Luận Án Tiến Sĩ: Phân Tích Mô Hình và Ký Hiệu Mạng Tín Hiệu Protein Sinh Học Sử Dụng Automata Lai

Trường đại học

Stanford University

Người đăng

Ẩn danh

Thể loại

dissertation

2005

152
0
0

Phí lưu trữ

30.000 VNĐ

Mục lục chi tiết

Abstract

Acknowledgments

1. CHƯƠNG 1: INTRODUCTION

1.2. Glossary of Biological Terms

2. CHƯƠNG 2: PROTEIN SIGNALING

2.2. Lateral Inhibition Through Delta-Notch Signaling

2.3. Planar Cell Polarity Signaling

2.4. Motivation for Hybrid Model

3. CHƯƠNG 3: HYBRID AUTOMATA

3.1. Hybrid Automata and Transition Systems

4. CHƯƠNG 4: DELTA-NOTCH SIGNALING

4.1. Delta-Notch Lateral Inhibition

4.2. Previous Work: Mathematical Models

4.3. Hybrid Automaton with Piecewise Linear Switch

4.4. Equilibrium Analysis and Constraint Generation

4.5. Simulation Results for a Planar Array of Cells

4.6. Hybrid Automaton with Signum Switch

4.7. Equilibrium Analysis and Constraint Generation

4.8. Simulation Results for 1 and 2 Dimensional Networks of Cells

4.9. Comparison with Nonlinear ODE Model

4.10. Reachability: Mathematical Definitions

4.11. Reachable Set Computation Results

4.11.1. One Cell Delta-Notch Automaton

4.11.2. Two Cell Delta-Notch Automaton

4.11.3. Four Cell Delta-Notch Automaton

4.12. Query-Based Interpretation

4.12.1. Structure of Computed Reachable Sets

4.12.2. Example: Four Cell Delta-Notch Automaton

4.12.3. Query Based Interpretation Algorithm

4.12.4. Query Results for Four Cell Delta-Notch Automaton

4.13. Proposed Biological Experiments

5. CHƯƠNG 5: PLANAR CELL POLARITY SIGNALING

5.1. Hybrid Automaton Model Development

5.2. Equilibrium Analysis and Parameter Constraints

5.3. Simulation Results and Experimental Validation

6. CHƯƠNG 6: INTEGRATION WITH BIO-SPICE SYSTEMS BIOLOGY SOFTWARE PLATFORM

6.1. Lactose Metabolism within a Bacterial Cell

6.1.1. Hybrid Model Development and Simplification

6.1.2. Reachability Analysis Results

6.2. Future Work

A Definition of Lactose Metabolism Hybrid Model

Bibliography

List of Tables

List of Figures

Phân Tích Mô Hình và Ký Hiệu Mạng Tín Hiệu Protein Sinh Học Bằng Automata Lai là một nghiên cứu chuyên sâu về việc ứng dụng automata lai để phân tích và mô hình hóa các mạng tín hiệu protein trong sinh học. Tài liệu này cung cấp một phương pháp tiếp cận mới, giúp hiểu rõ hơn về cách các tín hiệu protein tương tác và điều khiển các quá trình sinh học phức tạp. Điều này không chỉ hỗ trợ nghiên cứu cơ bản mà còn mở ra tiềm năng ứng dụng trong y học và công nghệ sinh học.

Để mở rộng kiến thức về các phương pháp phân tích tín hiệu, bạn có thể tham khảo Luận văn thạc sĩ nhận dạng hoạt động gõ tay thông qua phân tích tín hiệu quang phổ cận hồng ngoại, nơi các kỹ thuật phân tích tín hiệu được áp dụng trong một bối cảnh khác. Ngoài ra, Luận án tiến sĩ về phương pháp tính toán thiết kế bộ lọc thụ động tần số cao cung cấp cái nhìn sâu hơn về các phương pháp tính toán hiệu quả trong xử lý tín hiệu. Cuối cùng, Luận văn thạc sĩ tìm hiểu ảnh hưởng của biên độ và góc pha tần số lên phổ tần là một tài liệu hữu ích để hiểu rõ hơn về các yếu tố ảnh hưởng đến tín hiệu.

Mỗi liên kết trên là cơ hội để bạn khám phá sâu hơn về các phương pháp phân tích và ứng dụng tín hiệu trong các lĩnh vực khác nhau.