Đánh giá đa dạng di truyền hồ tiêu Piper nigrum L. bằng chỉ thị SCOT

LỜI CẢM ƠN

XÁC NHẬN VÀ CAM ĐOAN

TÓM TẮT

2. CHƯƠNG 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU

2.1. Giới thiệu chung về hồ tiêu

2.2. Đặc điểm thực vật

2.3. Giống tiêu ở Việt Nam

2.4. Một số khái niệm về đa dạng sinh học

2.5. Ý nghĩa của việc nghiên cứu và bảo vệ sự đa dạng di truyền

2.6. Một số nghiên cứu nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền cây hồ tiêu

2.7. Chỉ thị phân tử SCoT (Start Codon Targeted)

2.8. Một số nghiên cứu sử dụng chỉ thị phân tử SCoT

2.9. Chỉ thị phân tử SCAR (Sequence Characterized Amplified Region)

2.10. Một số nghiên cứu phát triển chỉ thị SCAR

2.11. Các kỹ thuật tách chiết DNA thực vật

2.12. Phương pháp tách chiết DNA

2.13. Các phương pháp định tính và định lượng DNA

2.14. Phản ứng PCR (Polymerase chain reaction)

2.15. Thành phần cơ bản của phản ứng PCR

2.16. Các phương pháp chủ yếu tạo cây phát sinh loài

3. CHƯƠNG 3: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP

3.1. Thời gian và địa điểm nghiên cứu

3.2. Vật liệu và phương pháp nghiên cứu

3.3. Hóa chất và dụng cụ, thiết bị thí nghiệm

3.4. Phương pháp nghiên cứu

3.5. Xác định điều kiện PCR - SCoT thích hợp khuếch đại DNA

3.6. Tiến hành thu nhận DNA từ gel agarose sau điện di

3.7. Chuẩn bị tế bào E. coli khả năng bằng phương pháp calcium chloride

3.8. Kết nối DNA mục tiêu vào vector (tạo sản phẩm nối)

3.9. Biến nạp plasmid tái tổ hợp vào tế bào khả năng

4. CHƯƠNG 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN

4.1. Tách chiết DNA tổng số

4.2. Kết quả khảo sát nhiệt độ bắt cặp

4.3. Đánh giá đa dạng di truyền các mẫu giống tiêu

4.4. Phân tích đa dạng di truyền

4.5. Phát triển chỉ thị SCAR

4.6. Biến nạp plasmid tái tổ hợp

5. CHƯƠNG 5: KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ

5.1. Kết luận

5.2. Kiến nghị

DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT

DANH SÁCH CÁC BẢNG

DANH SÁCH CÁC HÌNH

I. Giới thiệu về hồ tiêu Piper nigrum L

Cây hồ tiêu, có tên khoa học là Piper nigrum L., là một trong những cây công nghiệp quan trọng tại Việt Nam. Cây này có nguồn gốc từ Ấn Độ và đã được trồng rộng rãi ở nhiều quốc gia Đông Nam Á. Hồ tiêu không chỉ có giá trị kinh tế cao mà còn là một gia vị phổ biến trên toàn thế giới. Theo thống kê, Việt Nam hiện là quốc gia xuất khẩu hồ tiêu hàng đầu, đóng góp lớn vào nền kinh tế nông thôn. Việc nghiên cứu và bảo tồn đa dạng di truyền của hồ tiêu là rất cần thiết để duy trì nguồn gen và nâng cao năng suất cây trồng. Đặc điểm sinh học của cây hồ tiêu bao gồm khả năng sinh trưởng tốt trong điều kiện khí hậu nhiệt đới, yêu cầu độ ẩm cao và đất tơi xốp. Sự đa dạng di truyền của hồ tiêu không chỉ giúp cây thích ứng với điều kiện môi trường mà còn tăng cường khả năng chống chịu sâu bệnh.

II. Đánh giá đa dạng di truyền bằng chỉ thị SCOT

Nghiên cứu này sử dụng chỉ thị Start Codon Targeted (SCoT) để đánh giá đa dạng di truyền của các giống hồ tiêu. Phương pháp này cho phép khuếch đại DNA từ các mẫu giống hồ tiêu, từ đó phân tích sự tương đồng di truyền giữa các giống. Kết quả cho thấy, 10 chỉ thị SCoT đã thành công trong việc khuếch đại DNA từ 8 mẫu giống hồ tiêu, phân chia chúng thành 6 nhóm với hệ số tương đồng từ 0,48 đến 0,90. Đặc biệt, các chỉ thị SCoT - 3 và SCoT - 7 đã tạo ra các band đa hình, có khả năng phát triển thành chỉ thị SCAR để nhận diện riêng biệt các giống hồ tiêu như Vĩnh Linh và Phú Quốc. Điều này khẳng định hiệu quả của chỉ thị SCoT trong việc đánh giá đa dạng di truyền, vượt trội hơn so với các phương pháp dựa vào đặc điểm hình thái.

III. Phân tích di truyền và ứng dụng thực tiễn

Phân tích di truyền thông qua chỉ thị SCoT không chỉ giúp xác định sự đa dạng di truyền mà còn có ý nghĩa quan trọng trong việc bảo tồn và phát triển giống hồ tiêu. Việc phát triển các chỉ thị SCAR từ các band đa hình sẽ hỗ trợ trong việc nhận diện và phân loại các giống hồ tiêu, từ đó nâng cao hiệu quả sản xuất nông nghiệp. Nghiên cứu này cũng mở ra hướng đi mới cho các nghiên cứu tiếp theo về di truyền học cây trồng, đặc biệt là trong bối cảnh biến đổi khí hậu và nhu cầu ngày càng cao về sản phẩm nông nghiệp chất lượng. Sự bảo tồn đa dạng di truyền không chỉ giúp duy trì nguồn gen mà còn góp phần vào sự phát triển bền vững của ngành nông nghiệp.

Khóa luận tốt nghiệp: Đánh giá đa dạng di truyền của giống hồ tiêu Piper nigrum L. bằng chỉ thị SCOT