Chương 1, tác giả đã lược sử Phật giáo Việt Nam từ khởi nguyên đến thế kỷ XIV qua sự du nhập của Phật giáo vào Việt Nam cho đến Phật giáo thời Trần với Thiền phái Trúc Lâm Yên Tử; chương 2, khảo cứu một vài nét thế giới quan Phật giáo theo lịch sử phát triển, từ Phật giáo Nguyên thủy đến Bắc Tông và Nam Tông sau đó khảo sát thế giới quan Phật giáo Việt Nam; chương 3, tìm hiểu nhân sinh quan Phật giáo trên các mặt về con người, về cuộc đời con người. Tác giả khẳng định, tuy Phật giáo phát triển qua các giai đoạn, thời kỳ, tông phái khác nhau nhưng nhân sinh quan Phật giáo ít có thay đổi, về cơ bản vẫn đi theo trục của chính nó, đó là quan niệm của Đức Phật đã chỉ ra. Trên cơ sở đó, tác giả khảo cứu nhân sinh quan Phật giáo Việt Nam. Nguyễn Duy Hinh viết cuốn “Triết học Phật giáo Việt Nam”, nhà xuất bản Văn hóa thông tin và Viện Văn hóa, Hà Nội, 2006.
Phần triết học Phật giáo tác giả trình bày những nội dung bản thể luận Phật giáo, khẳng định Duyên khởi luận là của Phật giáo. Tác giả kết luận bản thể luận Phật giáo phát triển qua hai bước; bước thứ nhất là trước Đại thừa đưa ra thuyết Vô ngã và thuyết Duyên khởi; bước thứ hai là Đại thừa tiếp thu một số tư tưởng Tân Bàlamôn giáo đưa ra A lại da thức, Chân như, Như Lai tạng, Không v. làm bản thể của vạn hữu. Nhận thức luận Phật giáo, tác giả chỉ tập trung nghiên cứu nhận thức luận của Phật giáo Nguyên thủy, nói một cách khác là của thời kỳ trước Đại thừa.
Mục đích nghiên cứu nhận thức luận Phật giáo của tác giả là chỉ nhằm tìm hiểu phương pháp nhận thức của Thích Ca Mầu Ni để quan sát Sinh - Lão - Bệnh - Tử 16 của con người từ đó đưa ra Tứ Diệu Đế. Đối với vấn đề giải thoát luận Phật giáo, tác giả phân tích các luận giải về giải thoát luận của các nhà nghiên cứu trước đó. Theo tác giả, khái quát vấn đề Giải thoát trước Đại thừa dựa trên lý luận về Vô dư Niết Bàn, còn Giải thoát luận Đại thừa dựa trên lý luận Hữu dư Niết Bàn, Đại Niết Bàn, Tịnh Thổ, Cực Lạc Quốc; Giải thoát luận trước Đại thừa hướng đến chủ nghĩa cứu thế tâm cực xuất thế, còn Giải thoát luận Đại thừa hướng đến chủ nghĩa cứu thế tích cực nhập thế. Hai công trình nghiên cứu về triết học Phật giáo Việt Nam nêu trên sẽ là những tri thức cơ bản để nghiên cứu sinh nghiên cứu tư tưởng triết học của Hệ phái Khất sĩ thể hiện qua bộ Chơn Lý.
Mảng công trình nghiên cứu về Phật giáo Việt Nam thứ ba là những mảng viết về hoạt động và những thành tựu của Hệ phái Khất sĩ từ khi gia nhập ngôi nhà Phật giáo Việt Nam (1981) được in trong hai cuốn kỷ yếu nhân 30 năm và 35 năm thành lập Giáo hội Phật giáo Việt Nam. Đó là: Cuốn Giáo hội Phật giáo Việt Nam, Hội đồng Trị sự: Kỷ yếu hội thảo kỷ niệm 30 năm thành lập Giáo hội Phật giáo Việt Nam (1981 - 2011), nhà xuất bản Tôn giáo 2012. Kỷ yếu tập hợp 99 bài viết chia thành 5 cụm chủ đề, trong đó có cụm chủ đề thứ tư: Đặc thù hệ phái Phật giáo Việt Nam. Ở cụm chủ đền này có bài: Ni giới Hệ phái Khất sĩ trong ngôi nhà chung Giáo hội Phật giáo xưa và nay của Ni trưởng Thích Nữ Ngoạt Liên, Ủy viên Hội đồng Trị sự.
Bài viết gồm hai phần: (1) Sơ lược bước trưởng thành của Ni giới của Hệ phái Khất sĩ từ ngày thành lập đến năm 1981; (2) Ni giới Hệ phái Khất sĩ từ 1981 - 2011. Ở phần thứ nhất, bài viết trình bày toát yếu quá trình hình thành và phát triển của Ni giới Hệ phái Khất sĩ. Phần nội dung thứ hai, bài viết đề cập đến một số lĩnh vực hoạt động của Ni giới Khất sĩ như: về tổ chức; về giáo dục; về hoằng pháp; về từ thiện nhân đạo; về đạo pháp; về dân tộc. Bài viết tuy ngắn gọn nhưng bước đầu cung cấp cho luận án những tư liệu quý giá để nghiên cứu về Giáo đoàn Ni thuộc Hệ phái Khất sĩ tại thành phố Hồ Chí Minh.
Cuốn thứ hai: Giáo hội Phật giáo Việt Nam, Viện nghiên cứu Phật học Việt Nam, Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh, Trường Đại học Khoa học Xã hội và Nhân văn: Giáo hội Phật giáo Việt Nam 35 năm hình thành và phát 17 triển, nhà xuất bản Hồng Đức, 2011. Các bài tham luận được tập hợp theo 4 chủ đề được gọi là bốn tiểu ban. Chủ đề 2 cũng là ban 2: Giáo hội Phật giáo Việt Nam: các hệ phái trực thuộc và các hoạt động tiêu biểu. Ở chủ đề 2 đáng chú ý là các bài tham lận liên quan đến Hệ phái Khất sĩ như: “Sự góp phần phát triển Phật giáo Việt Nam của Giáo hội Tăng già Khất sĩ Việt Nam quá khứ, và hiện tại” của Hòa thượng Thích Thiện Nhơn; bài: “Hệ phái Khất sĩ sau 35 năm tham gia Giáo hội Phật giáo Việt Nam” của Đại đức Thích Giác Hoàng; bài “Hệ phái Khất sĩ - 60 năm sau thời Tổ sư Minh Đăng Quang vắng bóng” của Hòa thượng Thích Giác Toàn - Ban thư ký Hệ phái.
Báo cáo tổng kết Hệ phái Khất sĩ sau 35 năm tham gia Giáo hội Phật giáo Việt Nam. Các bài tham luận tập trung làm rõ vai trò của Hệ phái Khất sĩ trong ngôi nhà chung của Giáo hội Phật giáo Việt Nam; và những thành tựu đạt được của Hệ phái Khất sĩ trên các lĩnh vực: giáo dục, hoằng pháp, tu tập, kiến thức hoạt động từ thiện xã hội. Những bài tham luận trên cung cấp cho luận án những tư liệu quý giá khi viết về Hệ phái Khất sĩ. Mảng nghiên cứu về Phật giáo Việt Nam thứ tư nghiên cứu về Ni giới.
Có thể kể đến hai cuốn sách sau: Nhiều tác giả: Nữ giới Phật giáo Việt Nam: Truyền thống và hiện đại, nhà xuất bản Đại học Quốc gia, thành phố Hồ Chí Minh, 2016. Cuốn sách tập hợp các bài tham luận của một hội thảo khoa học: Nữ giới Phật giáo Việt Nam: Truyền thống và hiện đại, tổ chức tại thành phố Hồ Chí Minh ngày 08 và ngày 09 tháng 4 năm 2016, cuốn sách gồm ba phần: Phần một; vấn đề nữ giới trong giáo lý tư tưởng, trong giới luật và trong tổ chức Giáo hội Phật giáo từ nguyên thủy đến hiện đại. Phần hai; vấn đề vai trò, vị thế và cống hiến của Ni giới Phật giáo trong lịch sử Việt Nam. Phần ba; Ni giới Phật giáo Việt Nam trong đời sống và trong công tác xã hội hiện nay.
Ở phần nội dung thứ ba có hai bài tham luận liên quan đến Ni giới Hệ phái Khất sĩ. Bài: “Ni trưởng Huỳnh Liên - công dân xuất sắc của thế giới cực lạc”, của Thích Nữ Khiêm Liên, và bài: “Sự hình thành, phát triển và những đóng góp của Ni giới Hệ phái Khất sĩ” của Thích Giác Duyên. Nếu như bài tham luận của Thích Nữ Khiêm Liên tập trung viết về một nhân vật - Ni trưởng Huỳnh 18 Liên thì bài thứ hai của Thượng tọa Tiến sĩ Thích Giác Duyên đề cập một cách tổng thể quá trình hình thành Ni giới Hệ phái Khất sĩ thời Tổ sư Minh Đăng Quang, sự hình thành và phát triển các đoàn Ni giới Hệ phái Khất sĩ; một số hoạt động và thành tựu của Giáo đoàn Ni thuộc Hệ phái Khất sĩ đạt được trên một số lĩnh vực như tu học; tham gia tổ chức đại lễ tổ chức đại giới đàn; các khóa tu truyền thống. Cuốn sách thứ hai: Giáo hội Phật giáo Việt Nam: Tưởng niệm Đức thành Tổ Ni Kiều - Đàm - Di (Mahap rajàpati Gautamì), nhà xuất bản Hồng Đức, 2018.
Cuốn sách là tập hợp các bài viết về Tổ Ni Kiều Đàm Di, về hoạt động của Ni giới một số tỉnh thành. Trong đó đáng chú ý là bài: Cúng dường cao thượng của Tỳ kheo Ni Xuân Liên - Tịnh xá Ngọc Tuệ, Long Thành, Đồng Nai có phần nội dung viết về cố Ni trưởng Huỳnh Liên “Chư Ni tiền bối Phật giáo Việt Nam hiến công). Đó còn là bài viết mang tựa đề: Công hạnh và đạo nghiệp Ni trưởng Siêu Liên (1937 - 2008), ký tên: Ni chúng Tịnh xá Ngọc Long, Xuân Hòa, Xuân Lộc, Đồng Nai. Hai bài viết tuy ngắn nhưng qua đó nghiên cứu sinh nhận biết toát yếu về vai trò của hai cố Ni trưởng, trong đó có cố Ni trưởng Huỳnh Liên.
Các công trình nghiên cứu về Hệ phái Khất sĩ và Ni giới Hệ phái Khất sĩ Mặc dù là Hệ phái “sinh sau đẻ muộn” nhưng cho đến nay nghiên cứu về Hệ phái Khất sĩ cũng như Ni giới Khất sĩ là tương đối phong phú. Như phong phú về thể loại có thể là các công trình nghiên cứu, bài viết cũng có khi là các học giả ngoài Hệ phái (giáo sĩ hoặc các nhà nghiên cứu). Đặc biệt là sự phong phú về nội dung đề tài như viết vịch sử Hệ phái, lịch sử Ni đoàn, về các hoạt động tôn giáo và hoạt động hướng đến xã hội của Hệ phái; về giáo dục, luật nghi về đời sống tu tập. Do vậy, nghiên cứu sinh chỉ đề cập đến một số công trình, bài viết cơ bản sau đây Tác phẩm “Tìm hiểu về Hệ phái Khất sĩ” của Thích Giác Duyên, năm 2014 tái bản có sửa chữa, bổ sung với tên gọi “Hệ phái Khất sĩ – 70 năm hình thành và phát triển” là tác phẩm nghiên cứu tổng quan khá đầy đủ về Hệ phái Khất sĩ.
Tác giả đã tổng hợp nhiều tài liệu, văn bản của Hệ phái và các giáo đoàn, tập hợp nhiều tư liệu nghiên cứu lịch sử qua lời kể và nghiên cứu thực địa để khái quát 19 về mọi khía cạnh của Hệ phái Khất sĩ một cách có hệ thống, bao gồm: sự hình thành Hệ phái Khất sĩ, sự hình thành và phát triển của các Giáo đoàn và Hệ phái Khất sĩ, giáo lý tư tưởng, những nét đặc thù, những hoạt động tiêu biểu của Hệ phái Khất sĩ trong giai đoạn hiện nay, định hướng trong tương lai. Không chỉ nghiên cứu về lịch sử hệ phái, giáo lý tư tưởng, nét đặc trưng, tác giả còn tìm hiểu chi tiết về các hoạt động hiện tại của hệ phái, các công trình xây dựng lớn, tổ chức các khóa tu, giới đàn, đại lễ, các phương tiện truyền đạo hiện đại bằng báo chí hay internet. Nhìn chung, đây là một công trình nghiên cứu chi tiết, khá đầy đủ về mặt số liệu.