MỞ ĐẦU Sốt Dengue (SD), sốt xuất huyết Dengue (SXHD) và hội chứng sốc Dengue (HCSD) là bệnh do virus Dengue gây ra, bệnh lây lan từ người sang người, vector truyền bệnh là muỗi Aedes aegypti. Trong suốt nhiều thập kỷ qua, tỉ lệ mắc bệnh SD, SXHD và HCSD vẫn không ngừng tăng lên, hiện nay chưa có vắc xin phòng ngừa cũng như chưa có thuốc đặc trị.Theo Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) hiện tại có khoảng 3,9 tỷ người - chiếm khoảng hơn 40% dân số thế giới, ở các quốc gia có khí hậu nhiệt đới và cận nhiệt đới đang có nguy cơ mắc bệnh SXHD. Dengue là một trong những virus nguy hiểm nhất đe dọa đến hơn 1/3 dân số thế giới ở các vùng nhiệt đới và cận nhiệt đới. Theo WHO, có tới 390 triệu trường hợp mắc SD mỗi năm trên toàn thế giới và có khoảng 3.9 % người nhiễm dengue bị chết hằng năm.
Tại Việt Nam, riêng từ đầu năm 2017 đến 8/2017 đã có 80.555 trường hợp mắc SXH và trong đó có 22 trường hợp tử vong [21], [22]. Protein NS1 của virus Dengue là một glycoprotein có độ tương đồng và tính bảo thủ cao, tồn tại cả ở dạng liên kết màng (kể cả ở trong tế bào cũng như ở trên bề mặt của tế bào) và dạng tiết ra ngoại bào, xuất hiện trong huyết thanh bệnh nhân nhiễm virus Dengue giai đoạn sớm, có thể phát hiện trước khi hình thành các kháng thể Dengue IgM và IgG. Hiện nay việc chẩn đoán virus Dengue có nhiều phương pháp như: Làm các xét nghiệm cận lâm sàng; các xét nghiệm miễn dịch như phát hiện kháng nguyên NS1 (ELISA-NS1) đã được sử dụng để phát hiện protein NS1 của virus Dengue, tuy nhiên phương pháp này không thể định týp, sinh phẩm đắt. Phương pháp huyết thanh lọc phát hiện kháng thể bằng kỹ thuật Mac-ELISA, hoặc phân lập virus thường cho kết quả chậm không phù hợp trong chẩn đoán và điều trị, chủ yếu phục vụ cho công tác giám sát dịch tễ.
Kỹ thuật sinh học phân tử Nested RT-PCR, real-time RT-PCR để chẩn đoán virus Dengue đã được phát triển và ứng dụng trong chẩn đoán. Tuy nhiên các phương pháp này vẫn chưa được áp dụng phổ biến và ứng dụng thực tiễn tại Việt Nam do chi phí cao, hạn chế về trang bị và đội ngũ nhân viên làm xét nghiệm. Việc tạo ra một phương pháp phát hiện nhanh, chính xác virus Dengue ở giai đoạn sớm nhiễm bệnh là vô cùng quan trọng và cần thiết, góp phần cho các bác sĩ có thể đưa ra phác đồ điều trị chính xác, hiệu quả và kịp thời bảo đảm sức khỏe cho người bệnh. 1 Xuất phát từ tình hình đó, chúng tôi đã thực hiện đề tài “Nghiên cứu tổng hợp Proteins NS1 virus Dengue ứng dụng phát triển sinh phẩm chẩn đoán” để phục vụ phát triển bộ sinh phẩm chẩn đoán nhanh virus Dengue phù hợp điều kiện tại Việt Nam.
Mục tiêu của đề tài: - Tạo được protein NS1 tái tổ hợp để ứng dụng phát triển kit chẩn đoán nhanh. Nội dung nghiên cứu: - Tách dòng gen mã hóa protein NS1 từ virus Dengue - Tạo cấu trúc biểu hiện tái tổ hợp phù hợp chủng chủ E.coli - Biểu hiện và tinh sạch protein NS1 - Sử dụng NS1 tái tổ hợptạo thử nghiệm que thử phát hiện nhanh kháng thể đặc hiệu virus Dengue từ huyết thanh. 2 Chƣơng I: TỔNG QUAN 1. Tình hình dịch bệnh sốt xuất huyết trên thế giới và tại Việt nam.
Tình hình dịch bệnh sốt xuất huyết trên thế giới. Sốt Dengue (SD), sốt xuất huyết Dengue (SXHD) và hội chứng sốc Dengue (HCSD) là bệnh do virus Denguegây ra, bệnh lây lan từ người sang người, vector truyền bệnh là muỗi Aedes aegypti. Trong suốt nhiều thập kỷ qua, tỉ lệ mắc bệnh SD, SXHD và HCSD vẫn không ngừng tăng lên, hiện nay chưa có vắc xin phòng ngừa cũng như chưa có thuốc đặc trị. Theo Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) hiện tại có khoảng hơn 3.9 tỷ người - chiếm khoảng hơn 40% dân số thế giới, ở các quốc gia có khí hậu nhiệt đới và cận nhiệt đới đang có nguy cơ mắc bệnh SXHD.
Ước tính có tới 390 triệu trường hợp mắc SD mỗi năm trên toàn thế giới.000 trường hợp ca mắc SXHD nghiêm trọng cần phải nhập viện. Trong đó, một tỉ lệ rất lớn(khoảng 90%) là trẻ em dưới 5 tuổi. Và khoảng 5% của các trường hợp nhiễm Dengue bị chết hằng năm[17], [16], [22]. Dịch SD được ghi nhận lần đầu tiên vào năm 1635 tại phía Tây của nước Pháp và đại dịch SXHD được ghi nhận tại Philippines vào những năm 1953-1954 và tại Thái Lan năm 1958 [16].
Trước năm 1970, chỉ có 9 quốc gia xuất hiện dịch SXHD. Ngày nay, SD và SXHD đã ảnh hưởng đến hơn 100 quốc gia và vùng lãnh thổ trên toàn thế giới, trong đó có 20 nước châu Phi, 42 nước Châu Mỹ, 7 nước Đông Nam Á, 4 nước phía đông Địa Trung Hải và 29 nước thuộckhu vực Tây Thái Bình Dương. Đặc biệt, Đông Nam Á và Tây Thái Bình Dương là hai khu vực bị ảnh hưởng nghiêm trọng nhất với hơn 2,3 triệu trường hợp được công bố nhiễm SXHD trong năm 2010 [17]. Hằng năm, có hằng trăm nghìn ca nhiễm SXHD nghiệm trong và có khoảng 20.000 trường hợp tử vong do mắc SXHD[15].
Dịch bệnh sốt xuất huyết đang gia tăng thường xuyên, trong thời kì dịch diễn ra, tỉ lệ mắc bệnh đối với những người trước đây chưa từng tiếp xúc với virus Dengue lên tới 40% đến 50% thậm chí có thể đạt tới 80%90%[16]. Vào năm 2012, dịch SXHD đượcWHO xếp hạng là một trong những bệnh lây truyền qua muỗi đáng phải quan tâm nhất. Dịch bệnh SXHD bùng phát đã gây ra những thiệt hại rất lớn về con người, gây ra những gánh nặng cho hệ thống y tế 3 và nền kinh tế của hầu hết các nước nhiệt đới trên toàn thế giới. Sự xuất hiện và lan truyền của 4 serotype virus Dengue từ châu Á tới châu Mỹ, châu Phi và các vùng Địa Trung Hải đã cho thấy nguy cơ xảy ra một đại dịch toàn cầu [15].1: Các quốc gia và khu vực có nguy cơ bùng phát dịch SXHD trên toàn thế giới, 2012 [17] Trong 50 năm qua, số ca mắc bệnh SXHD đã tăng lên khoảng 30 lần trên toàn cầu, và sự gia tăng mở rộng địa lí của dịch SD tới các quốc gia mới.
Trong giai đoạn mười năm, con số mắc SD/SXHD được báo cáo cho Tổ chức Y tế thế giới tiếp tục tăng theo cấp số nhân. Từ năm 2000 đến năm 2008, số ca mắc SD/SXHD được báo cáo là 1.870, gấp 3,5 lần giai đoạn 1990-1999 (479. Trong năm 2008, có 69 quốc gia có sự hiện diện của SD/SXHD tập trung ở Đông Nam Á, Tây Thái Bình Dương và châu Mỹ [16]. Năm 2008 số ca mắc SD/SXHD được ghi nhận tại Châu Mỹ, Đông Nam Á, Tây Thái Bình Dương đã vượt quá 1,2 triệu và con số này là 2,3 triệu vào năm 2010.
Gần đây, số ca mắc SD/SXHD được báo cáo ngày càng gia tăng. Riêng tại châu Mỹ năm 2010 đã ghi nhận 1,6 triệu trường hợp sốt Dengue trong đó 49.000 trường hợp là sốt Dengue nặng[18]. Không những số ca mắc SD tăng lên hàng năm ở các khu vực đã có SD, mà ngày càng có nhiều khu vực mới có bệnh nhân mắc SD, và con số gia tăng ở tốc độ bùng nổ. Năm 2010 những ca SD đầu tiên được ghi nhận đầu tiên tại Pháp và Croatia.
Năm 2012 trên đảo Madeira của Bồ Đào Nha dịch SXH đã bùng phát với 4 1.800 ca được ghi nhận và thêm năm quốc gia khác của châu Âu cũng ghi nhận những trường hợp xuất hiện SD[17].2: Số lượng các ca mắc SXH được thông báo cho WHO hằng năm 1955-2010 [15] Hình 1.3: Số lượng trung bình các trường hợp mắc SXHD của 30 quốc gia/lãnh thổ có dịch cao nhất, 2004-2010 [15] 5 1. Tình hình dịch SXHD diễn ra tại khu vực Đông Nam Á. Trong số 2,5 tỉ người trên toàn thế giới đang sống trong các quốc gia và khu vực có nguy cơ mắc SXHD thì có khoảng 1,3 tỉ người sống ở khu vực Đông Nam Á [16]. Kể từ năm 2000, dịch SXHD đã lan rộng tới nhiều quốc gia trong khu vực này, năm 2003 chỉ có 8 quốc gia gồm Bangladesh, Ấn Độ,Indonesia, Maldives, Myanmar, Sri Lanka, Thái Lan và Timor-Leste có dịch SXHD nhưng đến năm 2009 thì tất cả các quốc gia trong khu vực đều đã xuất hiện các trường hợp nhiễm SD [18].
Các quốc gia trong vùng Đông Nam Á được chia thành 4 vùng khí hậu riêng biệt với khả năng lan truyền bệnh SXHD khác nhau. Dịch SXHD là một trong những các vấn đề quan trọng đối với sức khỏe của người dân ở các quốc gia như Indonesia, Myanmar, Sri Lanka, Thái Lan, Timor-Leste, nơi có khí hậu nhiệt đới gió mùa và cũng là vùng xích đạo nơi nuỗi Aedes aegypti phổ biến từ thành thị cho tới nông thôn, ở đây có nhiều serotype virus lưu hành và SXHD là một trong những nguyền nhân hàng đầu gây nhập viện cũng như gây ra các ca tử vong ở trẻ em [18]. Theo báo cáo của WHO cho thấy, tỉ lệ các ca tử vong ở trong khu vực này xấp xỉ khoảng 1%, nhưng ở Ấn Độ, Indonesia và Myanmar. Dịch bệnh xảy ra ở các khu vực cách xa các vùng thành thị thì tỉ lệ các ca tử vong có thể lên tới 3-5% [18].
Tại Indonesia, nơi hơn 35% dân số sống ở các khu vực thành thị, đã có 150.000 ca mắc SXHD vào năm 2007 với hơn 25.000 trường hợp được xác nhận là từ thủ đô Jakarta và Đông Java. Tỉ lệ tử vong đạt xấp xỉ 1% [18]. Tại Thái Lan, dịch SXHD được xảy ra trên cả 4 vùng: phía Bắc, vùng Trung tâm, Đông Bắc và phía Nam. Trong tháng 6 năm 2007, dịch bệnh bùng phát ở các tỉnh: Trat, Bangkok, Chiangrai, Phetchabun, Phitsanulok, Khamkaeng Phet, Nakhon Sawan và Phit Chit.
Tổng số ca mắc SXHD được báo cáo từ tháng 1 đến tháng 11 năm 2007 là 58.836 trường hợp, tỉ lệ tử vong tại Thái Lan là 0,2% [18].4: Số ca mắc SXHD và tỉ lệ tử vong do SXHD của các quốc gia thuộc vùng Đông Nam Á, 1985-2009[16] 1. Tình hình dịch bệnh SXHD diễn ra tại Việt Nam Việt Nam là một trong những quốc gia nằm trong vùng dịch tễ lan truyền của virus Dengue.Theo WHO, Việt Nam là quốc gia đứng thứ 3 trên toàn thế giới về số ca mắc SXH (Hình 1. SXHD xuất hiện ở Việt Nam từ 1959 kể từ đó đến nay SXH đã gây nhiều ca tử vong, cũng như các trường hợp phải nhập viện, đặc biệt là ở trẻ em tại miền Nam Việt Nam.