ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP.HCM TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN BÙI ANH THY LAM VAC-XIN LUẬN ÁN TIEN SĨ SINH HOC TP. Hồ Chí Minh - Năm 2024 ĐẠI HỌC QUOC GIA TP.HCM TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN NGHIÊN CỨU TẠO VA PHAN TÍCH BIEN DOI DI TRUYEN CHUNG VI-RÚT PRRS NHƯỢC ĐỘC LAM VAC-XIN Ngành: Di truyền học Mã số ngành: 62420121 Phản biện 1: PGS. DO TIỀN DUY Phan bién 2: PGS. NGO TH] HOA Phan bién 3: TS.
NGUYEN THANH LAM Phan biện độc lập 1: TS. ĐOÀN THỊ THANH HƯƠNG Phản biện độc lập 2: TS. ĐÀO HUY MẠNH NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC 1. TRAN LINH THƯỚC 2.
TRAN XUAN HANH TP. Hé Chi Minh — Nam 2024 LỜI CAM ĐOAN Tôi cam đoan luận án tiến sĩ ngành Di truyền học, với đề tài Nghiên cứu tạo và phân tích biến đối di truyền chúng vi-rút PRRS nhược độc làm vắc-xin là công trình khoa học do Tôi thực hiện dưới sự hướng dẫn của GS. Trần Linh Thước và TS. Trần Xuân Hạnh.
Những kết quả nghiên cứu của luận án hoàn toàn trung thực, chính xác và không trùng lắp với các công trình đã công bố trong và ngoài nước. Nghiên cứu sinh Bùi Anh Thy LỜI CẢM ƠN Con xin thành kính biết ơn công lao sinh thành dưỡng dục của Bố Mẹ. Bố Mẹ là nguồn động lực giúp con vượt qua những khó khăn, thử thách trong cuộc đời. Để hoàn thành luận án, ngoài sự có gắng của bản thân, tôi đã nhận được sự giúp đỡ tận tình, hỗ trợ của nhiều cá nhân và tập thé trong suốt quá trình nghiên cứu, học tập.
Tôi xin thành kính ghi ơn GS. Trần Linh Thước và TS. Trần Xuân Hạnh đã động viên, tận tình hướng dẫn và giúp đỡ tôi trong suốt quá trình công tác, học tập, thực hiện và hoàn thành luận án này. Tôi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc đến Ban Lãnh đạo đơn vị, Ban Lãnh dao Cong ty Cổ phan Thuốc thú y Trung ương NAVETCO đã đồng ý và tạo điều kiện về thời gian, cơ sở vật chất dé tôi được học tập, nghiên cứu thực hiện luận án này.
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành đến GS. Lê Thanh Hòa và các anh chị em tại Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam đã đồng hành, giúp đỡ tôi nghiên cứu thực hiện đề tài này. Tôi xin chân thành cảm ơn Ban giám hiệu Trường Đại học Khoa học tự nhiên Thanh phố Hồ Chí Minh, Đại học Quốc gia - Hồ Chí Minh, quý Thay Cô giáo Bộ môn Di truyền học, Khoa Sinh học, và Phòng đào tạo sau đại học đã giảng đạy, truyền đạt kinh nghiệm, kiến thức và tạo điều kiện thuận lợi cũng như những hỗ trợ khác đề tôi hoàn thành khóa học. Tôi xin chân thành cảm ơn các anh chị em trong Bộ môn Hóa Sinh (Sinh học phân tử), đơn vị đã đồng hành, động viên và giúp đỡ tôi trong suốt quá trình học tập, nghiên cứu và thực hiện đề tài.
Tôi xin chân thành cảm ơn TS. Morrissy thuộc Phòng thí nghiệm Australian Animal Health Laboratory — CSIRO, đã cung cấp tế bảo trong nghiên cứu này. Tôi xin gửi lời cảm ơn và lời yêu thương sâu sắc đến gia đình đã luôn ủng hộ, động viên tôi trong công tác, học tập và hoàn thành luận án. TRANG PHU BIA LOI CAM DOAN.
LOI CAM ON. " DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT DANH MỤC HÌNH ẢNH DANH MỤC BẢNG BIÊU MỞ ĐÀU. TÔNG QUAN TÀI LIỆU.1 Hội chứng rồi loạn sinh sản và hô hap ở heo (PRRS) 1.12 Một số đặc điêm dịch tê học của bệnh PRRS trên thê giới. Một số đặc điểm dịch té học của bệnh PRRS tại Việt Nam 1.4 Triệu chứng lâm sàng và bệnh tích 1.
Phòng ngừa và điều trị bệnh.2 Vi-rút gây bệnh PRRS (PRRSV). Đặc điểm hình thái 1. Cấu trúc hệ gen PRRSV. Đặc điểm và chức năng các protein phi câu trúc (NSP) ở PRRSV.
Đặc điểm và chức năng các protein cấu trúc của PRRSV 1.6 Đa dạng di truyền ở các protein của PRRSV 1. Đặc điểm nuôi cấy v 1.8 Quá trình xâm nhập, nhân lên trong tê bào chủ 1.9 Nghiên cứu về biến đổi di truyền của PRRSV trong và ngoài nước.3 Vắc-xin phòng bệnh PRRS.1 Các dạng vắc-xin phòng bệnh PRRS 1. Các loại vắc-xin phòng bệnh PRRS sử dụng tại Việt Nam iv 1. Các tiêu chi đánh giá vắc-xin.
Các nghiên cứu liên quan đến vắc-xin PRRS tại Việt Nam.4 Co sở khoa học và thực tiễn các vấn dé được nghiên cứu của luận án.1 Sự can thiết và cơ sở khoa học của nghiên cứu đặc tính sinh học của chủng gốc PRRSV BG8 nhằm tạo chủng nhược độc làm vắc-xin phòng bệnh PRRS tại Việt Nam 142 Sự cân thiết và cơ sở khoa học của nghỉ cứu phân tích bi truyền ở chúng PRRSV nhược độc. 143 Sự cân thiết và cơ sở khoa học của nghiên cứu phân tích tính ôn định kháng nguyên của chủng nhược độc và độ tương đông với các chủng PRRSV khác dựa trên trình tự ORFS và protein GPS. Sự can thiết và cơ sở khoa học của nghiên cứu đánh gì ính an toàn, đặc tính sinh miễn dich của chúng nhược độc BG8-P95 theo tiêu chuẩn chủng giống lam vắc-xin phòng bệnh PRRS. NOI DUNG - VAT LIEU - PHƯƠNG PHÁP 52 2.1 Nội dung - So đồ thực hiện các nội dung nghiên cứu .2 Sơ đỗ thực hiện các nội dung nghiên cứu 52 2.2 Nguyên vật liệu, dụng cu, thiết.
Ching vi-rút, dòng tế bào, động vật thí nghiệm 54 2.2 Hóa chất và các sinh phẩm 55 2. Dụng cụ, thiết bị.3 Phương pháp.1 Hoạt hóa, nuôi cay và xác định mật độ tế bào MARC-145 57 2.2 Tiếp truyền PRRSV trên dòng tế bào MARC-145 58 2. Xác định hiệu giá PRRSV trên tế bào MARC-145 59 2. Xác định liều lượng vi-rút gây nhiễm trên tế bào.
Xây dựng đường cong sinh trưởng của vi-rút theo thời gian thu hoạch .6 Thu nhận bộ gen PRRSV. Nhân bản vùng gen ORFS và gửi giải trình tự.8 Thu nhận thư viện bộ gen và gửi giải trình tự toàn bộ gen PRRSV. Phương pháp tiếp nhận và đánh giá chất lượng chuỗi nucleotide sau khi giải trình tw.10 Phân tích kêt quả giải trình tự gen và xây dựng cây phả hệ.11 Xác định tốc độ đột biến trên chuối trình tự nucleotide/ amino aeid.12 Phương pháp chăm sóc và theo dõi heo thí nghiệm .13 Phương pháp đánh giá khả năng gây bệnh, độc lực vi-rút trên heo thí nghiệm .14 Điều chê vac-xin thử nghiệm 2.15 Kiểm tra độ thuần khiết của vắc-xin.16 Đánh giá tính an toàn và hiệu lực của văc-xin thử nghiệm trên heo thí nghiệm _.17 Đánh giá tính an toàn và đặc tính sinh miên dịch của văc-xin thử nghiệm trên đàn heo nuôi thực địa.18 Các phương pháp huyết thanh hoc.19 Kỹ thuật Realtime RT-PCR phát hiện PRRSV.20 Phương pháp mổ khám kiểm tra bệnh tích đại thể ở heo .21 Xử lý thong kê. KET QUA - ĐÁNH GIA BAN LUẬN.1 Khao sát đặc tinh sinh học của chủng gốc PRRSV BG8 nhăm tạo chủng nhược độc băng phương pháp tiêp truyền trên tê bào MARC-145 3.
Đặc trưng di truyền của chủng góc PRRSV BG8. Đặc điển nhân lên của chủng PRRSV BG8 trên tế bào MARC-145. Hiệu giá vi-rút qua các đời tiếp truyền ching PRRSV BG8. Đánh giá độc lực của các chủng vi-rút qua các đời nuôi tiếp truyền.
Khả năng gây đáp ứng miễn dịch sinh kháng thé của chủng PRRSV nhược độc = ) 3.2 Phân tích biên đôi di truyên ở chủng PRRSV qua các đời nuôi tiêp truyền. Thu nhận thư viện bộ gen và giải trình tự toàn bộ gen các chủng PRRSV qua quá trình nuôi tiếp truyền 93 vi 3.2 Biến đổi nucleotide và amino acid trên toàn bộ gen của chủng PRRSV BG8 qua quá trình tiếp truyén .3 Tốc độ đột biến nucleotide va amino acid của chủng BG8-P95 so với chủng gốc BG8-PI.4 Phân tích so sánh đặc diém đột biên amino aci ở 9 cặp chủng PRRSV cường độc/ nhược độc và xác định đột biến lên quan đến tính nhược độc .3 Phan tich tinh ồn định protein kháng nguyên GP5 của chủng nhược độc BG8- P95 và độ tương đông với các chủng PRRSV khác dựa trên trình tự ORFS và GPS sss LAT 3.1 Thu nhận ORFS và giải trình tự ving gen ORFS mã hóa glycoprotein kháng nguyên GP5 của chủng PRRSV BG8 qua các đời tiếp truyền 3. Đặc trưng di truyền của chủng nhược độc qua tiếp truyền 3. Đột biến nucleotide trên ORFS va amino acid trên GPS trong quá trình nuôi tiếp truyền 5 „121 3.
Độ tương dong về trình tự ORFS va GPS giữa các đời tiếp truyền chủng BG8-P95 với các chủng PRRSV thực địa và các chủng PRRSV vắc-xin tại Việt Nam Fores oa „126 3. Đặc điểm biến đổi dau C của GPS ở chủng nhược độc BG8-P95.4 Đánh giá tính an toàn và đặc tính sinh miễn dịch của chủng nhược độc BG8- P95 theo tiêu chuân chủng giông làm vắc-xin 3. Kiém tra cảm quan vắc-xin 3. Độ thuần khiết của chủng nhược độc BG8-P95 làm v 3.3 Tính an toàn của vắc-xin chủng nhược độc BG8-P95 trên heo thí nghiệm 3.
Đáp ứng mic dịch sinh kháng th xin khác nhau. Xác định hiệu giá kháng thê theo thời gian sau khi 3.6 Đánh giá khả năng phòng bệnh của vắc-xin bằng công cường độc với chủng PRRSV độc lực cao trong điều kiện thí nghiệm vii 3. Đánh giá độ an toàn của vắc-xin nhược độc từ chủng BG8-P95 trên đàn heo nuôi thực địa .8 Hiệu quả phòng bệnh của vắc-xin PRRS chủng BG8-P95 trên thực địa 149 3.1 Về đặc tinh sinh học của ching góc PRRSV BG8 n tạo chủng nhược độc bằng phương pháp tiếp truyền trên tế bào MARC-14.2 Về các đặc điểm biến đổi di truyền trên toàn bộ gen ở các chủng PRRSV thu hoạch từ quá trình nuôi tiếp truyé 153 3. VỀ tinh ổn định kháng nguyên của chủng nhược độc BG8-P95 và độ tương dong với các chủng PRRSV khác dựa trên trình tự ORFS và GPŠ.
VỀ tính an toàn, đặc tính sinh miễn dịch của chủng nhược độc BG8-P95 theo tiêu chuẩn chủng giống làm vắc-xin phòng bệnh PRRS. KET LUẬN - DE NGHỊ 4. a DANH MUC CONG TRINH CUA LUAN AN TAI LIEU THAM KHAO PHU LUC. DANH MUC CHU VIET TAT Viết tắt Tiéng Anh Tiếng Việt aa Amino acid Axit amin AAHL Australian Animal Health Phòng thí nghiệm sức khỏe Laboratory động vật quốc gia Úc AEC 3- amino-9-ethylcarbazole Base pair Cặp base CPE Cytopathic effect Bệnh tích/ bệnh lý tế bào DNA Deoxyribonucleic acid dNTP Deoxyribonucleotide triphosphate dpe Day post challenge Ngày sau công cường độc dpi Day post inoculation Ngày sau gây nhiễm Day post vaccination Ngày sau tiêm phòng vắc-xin ELISA Enzyme linked immunosorbent Phản ứng miễn dịch hấp phụ assay nối kết enzyme etal.