Luận văn thạc sĩ về đánh giá đa dạng di truyền loài xá xị Cinnamomum parthenoxylon tại miền Bắc

• Tác giả: Nguyễn Xuân Vĩnh
• Người hướng dẫn: TS. Hà Bích Hồng
• Trường học: Đại học Lâm nghiệp
• Chuyên ngành: Công nghệ sinh học
• Đề tài: Đánh giá đa dạng di truyền loài xá xị Cinnamomum parthenoxylon tại miền Bắc Việt Nam
• Loại tài liệu: luận văn thạc sĩ
• Năm xuất bản: 2023
• Địa điểm: Hà Nội

• LỜI CAM ĐOAN
• LỜI CẢM ƠN
• 1. CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU
• 1.1. Đặc điểm sinh học loài Xá Xi
• 1.2. Tổng quan về ADN mã vạch (ADN barcodes)
• 1.2.1. Giới thiệu về ADN mã vạch
• 1.2.2. Giới thiệu về chỉ thị trnH-psbA và ứng dụng của chỉ thị trnH-psbA
• 1.2.3. Nghiên cứu về đa dạng di truyền của các loài thuộc chi Cinnamomum
• 2. CHƯƠNG 2: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 2.1. Lựa chọn mẫu và cách lấy mẫu. Địa điểm thực hiện nghiên cứu. Hóa chất và các thiết bị sử dụng trong nghiên cứu
• 2.2. Thiết bị sử dụng trong nghiên cứu
• 2.3. Phương pháp nghiên cứu trong phòng thí nghiệm của Viện Công nghệ Sinh học Lâm nghiệp
• 2.3.1. Phương pháp tách chiết ADN tổng số
• 2.3.2. Phương pháp định lượng ADN tổng số
• 2.3.3. Phương pháp PCR với cặp mồi đặc hiệu
• 2.3.4. Phương pháp điện di ADN trên gel agarose
• 2.3.5. Phương pháp tinh sạch sản phẩm PCR
• 2.3.6. Phương pháp xác định trình tự nucleotide của đoạn gen ADN mã vạch
• 2.3.7. Phương pháp xử lý số liệu
• 3. CHƯƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• 3.1. Tách chiết ADN tổng số
• 3.2. Nhân bản đoạn trình tự ADN mã vạch trnH-psbA của loài Xá xi
• 3.3. Xác định trình tự nucleotide các đoạn ADN mã vạch của loài Xá xi
• 3.4. Phân tích trình tự nucleotide của đoạn ADN mã vạch trnH-psbA của 54 mẫu Xá xi phục vụ đánh giá đa dạng di truyền
• KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ
• DANH MỤC CÔNG TRÌNH CỦA TÁC GIẢ ĐÃ CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN VĂN
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC

I. Giới thiệu về loài xá xị Cinnamomum parthenoxylon

Loài xá xị, có tên khoa học là Cinnamomum parthenoxylon, thuộc họ Long não (Lauraceae). Loài cây này được biết đến với nhiều đặc điểm sinh học độc đáo và giá trị kinh tế cao. Cây xá xị có thể cao từ 20 đến 25 mét, với đường kính thân từ 40 đến 70 cm. Vỏ cây có màu nâu, thường nứt dọc và bong ra từng mảng. Lá cây có hình dạng trứng hoặc bầu dục, với gân bên 3-8 đôi. Hoa của cây xá xị lưỡng tính, có màu trắng vàng và thường mọc thành cụm. Quả của cây có hình mong, có đường kính khoảng 0,6 cm. Cây xá xị thường phân bố trong rừng mưa nhiệt đới, ưa sống ở độ cao từ 300 đến 900 mét và trên đất có độ phì cao. Đặc biệt, cây này có nhiều ứng dụng trong công nghiệp chế biến gỗ và sản xuất tinh dầu, do đó có giá trị thương mại cao trên thị trường quốc tế.

II. Đánh giá đa dạng di truyền của loài xá xị

Đánh giá đa dạng di truyền của loài xá xị là một phần quan trọng trong nghiên cứu nhằm bảo tồn nguồn gen. Sử dụng ADN mã vạch, đặc biệt là chỉ thị trnH-psbA, giúp xác định sự khác biệt di truyền giữa các cá thể trong quần thể. Nghiên cứu cho thấy rằng trình tự trnH-psbA có khả năng phân biệt cao giữa các loài thực vật, với tỷ lệ thành công đạt 84% trong việc xác định loài thuộc họ Long não. Điều này cho thấy rằng việc sử dụng ADN mã vạch không chỉ giúp phân loại chính xác các loài mà còn hỗ trợ trong việc bảo tồn đa dạng sinh học. Nghiên cứu này cũng góp phần xây dựng cơ sở dữ liệu ADN mã vạch cho các loài thực vật tại Việt Nam, phục vụ cho công tác bảo tồn và phát triển bền vững.

III. Phương pháp nghiên cứu

Nghiên cứu được thực hiện thông qua các phương pháp tách chiết ADN, nhân bản đoạn ADN mã vạch trnH-psbA, và phân tích trình tự nucleotide. Việc tách chiết ADN từ 54 mẫu xá xị được thực hiện theo quy trình tiêu chuẩn, đảm bảo độ tinh khiết và chất lượng của mẫu. Sau đó, phản ứng PCR được thực hiện để nhân bản đoạn ADN mã vạch, với các cặp mồi được thiết kế đặc hiệu. Cuối cùng, trình tự nucleotide của đoạn ADN mã vạch được giải trình tự và phân tích để đánh giá mức độ đa dạng di truyền. Kết quả cho thấy sự khác biệt di truyền giữa các mẫu từ các tỉnh miền Bắc Việt Nam, từ đó xác định được các haplotype khác nhau.

IV. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn

Kết quả nghiên cứu không chỉ có giá trị trong việc bổ sung dữ liệu di truyền cho danh mục các loài thực vật ở Việt Nam mà còn có ý nghĩa lớn trong công tác bảo tồn. Việc đánh giá đa dạng di truyền của loài xá xị giúp xác định được các quần thể có giá trị cao, từ đó có thể xây dựng các chương trình bảo tồn hiệu quả. Hơn nữa, nghiên cứu này cũng mở ra hướng đi mới trong việc ứng dụng công nghệ ADN mã vạch vào các nghiên cứu sinh học khác, thúc đẩy việc bảo tồn và phát triển bền vững các loài thực vật quý hiếm tại Việt Nam.