Đ¾I HàC HU¾ TR£âNG Đ¾I HàC KHOA HàC NGUYÄN THÞ ANH TH£ NGHIÊN CỨU TẠO DÒNG VÀ TÞI ƯU ĐIỀU KIỆN BIỂU HIỆN GEN Mà HÓA NATTOKINASE TRONG Bacillus subtilis BD170 TÁI TÞ HỢP LUÀN ÁN TI¾N S) CÔNG NGHÆ SINH HàC HU¾, 2024 Đ¾I HàC HU¾ TR£âNG Đ¾I HàC KHOA HàC NGUYÄN THÞ ANH TH£ NGHIÊN CỨU TẠO DÒNG VÀ TÞI ƯU ĐIỀU KIỆN BIỂU HIỆN GEN Mà HÓA NATTOKINASE TRONG Bacillus subtilis BD170 TÁI TÞ HỢP LUÀN ÁN TI¾N S) CÔNG NGHÆ SINH HàC Ngành: CÔNG NGHÆ SINH HàC Mã sá: 9 42 02 01 Ng¤ãi h¤áng d¿n Khoa hác: GS. NGUYÄN HOÀNG LÞC HU¾, 2024 i Lời Cảm Ơn Trong sußt thßi gian hßc t¿p và hoàn thành lu¿n án, em ã nh¿n ±ÿc rçt nhißu sÿ quan tåm, giúp ÿ cÿa quý ban lãnh äo, quý thæy cô giáo, quý ßng nghißp và các anh chß hßc viên và sinh viên. Em xin chân thành câm ¡n sÿ giúp ÿ quý giá ó. ặc bißt, em xin bày tô lòng bi¿t ¡n chån thành và lßi câm ¡n såu sắc ¿n Thæy giáo GS.
Nguyßn Hoàng Lßc ã t¿n tình chỉ bâo và nh¿n näi vßi em trong sußt quá trình làm lu¿n án, ã giúp ÿ em hoàn thành lu¿n án này. N¿u không có sÿ giúp ÿ cÿa thæy, th¿t sÿ em không thß có ±ÿc nh± ngày hôm nay. Em xin câm ¡n các thæy cô giáo täi bß môn Công nghß Sinh hßc, tr±ßng äi hßc Khoa hßc, äi hßc Hu¿ ã nhißt tình giúp ÿ em thÿc hißn ß tài, ã ßng viên em chån thành và æy cßi mß ngay tÿ nhÿng ngày æu tiên. Em xin cám ¡n phòng ào täo Sau äi hßc tr±ßng äi hßc Khoa hßc, äi hßc Hu¿ ã có nhißu giúp ÿ quý báu, täo mßi ißu kißn tßt nhçt ß em hoàn thành lu¿n án này.
Em mußn gÿi lßi câm ¡n ¿n Thæy giáo TS. Nguyßn Minh Trí, Thæy ã giúp ÿ em rçt nhißu trong vißc hoàn thành các thÿ tÿc hß s¡ giçy tß ß em có thß bâo vß thành công lu¿n án. Em xin gÿi lßi câm ¡n ¿n Ban Giám ßc, Ban ào täo và Công tác Sinh viên äi hßc Hu¿; Ban Giám hißu, Phòng Tß chÿc Hành chính và Thanh tra Pháp ch¿, quý ßng nghißp Khoa C¡ bân, Tr±ßng äi hßc Y - D±ÿc, äi hßc Hu¿ ã luôn täo nhÿng ißu kißn tßt nhçt ß em có ißu kißn hoàn thành lu¿n án này. Tôi xin chån thành cám ¡n các bän hßc viên, sinh viên ngành Công nghß Sinh hßc ã hß trÿ rçt nhißu trong quá trình thÿc hißn các thí nghißm cÿa lu¿n án, ã ßng hành cùng tôi sußt thßi gian làm lu¿n án.
Con xin gÿi ¿n ba m¿ yêu quý cÿa con nhÿng lßi bi¿t ¡n chån thành nhçt. Cám ¡n ba m¿ luôn ß bên cänh con ß chia sẻ, ßng viên con trong nhÿng ngày con làm lu¿n án. Cußi cùng xin gÿi lßi câm ¡n ¿n ng±ßi chßng yêu quý và hai con ã luôn bên cänh ßng viên, khuy¿n khích. Th¿t sÿ åy là nhÿng ßng lÿc to lßn ß tôi có thß i ¿n thành công này.
Mßt læn nÿa xin câm ¡n tçt câ vßi lòng bi¿t ¡n và chån thành nhçt! Thừa Thiên Huế, tháng 2 năm 2024 Nguyễn Thị Anh Thư ii LâI CAM ĐOAN Tôi cam oan ây là công trình nghiên cću cąa riêng tôi. Các sá liáu, kÁt quÁ nêu trong luÁn văn là trung thực và ch¤a tĉng ¤āc ai công bá trong bÃt kỳ công trình nào khác. Ng¤ãi cam đoan NguyÅn Thß Anh Th¤ iii DANH MĀC CHĀ VI¾T TÂT AchE Acetylcholinesterase ADAM10 A Disintegrin and Metalloproteinase Protein 10 ADAM9 A Disintegrin and Metalloproteinase Protein 9 ATP Adenosine triphosphate ATPS Aqueous two-phase system Há hai pha n¤ác BDNF Brain-derived neurotrophic factor YÁu tá thần kinh ngußn gác tĉ não BSA Bovine serum albumin cAMP Cyclic adenosine monophosphate CDS Coding Sequence cs Cßng sự ĐC Đái chćng DEAE Diethylaminoethyl DFP Diisopropyl fluorophosphate EDTA Ethylene diamine triacetic acid ELISA Enzyme-linked immunosorbent assay Kỹ thuÁt sinh hóa ¤āc dùng trong mißn dách học GenBank Ngân hàng Gen GFP Green fluorescent protein HĐC Ho¿t ß chung HĐR Ho¿t ß riêng IGF-1 Insulin-like growth factor-1 YÁu tá tăng tr¤áng giáng Insulin-1 IPTG Isopropyl ³-D-1- iv thiogalactopyranoside JAK1 Janus kinase 1 KLPT Khái l¤āng phân tċ LB Luria Bertani ORF Open reading frame PAI-1 Plasminogen activator inhibitor-1 PBS Phosphate Buffered Saline PCR Polymerase chain reaction PhÁn ćng chuỗi Polymerase PEG polyethylene glycol pI ĐiÅm ẳng ián PMSF Phenylmethylsulfonyl fluoride PP Potassium phosphate RBS Ribosome binding site SBTI Self-Directed Biological Transformation Initiative SDS- Sodium dodecyl-sulfate PAGE polyacrylamide gel electrophoresis Sec SRP Signal recognition particle STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1 TCA Trichloroacetic acid TGF-³ Transforming growth factor beta uPA Urokinase-type plasminogen activator WHO World Health Organization Tá chćc Y tÁ ThÁ giái YPD Yeast peptone dextrose Zymogram Đián di c¢ chÃt v MĀC LĀC Lãi cÁm ¢n. ii LâI CAM ĐOAN.
iii DANH MĀC CHĀ VI¾T TÂT. vi DANH MĀC CÁC BÀNG. ix DANH MĀC CÁC HÌNH. TàNG QUAN TÀI LIÆU.
GIàI THIàU VÂ NATTOKINASE. Ngußn sÁn xuÃt nattokinase. Vi khuẩn Bacillus. Các nguồn sinh vật khác.
Ćng dăng cąa nattokinase. Āng dụng trong chống đông máu. Các āng dụng khác. Hà THàNG BIÄU HIàN Bacillus subtilis.
Vi khuẩn Bacillus subtilis. Há tháng vector biÅu hián á Bacillus. Há tháng tiÁt á Bacillus. ĆNG DĂNG Bacillus subtilis TRONG SÀN XUÂT ENZYME TÁI Tà HĀP.
TINH S¾CH ENZYME BÀNG Hà 2 PHA N£àC. CÃu t¿o và ặc tính cąa há hai pha n¤ác. Ćng dăng há hai pha trong tinh s¿ch enzyme. ĐàI T£þNG VÀ PH£¡NG PHÁP NGHIÊN CĄU.
ĐàI T£ĀNG NGHIÊN CĆU. PH£¡NG PHÁP NGHIÊN CĆU. Phân lÁp gen mã hóa nattokinase tĉ các chąng B. T¿o dòng gen mã hóa nattokinase trong tÁ bào E.
BiÁn n¿p vector pHT43/nat05 và pHT43/natC10 vào Bacillus subtilis BD170. BiÅu hián nattokinase bÁng há tháng vector pHT43. Xác ánh ho¿t tính nattokinase. Ành h¤áng cąa mßt sá yÁu tá lên ho¿t tính phân giÁi fibrin.
Thċ nghiám khÁ năng phân giÁi fibrin trong máu thß bÁng nattokinase tái tá hāp. Tinh s¿ch nattokinase tái tá hāp bÁng há hai pha n¤ác. PHÂN LÀP GEN Mà HÓA NATTOKINASE TĈ CÁC CHĄNG Bacillus subtilis………………………………………………………………………………………. KhuÁch ¿i gen mã hóa nattokinase tĉ các chąng B.
T¿o dòng gen nattokinase giÁ ánh trong vector pCR®2. Xác ánh trình tự gen nattokinase giÁ ánh tĉ các chąng B. T¾O DÒNG GEN nat05 VÀ natC10 TRONG Bacillus subtilis BD170. T¿o dòng gen nat05 và natC10 vào vector pHT43.
BiÁn n¿p vector pHT43 tái tá hāp vào B. BIÄU HIàN NATTOKINASE TÁI Tà HĀP TRONG Bacillus subtilis BD170. subtilis BD170 biÅu hián nattokinase m¿nh. Đặc iÅm cąa nattokinase tái tá hāp á dòng R4.
TINH S¾CH NATTOKINASE BÀNG Hà HAI PHA N£àC. Ành h¤áng cąa khái l¤āng phân tċ PEG. Ành h¤áng cąa nßng ß potassium phosphate. Xác ánh khái l¤āng phân tċ cąa nattokinase tái tá hāp.
PHÂN LÀP GEN MÃ HÓA NATTOKINASE TĈ CÁC CHĄNG Bacillus subtilis. T¾O DÒNG GEN nat05 VÀ natC10 TRONG VECTOR BIÄU HIàN pHT43 70 4. BIÄU HIàN NATTOKINASE TÁI Tà HĀP à Bacilus subtilis. BiÅu hián gen mã hóa nattokinase.
Ành h¤áng cąa mßt sá yÁu tá lên ho¿t tính phân giÁi fibrin. Thċ nghiám khÁ năng phân giÁi c¢ chÃt cąa nattokinase. TINH S¾CH NATTOKINASE BÀNG Hà HAI PHA N£àC. 79 K¾T LUÀN VÀ KI¾N NGHÞ.
81 DANH MĀC CÔNG TRÌNH LIÊN QUAN Đ¾N LUÀN ÁN .82 TÀI LIÆU THAM KHÀO .83 viii DANH MĀC CÁC BÀNG BÁng 1. Mßt sá chąng vi khuẩn Bacillus sÁn xuÃt ¤āc phân lÁp tĉ thực phẩm lên men truyÃn tháng. Ngußn sinh vÁt sÁn xuÃt enzyme thąy phân fibrin. Trình tự các primer dùng Å khuÁch ¿i PCR gen nattokinase tĉ B.
Ho¿t ß protease cąa các dòng B. Ành h¤áng cąa nhiát ß lên ho¿t tính nattokinase cąa Nat05. Ành h¤áng cąa pH lên ho¿t tính nattokinase cąa Nat05. Ành h¤áng cąa các ion kim lo¿i và chÃt ho¿t ßng bà mặt lên ho¿t tính nattokinase cąa Nat05.
Ành h¤áng cąa PEG 2000 và PP 20% Án sự phân tách nattokinase. Ành h¤áng cąa PEG 6000 và PP 20% Án sự phân tách nattokinase. Ành h¤áng cąa PEG 10000 và PP 20% Án sự phân tách nattokinase. Ành h¤áng cąa PP 15% Án sự phân tách nattokinase.
Ành h¤áng cąa PP 25% Án sự phân tách nattokinase. Đß tinh s¿ch và hiáu suÃt thu hßi enzyme khi sċ dăng há hai pha n¤ác cąa B.67 ix DANH MĀC CÁC HÌNH Hình 1. CÃu trúc không gian 3 chiÃu cąa nattokiase. C¢ chÁ ho¿t ßng cąa nattokinase trong cháng ông máu.
Hình Ánh kính hiÅn vi ián tự quét tÁ bào B. S¢ ß biÅu dißn há tháng m¿ng l¤ái các con ¤ßng tiÁt protein cąa B. S¢ ß mô tÁ há tháng tiÁt protein theo con ¤ßng Sec và các thành phần tham gia á B. S¢ ß phân tách quá trình chuyÅn hóa sinh học bÁng há hai pha.
Các giai o¿n phân tách và tinh s¿ch enzyme bÁng há hai pha PEG/muái. S¢ ß bá trí thí nghiám phân tách nattokinase bÁng há 2 pha. KhuÁch ¿i PCR vái cặp mßi NatF và NatR tĉ DNA táng sá. Tinh s¿ch sÁn phẩm PCR.
KiÅm tra khuẩn l¿c mang sÁn phẩm PCR vái cặp mßi ặc hiáu.1 mang gen mã hóa nattokinase. So sánh trình tự cąa các gen nat05 và natC10 phân lÁp ¤āc vái trình tự gen aprN tĉ chąng B. So sánh trình tự amino acid suy dißn cąa các gen phân lÁp ¤āc vái trình tự nattokinase tĉ chąng B. KiÅm tra sự hián dián gen mã hóa nattokinase trong vector pHT43 á chąng vi khuẩn E.
coli TOP10 bÁng phÁn ćng PCR. S¢ ß vector pHT43 mang gen mã hóa nattokinase. KiÅm tra sự hián dián cąa vector pHT43 tái tá hāp trong B. subtilis BD170 bÁng phÁn ćng PCR vái cặp mßi ặc hiáu.
Vòng phân giÁi sữa tách béo cąa các dòng B. subtilis BD170 tái tá hāp khi cÁm ćng IPTG á nßng ß 1 mM. Vòng phân giÁi fibrinogen cąa dòng R4 khi ¤āc cÁm ćng vái IPTG á các nßng ß khác nhau (1-5 mM). Đián di SDS-PAGE (A) và ián di c¢ chÃt (B) cąa dách enzyme ngo¿i bào.
Thċ nghiám khÁ năng phân giÁi căc máu ông thß bÁng enzyme tái tá hāp. Đián di sÁn phẩm tinh s¿ch trên polyacrylamide gel 12%. Đián di sÁn phẩm tinh s¿ch trên polyacrylamide gel có bá sung c¢ chÃt. Tính cÃp thi¿t căa đÁ tài Nhßi máu c¢ tim và các bánh tim m¿ch là những bánh rÃt nghiêm trọng, Ánh h¤áng lán Án sćc khße con ng¤ßi và là nguyên nhân chính gây ßt tċ á ng¤ßi.
Theo tháng kê cąa WHO, khoÁng 17,7 triáu ng¤ßi chÁt mỗi năm trên thÁ giái liên quan Án bánh tim m¿ch, trong ó chą yÁu bánh thiÁu máu căc bß, cao huyÁt áp và các bánh m¿ch máu não. Nhßi máu c¢ tim, ßt quỵ do thiÁu máu, t¿c ngh¿n phái, căc máu ông tĩnh m¿ch là các chćng bánh do rái lo¿n ông máu gây ra.