Khảo Sát Tính Chất Methyl Hóa Bất Thường Trên Gen BRCA1 Và P16INK4A Trong Ung Thư Vú

• Tác giả: Nguyễn Thị Hoàng Trinh
• Người hướng dẫn: PGS.TS Lê Huyền Ái Thúy
• Trường học: Trường Đại Học Mở Thành Phố Hồ Chí Minh
• Chuyên ngành: Công Nghệ Sinh Học Y Dược
• Đề tài: Khảo Sát Tính Chất Methyl Hóa Gen BRCA1 và P16INK4A Trong Ung Thư Vú Tại Việt Nam
• Loại tài liệu: khóa luận tốt nghiệp
• Năm xuất bản: 2019
• Địa điểm: Tp.Hồ Chí Minh

• LỜI CẢM ƠN
• 1. TỔNG QUAN NGHIÊN CỨU
• 1.1. Ung thư vú
• 1.2. Epigenetics
• 1.3. Sự methyl hóa DNA (DNA Methylation)
• 1.4. Đảo CpG
• 1.5. Dấu chứng sinh học (Biomarker)
• 1.6. Tổng quan gen
• 1.6.1. Gen BRCA1 (Breast cancer type 1)
• 1.6.2. Gen p16INK4a (Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A)
• 1.7. Tình hình nghiên cứu tính chất methyl hóa gen BRCA1 và p16INK4a trên bệnh ung thư vú
• 1.8. Phương pháp phân tích tổng hợp
• 2. VẬT LIỆU - PHƯƠNG PHÁP
• 2.1. Phương pháp nghiên cứu
• 3. KẾT QUẢ - THẢO LUẬN
• 3.1. Kết quả khai thác dữ liệu và phân tích tổng hợp về sự methyl hóa vượt mức vùng promoter
• 3.2. Kết quả phân tích tổng hợp
• 4. KHẢO SÁT TRÊN MÁY TÍNH
• 4.1. Dữ liệu vùng gen mục tiêu BRCA1 và p16INK4a
• 4.2. Khảo sát bộ mồi trong quy trình MSP
• 4.3. Tính chất methyl hóa vượt mức vùng promoter
• 5. Kết quả thực nghiệm khảo sát tính chất methyl hóa gen BRCA1 và gen p16INK4a trên mẫu bệnh phẩm ung thư vú
• 6. KẾT LUẬN - ĐỀ NGHỊ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC
• Phụ lục 1. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi BRCA1_F, BRCA1_R với trình tự promoter gen BRCA1 bằng phần mềm Annhyb
• Phụ lục 2. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi BRCA1_MF, BRCA1_MR với trình tự promoter gen BRCA1 bằng phần mềm Annhyb
• Phụ lục 3. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi BRCA1_UF, BRCA1_UR với trình tự promoter gen BRCA1 bằng phần mềm Annhyb
• Phụ lục 4. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi P16INK4A_F, P16INK4A_R với trình tự promoter gen P16INK4a bằng phần mềm Annhyb
• Phụ lục 5. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi P16INK4A_MF, P16INK4A_MR với trình tự promoter gen p16INK4a bằng phần mềm Annhyb
• Phụ lục 6. Kết quả phân tích sự bắt cặp của cặp mồi P16INK4A_UF, P16INK4A_UR với trình tự promoter gen p16INK4a bằng phần mềm Annhyb

I. Tổng Quan Về Tính Chất Methyl Hóa Gen BRCA1 và P16INK4A

Nghiên cứu về tính chất methyl hóa của gen BRCA1 và P16INK4A trong ung thư vú tại Việt Nam đang thu hút sự chú ý lớn. Gen BRCA1 có vai trò quan trọng trong việc sửa chữa DNA và kiểm soát chu kỳ tế bào. Trong khi đó, gen P16INK4A là một gen ức chế khối u, có liên quan đến sự phát triển của ung thư. Việc khảo sát tính chất methyl hóa của hai gen này có thể cung cấp thông tin quý giá cho việc chẩn đoán và điều trị ung thư vú.

1.1. Methyl Hóa Gen Là Gì

Methyl hóa gen là quá trình gắn nhóm methyl vào DNA, ảnh hưởng đến sự biểu hiện gen mà không thay đổi trình tự DNA. Quá trình này có thể dẫn đến sự bất hoạt của các gen ức chế khối u, góp phần vào sự phát triển của ung thư.

1.2. Vai Trò Của Gen BRCA1 Trong Ung Thư Vú

Gen BRCA1 đóng vai trò quan trọng trong việc sửa chữa DNA và ngăn ngừa sự phát triển của khối u. Sự methyl hóa bất thường trên gen này có thể làm tăng nguy cơ mắc ung thư vú.

II. Thách Thức Trong Nghiên Cứu Tính Chất Methyl Hóa

Mặc dù có nhiều nghiên cứu về tính chất methyl hóa gen BRCA1 và P16INK4A, nhưng vẫn còn nhiều thách thức trong việc xác định chính xác tần suất methyl hóa. Các yếu tố như sự đa dạng di truyền và môi trường có thể ảnh hưởng đến kết quả nghiên cứu. Cần có các phương pháp nghiên cứu chính xác và đáng tin cậy để thu thập dữ liệu.

2.1. Độ Chính Xác Của Các Phương Pháp Nghiên Cứu

Các phương pháp như MSP và Nested-MSP được sử dụng để xác định tính chất methyl hóa. Tuy nhiên, độ chính xác của các phương pháp này có thể bị ảnh hưởng bởi nhiều yếu tố, bao gồm chất lượng mẫu và quy trình phân tích.

2.2. Sự Đa Dạng Di Truyền Trong Quần Thể

Sự đa dạng di truyền trong quần thể người Việt Nam có thể dẫn đến sự khác biệt trong tần suất methyl hóa gen BRCA1 và P16INK4A. Điều này cần được xem xét khi phân tích dữ liệu.

III. Phương Pháp Nghiên Cứu Tính Chất Methyl Hóa

Nghiên cứu sử dụng phương pháp phân tích tổng hợp để xác định mối liên hệ giữa tính chất methyl hóa và ung thư vú. Phương pháp này cho phép tổng hợp dữ liệu từ nhiều nghiên cứu khác nhau, cung cấp cái nhìn tổng quan về tình hình methyl hóa gen trong quần thể.

3.1. Phân Tích Tổng Hợp Dữ Liệu

Phân tích tổng hợp giúp xác định mối liên hệ giữa methyl hóa gen và nguy cơ ung thư. Phương pháp này sử dụng các chỉ số như tỷ suất chênh (OR) để đánh giá sự tương quan.

3.2. Quy Trình MSP Trong Nghiên Cứu

Quy trình MSP (Methylation-specific PCR) được áp dụng để xác định tính chất methyl hóa trên gen BRCA1 và P16INK4A. Quy trình này bao gồm các bước chuẩn bị mẫu, phản ứng PCR và phân tích kết quả.

IV. Kết Quả Nghiên Cứu Tính Chất Methyl Hóa

Kết quả nghiên cứu cho thấy tần suất methyl hóa trên gen BRCA1 và P16INK4A có sự khác biệt rõ rệt giữa các mẫu bệnh phẩm. Những phát hiện này có thể giúp cải thiện khả năng chẩn đoán và điều trị ung thư vú tại Việt Nam.

4.1. Tần Suất Methyl Hóa Trên Gen BRCA1

Nghiên cứu cho thấy tần suất methyl hóa trên gen BRCA1 đạt khoảng 55% trong các mẫu ung thư vú. Điều này cho thấy gen này có thể là một dấu chứng sinh học tiềm năng trong chẩn đoán ung thư.

4.2. Tần Suất Methyl Hóa Trên Gen P16INK4A

Tần suất methyl hóa trên gen P16INK4A cũng được ghi nhận ở mức cao, khoảng 40%. Điều này cho thấy gen này có thể đóng vai trò quan trọng trong sự phát triển của ung thư vú.

V. Kết Luận Về Tính Chất Methyl Hóa Gen Trong Ung Thư Vú

Nghiên cứu về tính chất methyl hóa gen BRCA1 và P16INK4A cung cấp cái nhìn sâu sắc về cơ chế phát triển ung thư vú. Những phát hiện này có thể hỗ trợ trong việc phát triển các phương pháp chẩn đoán và điều trị hiệu quả hơn cho bệnh nhân ung thư vú tại Việt Nam.

5.1. Tương Lai Của Nghiên Cứu Methyl Hóa

Nghiên cứu về methyl hóa gen sẽ tiếp tục được mở rộng để tìm hiểu sâu hơn về cơ chế sinh ung và phát triển các phương pháp điều trị mới.

5.2. Ứng Dụng Thực Tiễn Trong Y Học

Kết quả nghiên cứu có thể được ứng dụng trong y học để phát triển các dấu chứng sinh học mới, giúp cải thiện khả năng chẩn đoán và tiên lượng cho bệnh nhân ung thư vú.