định các đột biến gen như EGFR, ALK, ROS1, KRAS, NRAS, và BRAF trong bệnh nhân ung thư phổi. Kết quả từ NGS giúp lựa chọn liệu pháp điều trị đích phù hợp, cải thiện hiệu quả điều trị và tiên lượng bệnh.

III. Kết quả nghiên cứu đột biến gen ở bệnh nhân UTPKTBN

Nghiên cứu đã xác định tỷ lệ đột biến gen EGFR, ALK, ROS1, KRAS, NRAS, và BRAF ở bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ bằng phương pháp NGS. Kết quả cho thấy sự khác biệt về tỷ lệ đột biến giữa các nhóm bệnh nhân dựa trên giới tính, tuổi, và tiền sử hút thuốc lá. Ngoài ra, nghiên cứu cũng so sánh độ chính xác của NGS với các phương pháp truyền thống như ddPCR và EGFR Cobas V2.

3.1. Tỷ lệ đột biến gen

Tỷ lệ đột biến gen EGFR là cao nhất, tiếp theo là KRAS và ALK. Các đột biến này có mối liên quan chặt chẽ với đặc điểm lâm sàng của bệnh nhân, bao gồm giới tính, tuổi, và tiền sử hút thuốc lá.

3.2. So sánh phương pháp NGS với ddPCR và EGFR Cobas V2

NGS cho thấy độ chính xác cao hơn trong việc phát hiện các đột biến gen so với ddPCR và EGFR Cobas V2. Đặc biệt, NGS có khả năng phát hiện đồng thời nhiều đột biến trên cùng một mẫu, giúp tiết kiệm thời gian và chi phí.

IV. Ứng dụng thực tiễn và ý nghĩa nghiên cứu

Nghiên cứu này cung cấp cái nhìn toàn diện về tỷ lệ và mối liên quan của các đột biến gen trong bệnh nhân ung thư phổi không tế bào nhỏ. Kết quả nghiên cứu có ý nghĩa quan trọng trong việc lựa chọn liệu pháp điều trị đích phù hợp, cải thiện hiệu quả điều trị và tiên lượng bệnh. Ngoài ra, việc ứng dụng giải trình tự gen thế hệ mới trong chẩn đoán và điều trị UTPKTBN mở ra hướng nghiên cứu mới trong lĩnh vực ung thư phổi.

4.1. Ý nghĩa lâm sàng

Kết quả nghiên cứu giúp xác định các đột biến gen có giá trị tiên lượng và dự đoán đáp ứng điều trị. Điều này giúp bác sĩ lựa chọn liệu pháp điều trị đích phù hợp, cải thiện chất lượng sống và thời gian sống còn của bệnh nhân.

4.2. Hướng nghiên cứu tương lai

Nghiên cứu mở ra hướng ứng dụng giải trình tự gen thế hệ mới trong chẩn đoán và điều trị các loại ung thư khác. Việc phát triển các công nghệ mới trong phân tích gen sẽ tiếp tục đóng vai trò quan trọng trong y học cá thể hóa.

Nghiên cứu đột biến gen trong ung thư phổi không tế bào nhỏ bằng phương pháp giải trình tự gen thế hệ mới